Введение. НИИ эпидемиологии и микробиологии, носящий имя Г.П. Сомова (1917–2009), доктора медицинских наук, профессора, академика Российской академии медицинских наук, выдающегося советского и российского эпидемиолога и микробиолога, был основан в мае 1941 года. Вот уже 80 лет в социально-экономическом развитии Приморского края большую роль играет НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова, обеспечивая биологическую безопасность на юге Дальнего Востока, где распространены крупнейшие очаги природно0очаговых инфекций. Цель: представить основные этапы становления и 80-летней деятельности НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова (г. Владивосток), неразрывно связанной с историей развития отечественного здравоохранения и медицинской науки. Новый этап в деятельности НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова (далее – Институт) начался в сентябре 2020 г., когда распоряжением Правительства Российской Федерации России № 2276р от 07.09.2020 учреждение было передано в ведение Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Материалы и методы. Поиск источников проводился в ресурсах архива НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора, Государственного архива Приморского края, архива г. Владивостока, базах данных Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Springer и Google Scholar. Использовались планы и отчеты НИР, протоколы ученого совета, приказы, документы кадрового делопроизводства. Глубина поиска – 1928–2020 гг. Результаты. Описана роль Института в развитии отечественной эпидемиологии, показана связь с историей санитарно-эпидемиологической службы Приморского края, отражены основные достижения фундаментальных и прикладных исследований в целях обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения нашей страны. Приведены биографические сведения о ведущих ученых и руководителях Института, их участии в разработке теоретических и практических аспектов эпидемиологии, микробиологии и иммунологии. Отражены основные направления развития Института в ближне0 и среднесрочной перспективе, предусматривающие переформатирование его структуры и корректировку научных планов. Выводы. Вступая в новую фазу своего развития с солидным багажом научно-исследовательских разработок, Институт планирует развивать перспективные исследования в соответствии с целями Концепции научного обеспечения органов и организаций Роспотребнадзора до 2025 года в рамках реализации новой отраслевой программы «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации». Задачи, которые ставит перед собой Институт, направлены на укрепление его позиции как одного из ключевых элементов научного обеспечения биологической безопасности на юге российского Дальнего Востока.
Введение. В статье проанализирован ход научных исследований, приведших к открытию вирусов клещевого (Amarillovirales: Flaviviridae, Flavivirus) и японского (Amarillovirales: Flaviviridae, Flavivirus) энцефалитов, на модели которых были впервые сформулированы основные положения функционирования природных очагов трансмиссивных инфекций. Материалы и методы. Поиск источников проводился в Государственном архиве Приморского края, архиве г. Владивостока, базах данных Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Springer и Google Scholar. Результаты. Во второй половине 1930х годов уссурийская тайга стала своеобразной «колыбелью» концепции природной очаговости, сформулированной академиком Евгением Никаноровичем Павловским в 1939 г. Охватившая первоначально трансмиссивные инфекционные заболевания, эта концепция позже была расширена на область нетрансмиссивных инфекций и сапронозов. Большой вклад в содержательную эволюцию теории сапронозов внёс академик Георгий Павлович Сомов (г. Владивосток). Вывод. Создание в мае 1941 г. предшественника современного НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора стало одним из элементов последовательного укрепления биологической безопасности государства на Дальнем Востоке.
Введение. Открытие на Дальнем Востоке в 1937 г. нового вирусного заболевания – клещевого энцефалита (КЭ) – явилось началом таких исследований на Евразийском континенте. Цель исследования – провести вирусологический и эпидемиологический мониторинг клещевых вирусных инфекций в Приморском крае за 80летний период. Материалы и методы. Выделено несколько сотен штаммов, принадлежащих к вирусам комплекса КЭ (семейство Flaviviridae) и к другим семействам, изучены их биологические, антигенные и молекулярно-генетические характеристики. Результаты. Наиболее полное представление о дальневосточной популяции вируса КЭ получено нами за последние десять лет. Оно основано на полногеномном секвенировании 50 штаммов, изолированных от пациентов с разными клиническими проявлениями инфекции, а также из иксодовых клещей. Установлено, что все штаммы принадлежат к одному дальневосточному субтипу вируса КЭ с тремя кластерами (Oshima-, Sofjin-, Senzhang-). Впервые на Евразийском континенте в 1972 году был выделен вирус Повассан из клещей Haemaphisalis longicornis. Филогенетический анализ на основе полногеномной характеристики штаммов Spassk-9, Nadezdinsk-1991 и Partizansk-2006, а также характеристики 5 фрагментов других штаммов вируса Повассан свидетельствовал о том, что все они относятся к генотипу I вируса Повассан. Впервые дано сравнительное описание трех штаммов Primorye-155-77, Primorye-20-79 и Primorye-185-91 вируса Louping ill. Комплексное изучение выделенного штамма Ozernoe при летальном исходе пациентки позволило впервые идентифицировать клинический случай лиссавирусной инфекции на азиатской территории России. Этот штамм генетически близок и имеет единого предка со штаммом Irkut и отнесен к возбудителям рода Lyssavirus, семейство Rhabdoviridae. Заключение. Выделение высокопатогенного лиссавируса, нескольких вирусов комплекса КЭ свидетельствует о том, что такой вирусологический надзор актуален и его следует продолжать.
Введение. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) – это вирусная природно-очаговая инфекция, которая в настоящее время актуальна для многих стран мира и занимает одно из ведущих мест среди зоонозных вирусных инфекций в Российской Федерации. Цель: представить этапы открытия и изучения ГЛПС – от регистрации военными врачами первых клинических случаев заболевания на востоке нашей страны до современного уровня исследований. Материалы и методы. Была проанализирована научная литература, посвященная открытию ГЛПС и дальнейшему изучению этого природно-очагового заболевания. Результаты. В Российской Федерации открытие многих, актуальных и в настоящее время, природно-очаговых инфекций совпало с началом бурного освоения и развития Дальнего Востока в 1930х годах. Многолетние исследования советских и зарубежных ученых привели к систематизации знаний о вирусной этиологии, клинической картине, патофизиологии и патоморфологии геморрагического нефрозонефрита, а также к изоляции возбудителя ГЛПС – вируса Хантаан (Lee H.W., 1978). Всемирно известные отечественные вирусологи А.А. Смородинцев и М.П. Чумаков, дальневосточные ученые, врачи, сотрудники Роспотребнадзора внесли существенный вклад в изучение этиологии, терминологической состоятельности, эпидемиологии и эпизоотологии ГЛПС. Заключение. В настоящее время изучение различных аспектов хантавирусных инфекций является одним из научных направлений деятельности ФГБНУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова» Роспотребнадзора: продолжаются исследования по раскрытию механизмов функционирования природных очагов ортохантавирусов на разных фазах популяционных циклов их основных носителей и в разных ландшафтных зонах российского Дальнего Востока, ведется постоянный поиск новых видов ортохантавирусов и их природных резервуаров, новых биологически активных веществ природного и синтетического происхождения, обладающих противовирусным действием в отношении ортохантавирусов.
Введение. До 1950х годов псевдотуберкулез у человека был известен в мире как спорадическое заболевание, протекавшее с клиникой аппендикулярного синдрома. С I959 года во Владивостоке впервые зарегистрирована вспышка ранее неизвестной болезни, получившей название дальневосточной скарлатиноподобной лихорадки (ДСЛ). Цель – обзор и основные итоги наиболее значимых достижений Научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова в области изучения ДСЛ как особого клиникоэпидемического проявления псевдотуберкулеза в России. Материалы и методы. Приоритетные данные получены на основе микробиологических, эпидемиологических, молекулярно-генетических, а также патоморфологических и электронно-микроскопических исследований материала от больных ДСЛ людей и экспериментальных животных, зараженных штаммами Yersinia pseudotuberculosis с разной плазмидной характеристикой. Результаты. Доказано, что возбудитель ДСЛ является особым клоном Y. рseudotuberculosis, имеющим определенный плазмидный профиль pVM82, pYV 48 MDa, сиквенстип (2ST) и 1й аллель гена yadA. Возбудителю ДСЛ свойственно явление психрофильности, заключающееся в его способности размножаться в окружающей среде с ее биологически низкой и изменяющейся температурой (4–12 °С), при которой происходит накопление возбудителя с сохранением или повышением его вирулентности, что обеспечивает возникновение эпидемического процесса. Охарактеризованы главные генетико-биохимические механизмы адаптации Y. pseudotuberculosis к изменяющимся условиям окружающей среды, а также раскрыты морфологические проявления адаптационной изменчивости этих бактерий в разных условиях их обитания. Представлены основные особенности патогенеза и морфогенеза ДСЛ, в том числе связанные с плазмидной характеристикой и токсигенностью Y. pseudotuberculosis. Заключение. В настоящее время эпидемический процесс псевдотуберкулеза/ДСЛ характеризуется снижением удельного веса вспышечной заболеваемости и преобладанием спорадических случаев. Актуальность дальнейших исследований связана с изучением дормантных форм Y. pseudotuberculosis и формированием представлений о псевдотуберкулезе как персистентной инфекции.
Введение. После долгого периода непризнания сапронозы и сапрозоонозы заняли полноправное место в классификации инфекционных болезней. Между тем эволюционно сложившиеся особенности этих инфекций остаются не до конца изученными. Выявляются новые факты, связанные со спецификой их циркуляции как во внешней среде, так и в организме теплокровных, изучаются возможности существования в организме гидробионтов и растений, формирование некультивируемых форм и т. д. Однако в последнее время исследователи все большее внимание обращают на возможности микроорганизмов существовать в определенных консорциумах, взаимодействуя с микроорганизмами других видов. В этом плане исследования по проблеме сапронозов пока остаются немногочисленными. Цель работы: в модельных экспериментах оценить способность сапротрофных бактерий, выделенных из почвы и морской среды, формировать поликультуральные биопленки с Listeria monocytogenes, относимой к сапронозам, и определить характер их взаимодействия. Материалы и методы. Исследования проводили в 2017–2019 гг., используя музейные штаммы разных вариантов Listeria monocytogenes из коллекции НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова и сапрофитические бактерии, выделенные из морской среды и почвы. Биопленки изучали спектрофотометрическим методом, численность жизнеспособных клеток определяли числом колониеобразующих единиц в 1 мл (КОЕ/мл). Результаты исследования показали, что бактерии смешанного микробного сообщества, живущего в биопленке, могут взаимодействовать друг с другом путем конкуренции либо сотрудничества. Вывод. Сотрудничество между разными штаммами микроорганизмов, находящихся в почве или морской среде, может способствовать лучшей адаптации и выживаемости L. monocytogenes, представляющих потенциальную опасность для населения. Данный факт отражает эпидемиологическую значимость морской и почвенной среды.
Введение. Юг российского Дальнего Востока включает Амурскую область, Еврейскую автономную область, Хабаровский и Приморский края и уникален по богатству паразитофауны. Исторически сложилось так, что в регионе сформировались идеальные условия для существования разнообразных очагов паразитарных инфекций. Цель. Дать краткое описание истории паразитологических исследований, проводившихся на юге Дальнего Востока России с первой половины XX века, и показать их актуальность. Материалы и методы. Анализ литературных источников выполнялся, в том числе, в базах данных Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Springer и Google Scholar. Результаты. В большей степени было изучено видовое разнообразие трематод, в меньшей – цестод, нематод, высших и низших моногеней. Накопленные знания являются основополагающими для понимания степени распространения и патогенности гельминтов, однако современные паразитологические исследования характеризуются высоким уровнем междисциплинарности и интегративности. Уже недостаточно просто систематизировать паразитов, необходимо охарактеризовать молекулярные механизмы, лежащие в основе патогенеза, антигенной изменчивости, лекарственной устойчивости. В статье рассматриваются перспективы дальнейших исследований биологии эндо и эктопаразитов, их взаимоотношений в системе «паразит – хозяин» и связях на разных уровнях организации: биоценотическом, популяционном и организменном, дополняющих теоретические данные о процессах микроэволюции и коэволюции патогена и хозяина. Вывод. Имеющиеся проблемы могут быть решены с использованием протеомных, геномных, транскриптомных и биоинформатических подходов, способствующих лучшему пониманию биологии объектов и являющихся многообещающими в отношении идентификации клинически важных биологических характеристик паразитических организмов.
Введение. Сальмонеллезная инфекция занимает лидирующие позиции в структуре острых кишечных инфекций, вызванных бактериальными патогенами. В последние годы в связи с развитием молекулярно-генетических методов и внедрением технологий компьютерной обработки полученных данных особое значение приобретает совершенствование системы эпидемиологического надзора в соответствии с мировыми научными достижениями. Цель исследования. В настоящем обзоре представлены историческая справка по развитию молекулярно-генетических методов и компьютерных технологий в изучении сальмонеллезной инфекции и современное положение в изучении данного вопроса в Российской Федерации на примере Научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Г.П. Сомова Роспотребнадзора – одного из ведущих российских центров по изучению сальмонелл. Материалы и методы. Использовались базы данных лаборатории молекулярной эпидемиологии НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора, базы данных Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Springer и Google Scholar. Результаты. Со второй половины 1980х годов был введен в практическое использование метод анализа плазмидных ДНК бактерий рода Salmonella. С 1990 года данный метод является основой микробиологического молекулярногенетического мониторинга за возбудителями сальмонеллеза. География исследуемых штаммов, в 1990х годах охватывавшая только Приморский край, в 2000х годах выросла до Дальневосточного и Сибирского федеральных округов Российской Федерации. Исследования, проведенные в лаборатории молекулярной эпидемиологии, позволили усовершенствовать систему эпидемиологического надзора за возбудителем сальмонеллеза на Дальнем Востоке и выявить структуру популяции сальмонелл на основе метода анализа плазмид, содержащихся в штаммах Salmonella. Заключение. Таким образом, в процессе проводимых исследований был решен ряд вопросов, относящихся к микробиологии, эпидемиологии, клинике и профилактике сальмонеллезной инфекции. Рассмотрены перспективы развития молекулярно-генетических методов и компьютерных технологий в изучении сальмонеллезной инфекции в системе эпидемиологического надзора в Российской Федерации. Подчеркивается особое значение полногеномного секвенирования как нового «золотого стандарта» в молекулярной эпидемиологии.
Введение. Появление и рост бактериальных штаммов с множественной лекарственной устойчивостью в последние десятилетия связаны с широким и бесконтрольным использованием антибиотиков, а также снижением количества результативных исследований и открытий новых классов антибактериальных препаратов. Эти тревожные тенденции признаются одной из серьезных угроз для глобального общественного здравоохранения. Они стимулируют и повышают актуальность масштабного поиска и изучения новых антимикробных стратегий, альтернативных традиционной антибиотикотерапии. Целью обзора является критический разбор преимуществ и ограничений современных антимикробных платформ с акцентом на инновационных технологиях использования наночастиц для прямого или опосредованного воздействия на патогенные бактерии, в том числе тех, которые обладают мультиустойчивостью к традиционным антибиотическим препаратам. Материалы и методы. Поиск источников проводился в ресурсах Кокрановской библиотеки (директория Wiley Online Library), EMBASE (EMBASE.com), CINAHL, Web of Science. Глубина поиска – 2017–2021 гг. Результаты исследования. Значительная часть положительных терапевтических эффектов для диагностики и лечения инфекций была получена в результате реализации принципиально новых механизмов антимикробного действия наноразмерных частиц и других наноматериалов. Оценивая будущие перспективы нанотехнологий в качестве наиболее динамично и активно развивающейся в последние годы антимикробной стратегии, следует сделать вывод, что эти инновационные платформы, безусловно, заслуживают пристального внимания и дальнейшего изучения в качестве альтернативного средства профилактики и лечения бактериальных инфекций. Основным ограничением для клинического использования современных наноматериалов является необходимость дальнейшей оценки их безопасности и цитотоксичности. Заключение. Борьба с устойчивостью к антибиотикам требует совместных действий общественных и государственных институтов. Разработка безопасных и эффективных антибактериальных технологий должна сочетаться с принятием международной программы жесткого регламентирования и строгих мер контроля за обоснованностью и рациональным использованием антибиотиков и других антибактериальных препаратов в медицине, косметологии, сельскохозяйственном производстве.
Введение. С 70-х годов XX века в лаборатории иммунологии ФГБНУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова» Роспотребнадзора сформировалась и развивается научная школа по управлению системами врожденного и приобретенного иммунитета с использованием биологически активных веществ Дальнего Востока морского происхождения. Особый интерес в качестве потенциальных кандидатов в лекарственные формы представляют биополимеры, составляющие структурную основу живых морских организмов и обеспечивающие многочисленные процессы жизнедеятельности. Цель исследования – подведение итогов многолетних исследований лаборатории иммунологии по изучению биологически активных веществ (БАВ) из морских гидробионтов Тихого океана как основы для разработки лекарственных препаратов с целью профилактики и лечения инфекционных и соматических заболеваний, БАД к пище и продуктов функционального питания. Материалы и методы: были отобраны и проанализированы основные научные работы сотрудников по поисковым электронным базам данных (Web of Science, PubMed, eLIBRARY) согласно ключевым словам. В настоящий обзор включено 46 источников. Результаты. В процессе работы были изучены биологические свойства свыше 500 веществ из различных гидробионтов Тихого океана: беспозвоночных, рыб, водорослей, морских бактерий (поликатионных и полианионных полисахаридов бурых и красных водорослей), пектинов (коллоидных углеводов высокой молекулярной массы и сложного строения), липополисахаридов и полисахаридов из морских протеобактерий, гликопротеинов, протеогликанов, гликолипидов, низкомолекулярных соединений морского происхождения (сульфатированных полиоксистероидов, пептидов, βглюканов, нуклеиновых кислот, комплексов аминокислот, нафтохинонов и спинохромов морских ежей). В результате исследований были получены новые данные об иммуномодулирующих, антибактериальных, антивирусных, противоопухолевых, антиадгезивных, антиэндотоксических, проапоптотических, гепатозащитных, гиполипидемических свойствах БАВ, обоснована возможность конструирования инновационных лекарственных средств на их основе, разработаны экологически безопасные продукты функционального питания и БАД к пище. Выводы. БАВ из морских гидробионтов являются перспективными источниками для разработки новых отечественных лекарственных препаратов.
ISSN 2619-0788 (Online)