Preview
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Новые патогенные вирусы природных очагов Приморья, выделенные за 80­летнюю историю института (обзор вирусологических исследований)

https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-338-5-26-32

Полный текст:

Аннотация

Введение. Открытие на Дальнем Востоке в 1937 г. нового вирусного заболевания – клещевого энцефалита (КЭ) – явилось началом таких исследований на Евразийском континенте. Цель исследования – провести вирусологический и эпидемиологический мониторинг клещевых вирусных инфекций в Приморском крае за 80­летний период. Материалы и методы. Выделено несколько сотен штаммов, принадлежащих к вирусам комплекса КЭ (семейство Flaviviridae) и к другим семействам, изучены их биологические, антигенные и молекулярно-генетические характеристики. Результаты. Наиболее полное представление о дальневосточной популяции вируса КЭ получено нами за последние десять лет. Оно основано на полногеномном секвенировании 50 штаммов, изолированных от пациентов с разными клиническими проявлениями инфекции, а также из иксодовых клещей. Установлено, что все штаммы принадлежат к одному дальневосточному субтипу вируса КЭ с тремя кластерами (Oshima-, Sofjin-, Senzhang-). Впервые на Евразийском континенте в 1972 году был выделен вирус Повассан из клещей Haemaphisalis longicornis. Филогенетический анализ на основе полногеномной характеристики штаммов Spassk-9, Nadezdinsk-1991 и Partizansk-2006, а также характеристики 5 фрагментов других штаммов вируса Повассан свидетельствовал о том, что все они относятся к генотипу I вируса Повассан. Впервые дано сравнительное описание трех штаммов Primorye-155-77, Primorye-20-79 и Primorye-185-91 вируса Louping ill. Комплексное изучение выделенного штамма Ozernoe при летальном исходе пациентки позволило впервые идентифицировать клинический случай лиссавирусной инфекции на азиатской территории России. Этот штамм генетически близок и имеет единого предка со штаммом Irkut и отнесен к возбудителям рода Lyssavirus, семейство Rhabdoviridae. Заключение. Выделение высокопатогенного лиссавируса, нескольких вирусов комплекса КЭ свидетельствует о том, что такой вирусологический надзор актуален и его следует продолжать.

Об авторах

Г. Н. Леонова
ФГБНУ «НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г. П. Сомова» Роспотребнадзора
Россия

Леонова Галина Николаевна – д-р мед. наук., проф., глав. науч. сотр. лаборатории природно-очаговых трансмиссивных инфекций

ул. Сельская, д. 1, г. Владивосток, 690087



С. И. Беликов
ФГБНУ Лимнологический институт РАН
Россия

Беликов Сергей Иванович – д-р биол. наук, проф., глав. науч. сотр.

ул. Улан-Баторская, 3, а/я 278, г. Иркутск, 664033



И. Г. Кондратов
ФГБНУ Лимнологический институт РАН
Россия

Кондратов Илья Геннадьевич – канд. биол. наук, вед. науч. сотр.

ул. Улан-Баторская, 3, а/я 278, г. Иркутск, 664033



Список литературы

1. Зильбер Л.А. Весенний (весенне-летний) эпидемический клещевой энцефалит // Архив биологических наук. 1939. № 32 (56). С. 9–37.

2. Щелканов М.Ю., Громашевский В.Л., Львов Д.К. Роль эколого-вирусологического районирования в прогнозировании влияния климатических изменений на ареалы арбовирусов // Вестник РАМН. 2006. № 2. С. 22–24.

3. Альховский С.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Щетинин А.М., Дерябин П.Г., Самохвалов Е.И. и др. Таксономия вируса Хасан (Khasan, KHAV) – нового вируса рода Phlebovirus (сем. Bunyaviridae), изолированного из клещей Haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) в Приморском крае (Россия) // Вопросы вирусологии. 2013. Т. 58. № 5. С. 15–18.

4. Calisher CH, Karabatsos N, Dalrymple JM, et al. Antigenic relationships between flaviviruses as determined by cross-neutralization tests with polyclonal antisera. J Gen Virol. 1989;70 (Pt 1):37–43. doi: 10.1099/0022-1317-70-1-37

5. Pletnev AG, Yamshchikov VF, Blinov VM. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus. Virology. 1990;174(1):250–63. doi: 10.1016/0042-6822(90)90073-z

6. Leonova GN, Belikov SI, Kondratov IG, Takashima I. Comprehensive assessment of the genetics and virulence of tick-borne encephalitis virus strains isolated from patients with inapparent and clinical forms of the infection in the Russian Far East. Virology. 2013;443(1):89–98. doi: 10.1016/j.virol.2013.04.029

7. Belikov SI, Kondratov IG, Potapova UV, Leonova GN. The relationship between the structure of the tick-borne encephalitis virus strains and their pathogenic properties. PLoS One. 2014;9(4):e94946. doi: 10.1371/journal.pone.0094946

8. Bertrand Y, Töpel M, Elväng A, Melik W, Johansson M. First dating of a recombination event in mammalian tick-borne flaviviruses. PLoS One. 2012;7(2):e31981. doi: 10.1371/journal.pone.0031981

9. Norberg P, Roth A, Bergström T. Genetic recombination of tick-borne flaviviruses among wild-type strains. Virology. 2013;440(2):105–116. doi: 10.1016/j.virol.2013.02.017

10. Bertrand YJK, Johansson M, Norberg P. Revisiting recombination signal in the tick-borne encephalitis virus: A simulation approach. PLoS One. 2016;11(10):e0164435. doi: 10.1371/journal.pone.0164435

11. Vorovitch MF, Kozlovskaya LI, Romanova LIu, Chernokhaeva LL, Ishmukhametov AA, Karganova GG. Genetic description of a tick-borne encephalitis virus strain Sofjin with the longest history as a vaccine strain. Springerрlus. 2015;4:761. doi: 10.1186/s40064-015-1561-y

12. Leonova GN, Belikov SI, Kondratov IG. Characteristics of far eastern strains of tick-borne encephalitis virus. Arch Virol. 2017;162(8):2211–2218. doi: 10.1007/s00705-017-3309-1

13. Chiba N, Iwasaki T, Mizutani T, Kariwa H, Kurata T, Takashima I. Pathogenicity of tick-borne encephalitis virus isolated in Hokkaido, Japan in mouse model. Vaccine. 1999;17(7-8):779–87. doi: 10.1016/s0264-410x(98)00262-x

14. Takashima I, Morita K, Chiba M, et al. A case of tick-borne encephalitis in Japan and isolation of the virus. J Clin Microbiol. 1997;35(8):1943–7. doi: 10.1128/JCM.35.8.1943-1947.1997

15. Takeda T, Ito T, Chiba M, Takahashi K, Niioka T, Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from Ixodes ovatus (Acari: Ixodidae) in Japan. J Med Entomol. 1998;35(3):227–31. doi: 10.1093/jmedent/35.3.227

16. Takeda T, Ito T, Osada M, Takahashi K, Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from wild rodents and seroepizootologic survey in Hokkaido, Japan. Am J Trop Med Hyg. 1999;60(2):287–91. doi: 10.4269/ajtmh.1999.60.287

17. Goto A, Hayasaka D, Yoshii D, Mizutani T, Kariwa H, Takashima I. Genetic and biological comparison of tick-borne encephalitis viruses from Hokkaido and far-eastern Russia. Jpn J Vet Res. 2002;49(4):297–307.

18. Hayasaka D, Suzuki Y, Kariwa H, et al. Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and far-Eastern Russia. J Gen Virol. 1999;80(Pt 12):3127–35. doi: 10.1099/0022-1317-80-12-3127

19. Yoshii K, Song JY, Park SB, Yang J, Schmitt HJ. Tick-borne encephalitis in Japan, Republic of Korea and China. Emerg Microbes Infect. 2017;6(9):е82. doi: 10.1038/emi.2017.69

20. Zhang Y, Si BY, Liu BH, et al. Complete genomic characterization of two tick-borne encephalitis viruses isolated from China. Virus Res. 2012;167(2):310–3. doi: 10.1016/j.virusres.2012.05.015

21. Ternovoi VA, Protopopova EV, Chausov EV, et al. Novel variant of tick-borne encephalitis virus, Russia. Emerg Infect Dis. 2007;13(10):1574–8. doi: 10.3201/eid1310.070158

22. Леонова Г.Н. Динамика эпидемической ситуации по клещевому энцефалиту на Дальнем Востоке // Эпидемиология и вакцинопрофилактика 2015. Т. 14 № 3 (82). С. 17–22.

23. Kovalev SY, Mukhacheva TA, Kokorev VS, Belyaeva IV. Tick-borne encephalitis virus: reference strain Sofjin and problem of its authenticity. Virus Genes. 2012;44(2):217–24. doi: 10.1007/s11262-011-0690-9

24. Левкович Е.Н., Шубладзе А.К., Чумаков М.П. и др. Этиология весенне-летнего эпидемического энцефалита // Архив биологических наук. 1938; 52. № 1. С. 164–183.

25. McLean DM, Donohue WL. Powassan virus: isolation of virus from a fatal case of encephalitis. Can Med Assoc J. 1959;80(9):708–11.

26. Telford 3rd SR, Armstrong PM, Katavolos P, et al. A new tick-borne encephalitis–like virus infecting New England deer ticks, Ixodes dammini. Emerg Infect Dis. 1997;3(2):165–70. doi: 10.3201/eid0302.970209

27. Kuno G, Artsob H, Karabatsos N, Tsuchiya KR, Chang GJ. Genomic sequencing of deer tick virus and phylogeny of Powassan-related viruses of North America. Am J Trop Med Hyg. 2001;65(5):671–6. doi: 10.4269/ajtmh.2001.65.671

28. Ebel GD, Spielman A, Telford SR. Phylogeny of North American Powassan virus. J Gen Virol. 2001;82(Pt 7):1657–1665. doi: 10.1099/0022-1317-82-7-1657

29. Beasley DW, Suderman MT, Holbrook MR, Barrett AD. Nucleotide sequencing and serological evidence that the recently recognized deer tick is a genotype of Powassan virus. Virus Res. 2001;79(1-2):81–89. doi: 10.1016/s0168-1702(01)00330-6

30. Львов Д.К., Леонова Г.Н., Громашевский В.Л., Беликова Н.П., Березина Л.К. Изоляция вируса Повассан из клещей Haemaphysalis neumanni Dönitz, 1905, в Приморском крае // Вопросы вирусологии.1974. № 5. С. 538–541.

31. Леонова Г.Н., Исачкова Л.М., Баранов Н.И., Кругляк С.П. Изучение роли Повассан в этиологической структуре клещевого энцефалита в Приморском крае // Вопросы вирусологии. 1980. № 2. С. 173–176.

32. Leonova GN, Kondratov IG, Ternovoi VA, et al. Characterization of Powassan viruses from Far Eastern Russia. Arch Virol. 2009;154(5):811–20. doi: 10.1007/s00705-009-0376-y

33. Gholam BI, Puksa I, Provias JP. Powassan encephalitis: a case report with neuropathology and literature review. CMAJ. 1999;161(11):1419–22.

34. Ando K, Kuratsuka S, Arima S, Hironaka N, Honda Y, Ishii K. Studies on the viruses isolated during epidemic of Japanese B encephalitis in 1948 in Tokyo area. Kitasato Arch Exp Med. 1952;24(3-4):429–41.

35. Venugopal K, Buckley A, Reid HW, Gould EA. Nucleotide sequence of the envelope glycoprotein of Negishi virus shows very close homology to louping ill virus. Virology. 1992;190(1):515–21. doi: 10.1016/0042-6822(92)91245-p

36. Leonova GN, Kondratov IG, Maystrovskaya OS, Takashima I, Belikov SI. Louping ill virus (LIV) in the Far East. Arch Virol. 2015;160(3):663–73. doi: 10.1007/s00705-014-2310-1

37. Ogawa M, Okubo H, Tsuji Y, Yasui N, Someda K. Chronic progressive encephalitis occurring 13 years after Russian spring-summer encephalitis. J Neurol Sci. 1973;19(3):363–73. doi: 10.1016/0022-510x(73)90100-7

38. Botvinkin AD, Selnikova OP, Antonova LA, Moiseeva AB, Nesterenko EY, Gromashevsky LV. Human rabies case caused from a bat bite in Ukraine. Rab Bull Eur. 2005;29(3):5–7.

39. Kuzmin IV, Hughes GJ, Botvinkin AD, Orciari LA, Rupprecht CE. Phylogenetic relationships of Irkut and West Caucasian bat viruses within the Lyssavirus genus and suggested quantitative criteria based on the N gene sequence for lyssavirus genotype definition. Virus Res. 2005;111(1):28–43. doi: 10.1016/j.virusres.2005.03.008

40. Kuzmin IV, Wu X, Tordo N, Rupprecht CE. Complete genomes of Aravan, Khujand, Irkut and West Caucasian bat viruses, with special attention to the polymerase gene and non-coding regions. Virus Res. 2008;136(1-2):81–90. doi: 10.1016/j.virusres.2008.04.021

41. Fooks AR, McElhinney LM, Pounder DJ, et al. Case report: isolation of a European bad lyssavirus type 2a from a fatal human case of rabies encephalitis. J Med Virol. 2003;71(2):281–9. doi: 10.1002/jmv.10481

42. Tang X, Luo M, Zhang S, Fooks AR, Hu R, Tu C. Pivotal role of dogs in rabies transmission, China. Emerg Infect Dis. 2005;11(12):1970–2. doi: 10.3201/eid1112.050271

43. Leonova GN, Belikov SI, Kondratov IG, et al. A fatal case of bat lyssavirus infection in Prymorye Territory of the Russian Far East. Rab Bull Eur. 2009;33(4):5–8.


Для цитирования:


Леонова Г.Н., Беликов С.И., Кондратов И.Г. Новые патогенные вирусы природных очагов Приморья, выделенные за 80­летнюю историю института (обзор вирусологических исследований). Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;(5):26-32. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-338-5-26-32

For citation:


Leonova G.N., Belikov S.I., Kondratov I.G. New pathogenic viruses of natural foci of Primorye isolated over the 80-year history of the Institute: A review of virological studies. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2021;(5):26-32. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-338-5-26-32

Просмотров: 96


ISSN 2219-5238 (Print)
ISSN 2619-0788 (Online)