Видовой состав микробиоты автобусов внутригородских маршрутов
https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-10-17
Аннотация
Введение. В нормативных документах санитарного законодательства Российской Федерации отсутствует нормирование микробиологических показателей для салонов городского автотранспорта, осуществляющего пассажирские перевозки. Однако на примере крупномасштабных исследований микробиома общественного транспорта, проведенных в разных странах, доказано, что и внешняя среда (остановки и платформы), и внутренняя среда салонов содержат большое количество разнообразных микроорганизмов, на численность которых не оказывают влияния ни температура воздуха, ни длительность маршрута, ни количество пассажиров. Цель работы: изучение видового состава микробиоты рейсовых автобусов, курсирующих по внутригородским маршрутам, и оценка ее структуры с помощью методов синэкологического и эпидемиологического анализа. Материал и методы. Материалом для исследования служили смывы с общедоступных поверхностей салонов автобусов. Всего обследован 41 автобус 16 маршрутов из трех условных групп («нагорная», «заречная» и «межрайонная»). В работе использовали методы классической бактериологии, MALDI TOF массспектрометрии, синэкологического анализа. Результаты и обсуждение. В результате исследования выделено 85 видов микроорганизмов, из них 15 обнаруживались во всех группах маршрутов. Показано, что микробиота автобусов подчиняется тем же экологическим закономерностям, что и природные (естественные) микробиоценозы. Наибольшим количеством видов представлены род Staphylococcus (16), Acinetobacter (11), Bacillus (11), Pseudomonas (8), Pantoea (5). В наибольшем количестве выделялись микроор ганизмы родов Acinetobacter, Enterobacter, Pantoea. Среди 15 общих для трех групп автобусов видов микроорганизмов 60 % являются представителями микробиоты человека. Показано, что в наибольшем количестве микроорганизмы выделяются с тканевых спинок сидений (до 18600 КОЕ/см3), ручек спинок сидений (до 76500 КОЕ/см3), кожаных петельдержателей (до 6400 КОЕ/см3), а также с участков поверхностей с явными загрязнениями (11200 КОЕ/см3). Выводы. Полученные данные свидетельствуют о необходимости нормирования микробиологических показателей и разработки методических указаний по контролю эффективности проводимых дезинфекционных мероприятий в салонах общественного пассажирского автотранспорта.
Об авторах
И. В. БеловаРоссия
Белова Ирина Викторовна – к.м.н., вед. науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции
ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950
А. Г. Точилина
Россия
Точилина Анна Георгиевна – к.б.н., ст. науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции
ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950
И. В. Соловьева
Россия
Соловьева Ирина Владленовна – д.б.н., доцент, вед. науч. сотр. заведующий лабораторией микробиологии ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора
ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950
Д. Б. Гелашвили
Россия
Гелашвили Давид Бежанович – д.б.н., профессор кафедры экологии
просп. Гагарина, д. 23, г. Нижний Новгород, 603950
Н. И. Зазнобина
Россия
Зазнобина Наталья Ивановна – к.б.н., доцент кафедры экологии
просп. Гагарина, д. 23, г. Нижний Новгород, 603950
В. А. Жирнов
Россия
Жирнов Владимир Анатольевич – к.б.н., науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции
ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950
С. Б. Молодцова
Россия
Молодцова Светлана Борисовна – науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции
ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950
Список литературы
1. Белов А.Б., Куликалова Е.С. Сапронозы: экология возбудителей, эпидемиология, терминология и систематика // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016.
2. Hubálek Z. Emerging human infectious diseases: anthroponoses, zoonoses, and sapronoses. Emerg Infect Dis. 2003;9(3):403–404. doi: 10.3201/eid0903.020208
3. Hubálek Z, Rudolf I. Microbial Zoonoses and Sapronoses. Dordrecht: Springer Publ, 2011. doi: 10.1007/978-90-481-9657-9
4. Kuris AM, Lafferty KD, Sokolow SH. Sapronosis: a distinctive type of infectious agent. Trends Parasitol. 2014;30(8):386–393. doi: 10.1016/j.pt.2014.06.006
5. Xu B, Hao J. Air quality inside subway metro indoor environment worldwide: A review. Environ Int. 2017; 107:33–46. doi: 10.1016/j.envint.2017.06.016
6. Fujiyoshi S, Tanaka D, Maruyama F. Transmission of airborne bacteria across built environments and its measurement standards: A review. Front Microbiol. 2017;8:2336. doi: 10.3389/fmicb.2017.02336
7. Dybwad M, Granum PE, Bruheim P, Blatny JM. Characterization of airborne bacteria at an underground subway station. Appl Environ Microbiol. 2012;78(6):1917– 1929. doi: 10.1128/AEM.07212-11
8. HsuT, JoiceR, VallarinoJ, Abu-AliG, HartmannEM, Shafquat A, et al. Urban transit system microbial communities differ by surface type and interaction with humans and the environment. mSystems. 12016;1(3):e00018–16. doi: 10.1128/mSystems.00018-16
9. Hospodsky D, Qian J, Nazaroff WW, Yamamoto N, Bibby K, Rismani-Yazdi H, et al. Human occupancy as a source of indoor airborne bacteria. PLoS One. 2012;7(4):e34867. doi: 10.1371/journal.pone.0034867
10. Брусина Е.Б., Рычагов И.П. Эпидемиология внутрибольничных гнойно-септических инфекций в хирургии. Новосибирск: Наука, 2006. 169 с.
11. Куликалова Е.С., Урбанович Л.Я., Саппо С.Г., Миронова Л.В., Марков Е.Ю., Мальник В.В. и др. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резервации возбудителя в водной окружающей среде // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. №1. С.3–11.
12. Андрюков Б.Г., Сомова Л.М., Тимченко Н.Ф. Эволюция понятия сапронозы и трансформация экологической концепции паразитизма в инфектологии // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. №5. С.119–126. https:// doi.org/10.36233/0372-9311-2017-5-119-126
13. Белов А.Б. Экологические аспекты эпидемиологического надзора за внутрибольничными инфекциями // Сепсис. Вопросы клинической патофизиологии, эпидемиологии, диагностики и интенсивной терапии: материалы межрегиональной научно-практической конференции. Кемерово: Изд-во Кузбассвузиздат, 2006. С.18–27.
14. Брусина Е.Б. Эпидемиология инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, вызванных возбудителями группы сапронозов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015. Т.14. №2. С.50–56. doi: https://doi.org/10.31631/2073-3046-2015-14-2.
15. Conceição T, Diamantino F, Coelho C, Aires-deSousa M. Contamination of public buses with MRSA in Lisbon, Portugal: a possible transmission route of major MRSA clones within the community. PLoS One. 2013;8(11):e77812. doi: 10.1371/journal.pone.0077812
16. Тихонов В.В., Николаева О.В., Пильгун П.А. Оценка численности микроорганизмов в воздухе общественного транспорта Москвы в зимний период // Городские исследования и практики. 2018. Т.3. №3. С.36–47. doi: https://doi.org/10.17323/usp33201836-47
17. AfshinnekooE, MeydanC, ChowdhuryS, JaroudiD, BoyerC, BernsteinN, et al. Geospatial resolution of human and bacterial diversity with city-scale metagenomics. Cell Syst. 2015;1(1):72–87. doi: 10.1016/j.cels.2015.01.001
18. The MetaSUB International Consortium, Mason C, Afshinnekoo E, Ahsannudin S, Ghedin E, Read T, Fraser C, et al. The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report. Microbiome. 2016;4(24):1–14. doi: https://doi.org/10.1186/s40168016-0168-z
19. Klimenko NS, Tyakht AV, Toshchakov SV, Shevchenko MA, Korzhenkov AA, Afshinnekoo E et al. Cooccurrence patterns of bacteria within microbiome of Moscow subway. Comput Struct Biotechnol J. 2020; 18:314–322. doi: 10.1016/j.csbj.2020.01.007
20. Garza DR, Dutilh BE. From cultured to uncultured genome sequences: metagenomics and modeling microbial ecosystems. Cell Mol Life Sci. 2015;72(22):4287–308. doi: 10.1007/s00018-015-2004-1
21. Neelakanta G, Sultana H. The use of metagenomic approaches to analyze changes in microbial communities. Microbiol Insights. 2013;6:37–48. doi: 10.4137/MBI. S10819
22. RobertsonCE, BaumgartnerLK, HarrisJK, PetersonKL, StevensMJ, FrankDN, et al. Culture-independent analysis of aerosol microbiology in a metropolitan subway system. Appl Environ Microbiol. 2013;79(11):3485–93. doi: 10.1128/AEM.00331-13
23. Dingle TC, Butler-Wu SM. MALDI-TOF mass spectrometry for microorganism identification. Clin Lab Med. 2013;33(3):589–609. doi: 10.1016/j.cll.2013.03.001
24. Singhal N, Kumar M, Kanaujia PK, Virdi JS. MALDITOF mass spectrometry: an emerging technology for microbial identification and diagnosis. Front Microbiol. 2015;6:791. doi: 10.3389/fmicb.2015.00791
25. LiY, ShanM, ZhuZ, MaoX, YanM, Chen Y, et al. Application of MALDI-TOF MS to rapid identification of anaerobic bacteria. BMC Infect Dis. 2019;19(1):941. doi: 10.1186/s12879-019-4584-0
26. Strejcek M, Smrhova T, Junkova P, Uhlik O. Whole-cell MALDI-TOF MS versus 16S rRNA gene analysis for identification and dereplication of recurrent bacterial isolates. Front Microbiol. 2018;9:1294. doi: 10.3389/ fmicb.2018.01294
Рецензия
Для цитирования:
Белова И.В., Точилина А.Г., Соловьева И.В., Гелашвили Д.Б., Зазнобина Н.И., Жирнов В.А., Молодцова С.Б. Видовой состав микробиоты автобусов внутригородских маршрутов. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;(4):10-17. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-10-17
For citation:
Belova I.V., Tochilina A.G., Solovyeva I.V., Gelashvili D.B., Zaznobina N.I., Zhirnov V.A., Molodtsova S.B. Species Composition of Microbiota in City Buses. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2021;(4):10-17. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-10-17