Preview

Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО

Расширенный поиск

Распространенность ICE элементов различных типов у V. cholerae

Полный текст:

Аннотация

С помощью виртуальной ПЦР in silico проведен анализ локальной базы данных 395 полногеномных нуклеотидных последовательностей Vibrio cholerae на наличие ICE элемента. Результат свидетельствовал о широком распространении ICE элемента у токсигенных и атоксигенных штаммов Vibrio cholerae серовара Оі. При этом все ICE элементы успешно типировались: три основных типа - «индийский», «мозамбикский» или «SXT». При этом до 40 % атоксигенных штаммов О1 серовара и неО1/неО139 несли ICE элемент. При анализе с помощью ПЦР in vitro коллекции 222 штаммов Vibrio cholerae серовара О1 показано наличие ICE элемента и определены его типы у токсигенных штаммов, выделенных в последние годы на территории Российской Федерации. Все атоксигенные O1, О139 и неО1/неО139 штаммы, выделенные на территории РФ, лишены ICE элемента, что отличает их от штаммов, циркулирующих в эндемичных по холере регионах. Это наблюдение позволяет рассматривать наличие ICE элемента как новый эпидемический маркер «заносных штаммов» атоксигенных холерных вибрионов.

Об авторах

С. О. Водопьянов
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия


А. С. Водопьянов
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия


И. П. Олейников
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия


С. В. Титова
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия


Список литературы

1. Водопьянов А. С. Алгоритм компьютерного VNTR-типирования на основе неполных сиквенсов ДНК штаммов Vibrio cholerae, выделенных на Гаити в 2010 / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников, Б.Н. Мишанькин // Здоровье населения и среда обитания. 2013. № 3 (240). С. 28-31.

2. Водопьянов А.С. и др. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников [и др.] // Здоровье населения и среда обитания 2015. № 5 (266). C. 41-44.

3. Захарова И. Б. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Vibrio cholerae NON-O1/NON-O139, выделенных из балластных вод судов и акватории портов Ростовской области / И.Б. Захарова, С.Ю. Водяницкая, М.В. Подшивалова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни 2015. № 3. C. 47-50.

4. Онищенко Г.Г. и др. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее / Г.Г. Онищенко, Е.Н. Беляев, Э.А. Москвитина [и др.]. Под общей редакцией заслуженного деятеля науки РФ, доктора медицинских наук профессора Г.М. Мединского. Ростов-на-Дону: изд-во «Полиграф», 1995. С. 33-77.

5. Подшивалова М.В. и др. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа / М.В. Подшивалова, Ю.А. Кузютина, И.Б. Захарова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014. № 3. С. 34-39.


Для цитирования:


Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Титова С.В. Распространенность ICE элементов различных типов у V. cholerae. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2018;(1):33-35.

For citation:


Vodop'yanov S.O., Vodop'yanov A.S., Oleynikov I.P., Titova S.V. Prevalence of ice elements of different types in V. cholerae. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2018;(1):33-35. (In Russ.)

Просмотров: 14


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2219-5238 (Print)
ISSN 2619-0788 (Online)