sredobЗдоровье населения и среда обитания – ЗНиСОPublic Health and Life Environment – PH&LE2219-52382619-0788ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзораsredob-319Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYРаспространенность ICE элементов различных типов у V. choleraePrevalence of ice elements of different types in V. choleraeВодопьяновС. О.Vodop'yanovS. O.serge100v@gmail.comВодопьяновА. С.Vodop'yanovA. S.noemail@neicon.ruОлейниковИ. П.OleynikovI. P.noemail@neicon.ruТитоваС. В.TitovaS. V.noemail@neicon.ruФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» РоспотребнадзораРоссияRostov-on-Don Anti-Plague Institute of RospotrebnadzorRussian Federation201819042021013335Copyright © Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Титова С.В., 20212021Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Титова С.В.Vodop'yanov S.O., Vodop'yanov A.S., Oleynikov I.P., Titova S.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/319

С помощью виртуальной ПЦР in silico проведен анализ локальной базы данных 395 полногеномных нуклеотидных последовательностей Vibrio cholerae на наличие ICE элемента. Результат свидетельствовал о широком распространении ICE элемента у токсигенных и атоксигенных штаммов Vibrio cholerae серовара Оі. При этом все ICE элементы успешно типировались: три основных типа - «индийский», «мозамбикский» или «SXT». При этом до 40 % атоксигенных штаммов О1 серовара и неО1/неО139 несли ICE элемент. При анализе с помощью ПЦР in vitro коллекции 222 штаммов Vibrio cholerae серовара О1 показано наличие ICE элемента и определены его типы у токсигенных штаммов, выделенных в последние годы на территории Российской Федерации. Все атоксигенные O1, О139 и неО1/неО139 штаммы, выделенные на территории РФ, лишены ICE элемента, что отличает их от штаммов, циркулирующих в эндемичных по холере регионах. Это наблюдение позволяет рассматривать наличие ICE элемента как новый эпидемический маркер «заносных штаммов» атоксигенных холерных вибрионов.

With the help of a virtual PCR in silico analysis of the local database 395 genome-nucleotide sequences of Vibrio cholerae in the presence of ICE element. The results showed widespread ICE member from toxigenic strains and nontoxigenic Vibrio cholerae O1 serotype. Thus all elements of ICE successfully typed three basic types - «Indian», «Mozambique», or «the SXT». In this case up to 40 % nontoxigenic strains O1 serovar and nonO1/nonO139 carried ICE element. When analyzed by PCR in vitro collection of222 strains of Vibrio cholerae O1 serotype shows the presence of ICE element and determine its type in toxigenic strains isolated in recent years in the Russian Federation. All nontoxigenic O1, O139 and nonO1/nonO139 strains isolated in Russia, deprived of ICE element that differs from strains circulating in endemic cholera areas. This observation allows us to consider the presence of ICE element as a new epidemic marker «of invasive strains of» nontoxigenic Vibrio cholerae.

Vibrio choleraeICE элементПЦРVibrio choleraeICE elementPCRReferencesВодопьянов А. С. Алгоритм компьютерного VNTR-типирования на основе неполных сиквенсов ДНК штаммов Vibrio cholerae, выделенных на Гаити в 2010 / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников, Б.Н. Мишанькин // Здоровье населения и среда обитания. 2013. № 3 (240). С. 28-31.Водопьянов А. С. Алгоритм компьютерного VNTR-типирования на основе неполных сиквенсов ДНК штаммов Vibrio cholerae, выделенных на Гаити в 2010 / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников, Б.Н. Мишанькин // Здоровье населения и среда обитания. 2013. № 3 (240). С. 28-31.Водопьянов А.С. и др. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников [и др.] // Здоровье населения и среда обитания 2015. № 5 (266). C. 41-44.Водопьянов А.С. и др. INDEL- и VNTR-типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных в 2013 году из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников [и др.] // Здоровье населения и среда обитания 2015. № 5 (266). C. 41-44.Захарова И. Б. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Vibrio cholerae NON-O1/NON-O139, выделенных из балластных вод судов и акватории портов Ростовской области / И.Б. Захарова, С.Ю. Водяницкая, М.В. Подшивалова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни 2015. № 3. C. 47-50.Захарова И. Б. и др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Vibrio cholerae NON-O1/NON-O139, выделенных из балластных вод судов и акватории портов Ростовской области / И.Б. Захарова, С.Ю. Водяницкая, М.В. Подшивалова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни 2015. № 3. C. 47-50.Онищенко Г.Г. и др. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее / Г.Г. Онищенко, Е.Н. Беляев, Э.А. Москвитина [и др.]. Под общей редакцией заслуженного деятеля науки РФ, доктора медицинских наук профессора Г.М. Мединского. Ростов-на-Дону: изд-во «Полиграф», 1995. С. 33-77.Онищенко Г.Г. и др. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее / Г.Г. Онищенко, Е.Н. Беляев, Э.А. Москвитина [и др.]. Под общей редакцией заслуженного деятеля науки РФ, доктора медицинских наук профессора Г.М. Мединского. Ростов-на-Дону: изд-во «Полиграф», 1995. С. 33-77.Подшивалова М.В. и др. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа / М.В. Подшивалова, Ю.А. Кузютина, И.Б. Захарова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014. № 3. С. 34-39.Подшивалова М.В. и др. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа / М.В. Подшивалова, Ю.А. Кузютина, И.Б. Захарова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014. № 3. С. 34-39.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.