Эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции и молекулярно-генетическая характеристика ВИЧ-1, циркулирующего на территории Магаданской области

Введение. ВИЧ-инфекция продолжает оставаться одной из важнейших проблем здравоохранения во всем мире. Поскольку высокое генетическое разнообразие ВИЧ и формирование резистентности к антиретровирусным препаратам оказывают отрицательное влияние на достижение цели по искоренению инфекции, важно проводить регулярный мониторинг циркулирующих вариантов ВИЧ-1 на различных территориях.

Цель исследования: проведение эпидемиологического и молекулярно-генетического анализа вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Магаданской области, включая анализ мутаций лекарственной устойчивости.

Материалы и методы. Анализ эпидемиологической обстановки по ВИЧ-инфекции проведен на основании данных, предоставленных территориальным центром по борьбе и профилактике СПИД в Магаданской области, а также сведений Федеральной службы государственной статистики за 2019–2024 гг. Молекулярно-генетический анализ проведен для 39 образцов плазмы крови методом секвенирования по Сэнгеру фрагментов гена pol, кодирующего протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1.

Результаты. В обследованной группе преобладал суб-субтип A6 (87,2 %). Выявлено 2 завозных случая инфицирования субтипом В (5,1 %). В 3 случаях (7,7 %) обнаружена рекомбинантная форма CRF63_02A6. Мутации, ассоциированные с возникновением лекарственной устойчивости к антиретровирусным препаратам выявлены у 1 из 14 пациентов (7,1 %) не имеющих опыта терапии, и у 8 из 25 пациентов (32,0 %), находящихся на терапии.

Заключение. Проведенное исследование показало необходимость широкого внедрения современных молекулярно-генетических методов (секвенирования, филогенетического анализа, биоинформатических методов) в систему эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией на отдельных территориях Российской Федерации.

1. Blassel L, Zhukova A, Villabona-Arenas CJ, Atkins KE, Hué S, Gascuel O. Drug resistance mutations in HIV: New bioinformatics approaches and challenges. Curr Opin Virol. 2021;51:56-64. doi: 10.1016/j.coviro.2021.09.009

2. Ouyang F, Yuan D, Zhai W, Liu S, Zhou Y, Yang H. HIV-1 drug resistance detected by next-generation sequencing among ART-naïve individuals: A systematic review and meta-analysis. Viruses. 2024;16(2):239. doi: 10.3390/v16020239

3. Ожмегова Е.Н., Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ: прежние и современные тенденции // Вопросы вирусологии. 2022. Т. 67. № 3. С. 193-205. doi: 10.36233/0507-4088-113

4. Киреев Д.Е., Кириченко А.А., Акимкин В.Г. Геномный эпидемиологический надзор за ВИЧ-инфекцией в Российской Федерации // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2024. Т. 16. № 4. С. 17-27. doi: 10.22328/2077-9828-2024-16-4-17-27

5. Антонова А.А., Кузнецова А.И., Ожмегова Е.Н. и др. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на современном этапе эпидемии в Российской Федерации: увеличение распространенности рекомбинантных форм // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2023. Т. 15. № 3. С. 61-72. doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-61-72

6. Halikov MR, Ekushov VE, Totmenin AV, et al. Identification of a novel HIV-1 circulating recombinant form CRF157_A6C in Primorsky Territory, Russia. J Infect. 2024;88(2):180-182. doi: 10.1016/j.jinf.2023.11.005

7. Халиков М.Р., Екушов В.Е., Тотменин А.В. и др. Вклад рекомбинационной изменчивости ВИЧ в формирование популяции ВИЧ-1, циркулирующих в Приморском крае // Юг России: экология, развитие. 2023. Т. 18. № 4. С. 125-133. doi: 10.18470/1992-1098-2023-4-125-133

8. Осипова И.П., Тотменин А.В., Берсенев П.Г. и др. Актуальность использования методов молекулярной эпидемиологии ВИЧ для характеристики территориальных эпидемий: Сахалинская область // Юг России: экология, развитие. 2023. Т. 18. № 3. С. 126-132. doi: 10.18470/1992-1098-2023-3-126-132

9. Antonova A, Kazennova E, Lebedev A, et al. Recombinant forms of HIV-1 in the last decade of the epidemic in the Russian Federation. Viruses. 2023;15(12):2312. doi: 10.3390/v15122312

10. Казеннова Е.В., Антонова А.А., Ожмегова Е.Н. и др. Генетический анализ ВИЧ-1 в Алтайском крае: дальнейшее распространение варианта CRF63_02A1 по территории Западной Сибири // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2020. Т. 12. № 1. С. 47-57. doi: 10.22328/2077-9828-2020-12-1-47-57

11. Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Циркулирующие рекомбинантные формы ВИЧ-1 на территориях Дальневосточного федерального округа // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2021. № 40. С. 79-87.

12. Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Еврейской автономной области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2018. Т. 10. № 4. С. 90–99. doi: 10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99

13. Tamura K, Stecher G, Kumar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Mol Biol Evol. 2021;38(7):3022-3027. doi: 10.1093/molbev/msab120

14. Зырянова Д.П., Богачева Н.В., Тотменин А.В. и др. Модели CRF63_02A6 ВИЧ-1 как инструмент для оценки эффективности разрабатываемых антиретровирусных препаратов // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10. № 4. С. 769-774. doi: 10.15789/2220-7619-MHC-1261

15. Sivay MV, Maksimenko LV, Osipova IP, et al. Spatiotemporal dynamics of HIV-1 CRF63_02A6 sub-epidemic. Front Microbiol. 2022;13:946787. doi: 10.3389/fmicb.2022.946787

16. Кузнецова А.И. Роль полиморфизма ВИЧ-1 в патогенезе заболевания // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2023. Т. 15. № 3. С. 26-37. doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-26-37

17. Ожмегова Е.Н., Кузнецова А.И., Лебедев А.В. и др. Эффективность схем АРТ первой линии на основе TDF у ВИЧ-инфицированных пациентов с предсуществующей мутацией A62V в обратной транскриптазе // Вопросы вирусологии. 2024. Т. 69. № 3. С. 231-240. doi: 10.36233/0507-4088-232

18. Щемелев А.Н., Семенов А.В., Останкова Ю.В. и др. Генетическое разнообразие и мутации лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Ленинградской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022. Т. 99. № 1. С. 28–37. doi: 10.36233/0372-9311-216

19. Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Сидорина Ю.Н., Абашина Н.Д., Брусенцева Е.Е., Акимкин В.Г. Пилотное исследование по изучению особенностей распространения резистентных вариантов ВИЧ-1 с помощью молекулярных кластеров. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101. № 5. С. 581–593. doi: https:10.36233/0372-9311-565

20. Парфенова О.В., Пекшева О.Ю., Зайцева Н.Н. Распространение мутаций резистентности и субтипов ВИЧ-1 как показатель динамики эпидемии ВИЧинфекции в Приволжском федеральном округе в 2016–2018 гг. // Здоровье населения и среда обитания. 2019. № 8 (317). С. 50–55. doi: 10.35627/2219-5238/2019-317-8-50-55

21. Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019. № 4. С. 79–90, doi: 10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90

22. Питерский М.В., Гусев А.Г., Ходаков О.А. и др. Разнообразие субтипов, филогенетический анализ и изучение лекарственной устойчивости штаммов ВИЧ-1, циркулирующих в Уральском федеральном округе // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022. Т. 99. № 1. С. 38-53. doi: 10.36233/0372-9311-178

23. Капустин Д.В., Краснова Е.И., Халиков М.Р. и др. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам в Новосибирской области // Терапия. 2022. Т. 8. № 3(55). С. 35-41. doi: 10.18565/therapy.2022.3.35-41

24. Kirichenko A, Kireev D, Lopatukhin A, et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022;17(1):e0257731. doi: 10.1371/journal.pone.0257731

25. Leal SDV, Pimentel V, Gonçalves P, et al. Genetic diversity and antiretroviral resistance in HIV-1-infected patients newly diagnosed in Cabo Verde. Viruses. 2024;16(12):1953. doi: 10.3390/v16121953