<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">sredob</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Public Health and Life Environment – PH&amp;LE</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2219-5238</issn><issn pub-type="epub">2619-0788</issn><publisher><publisher-name>ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.35627/2219-5238/2025-33-12-83-93</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">sredob-2776</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ЭПИДЕМИОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>EPIDEMIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Эпидемиологические особенности ВИЧ-инфекции и молекулярно-генетическая характеристика ВИЧ-1, циркулирующего на территории Магаданской области</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Epidemiological Features of HIV Infection and Molecular Genetic Characteristics of HIV-1 Circulating in the Magadan Region</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-9824-7025</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Котова</surname><given-names>В. О.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kotova</surname><given-names>V. O.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Котова Валерия Олеговна – старший научный сотрудник, заведующая лабораторией эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа.</p><p>Ул. Шевченко, д. 2, Хабаровск, 680610</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Valeriya O. Kotova - Senior Researcher, Head of the Laboratory of Epidemiology and Prevention of Viral Hepatitis and AIDS.</p><p>2 Shevchenko Street, Khabarovsk, 680610</p></bio><email xlink:type="simple">kotova.valeriya@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5695-6752</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Базыкина</surname><given-names>Е. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bazykina</surname><given-names>E. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Базыкина Елена Анатольевна – младший научный сотрудник лаборатории эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа.</p><p>Ул. Шевченко, д. 2, Хабаровск, 680610</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena A. Bazykina - Junior Researcher, Laboratory of Epidemiology and Prevention of Viral Hepatitis and AIDS.</p><p>2 Shevchenko Street, Khabarovsk, 680610</p></bio><email xlink:type="simple">dvaids@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-3209-7623</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Балахонцева</surname><given-names>Л. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Balakhontseva</surname><given-names>L. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Балахонцева Людмила Анатольевна – руководитель Дальневосточного окружного Центра по профилактике и борьбе со СПИД.</p><p>Ул. Шевченко, д. 2, Хабаровск, 680610</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Lyudmila A. Balakhontseva - Head of the Far Eastern Regional Center for AIDS Control and Prevention.</p><p>2 Shevchenko Street, Khabarovsk, 680610</p></bio><email xlink:type="simple">dvaids@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-3050-4472</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Троценко</surname><given-names>О. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Trotsenko</surname><given-names>O. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Троценко Ольга Евгеньевна – д.м.н., директор.</p><p>Ул. Шевченко, д. 2, Хабаровск, 680610</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olga E. Trotsenko - Dr. Sci. (Med.), Director.</p><p>2 Shevchenko Street, Khabarovsk, 680610</p></bio><email xlink:type="simple">adm@hniiem.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0004-9504-2832</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Семенова</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Semenova</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Семенова Елена Викторовна – биолог КДЛ.</p><p>Ул. Попова, д. 7, корп. 2, Магадан, 685007</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena V. Semenova - Biologist, Clinical Diagnostic Laboratory.</p><p>Bldg 2, 7 Popov Street, Magadan, 685007</p></bio><email xlink:type="simple">lien3003@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0009-3786-3372</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Вахнина</surname><given-names>Л. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vakhnina</surname><given-names>L. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Вахнина Лариса Николаевна – заведующая лаборатории.</p><p>Ул. Попова, д. 7, корп. 2, Магадан, 685007</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Larisa N. Vakhnina - Head of the Laboratory.</p><p>Bldg 2, 7 Popov Street, Magadan, 685007</p></bio><email xlink:type="simple">spidlab@49gov.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Журавкова</surname><given-names>О. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zhuravkova</surname><given-names>O. L.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Журавкова Ольга Леонидовна – заведующая ОЛК ЦПБС.</p><p>Ул. Попова, д. 7, корп. 2, Магадан, 685007</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olga L. Zhuravkova - Head of the Medical Advisory Department.</p><p>Bldg 2, 7 Popov Street, Magadan, 685007</p></bio><email xlink:type="simple">olgal.zhuravkova@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff-2"><aff xml:lang="ru"><institution>ГБУЗ «Магаданский областной диспансер фтизиатрии и инфекционных заболеваний»</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Magadan Regional Dispensary of Phthisiology and Infectious Diseases</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2025</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>17</day><month>12</month><year>2025</year></pub-date><volume>33</volume><issue>12</issue><fpage>83</fpage><lpage>93</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Котова В.О., Базыкина Е.А., Балахонцева Л.А., Троценко О.Е., Семенова Е.В., Вахнина Л.Н., Журавкова О.Л., 2025</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Котова В.О., Базыкина Е.А., Балахонцева Л.А., Троценко О.Е., Семенова Е.В., Вахнина Л.Н., Журавкова О.Л.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Kotova V.O., Bazykina E.A., Balakhontseva L.A., Trotsenko O.E., Semenova E.V., Vakhnina L.N., Zhuravkova O.L.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/2776">https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/2776</self-uri><abstract><sec><title>Введение</title><p>Введение. ВИЧ-инфекция продолжает оставаться одной из важнейших проблем здравоохранения во всем мире. Поскольку высокое генетическое разнообразие ВИЧ и формирование резистентности к антиретровирусным препаратам оказывают отрицательное влияние на достижение цели по искоренению инфекции, важно проводить регулярный мониторинг циркулирующих вариантов ВИЧ-1 на различных территориях.</p></sec><sec><title>Цель исследования</title><p>Цель исследования: проведение эпидемиологического и молекулярно-генетического анализа вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Магаданской области, включая анализ мутаций лекарственной устойчивости.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Анализ эпидемиологической обстановки по ВИЧ-инфекции проведен на основании данных, предоставленных территориальным центром по борьбе и профилактике СПИД в Магаданской области, а также сведений Федеральной службы государственной статистики за 2019–2024 гг. Молекулярно-генетический анализ проведен для 39 образцов плазмы крови методом секвенирования по Сэнгеру фрагментов гена pol, кодирующего протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. В обследованной группе преобладал суб-субтип A6 (87,2 %). Выявлено 2 завозных случая инфицирования субтипом В (5,1 %). В 3 случаях (7,7 %) обнаружена рекомбинантная форма CRF63_02A6. Мутации, ассоциированные с возникновением лекарственной устойчивости к антиретровирусным препаратам выявлены у 1 из 14 пациентов (7,1 %) не имеющих опыта терапии, и у 8 из 25 пациентов (32,0 %), находящихся на терапии.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Проведенное исследование показало необходимость широкого внедрения современных молекулярно-генетических методов (секвенирования, филогенетического анализа, биоинформатических методов) в систему эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией на отдельных территориях Российской Федерации.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Introduction</title><p>Introduction: HIV infection remains one of the major public health problems worldwide. Since the high genetic diversity of HIV and the formation of resistance to antiretroviral drugs have a negative impact on achieving the goal of eradicating the infection, it is important to monitor circulating HIV-1 variants on different territories on a regular basis.</p></sec><sec><title>Objective</title><p>Objective: To conduct an epidemiological and molecular genetics analysis of HIV-1 variants circulating in the Magadan Region, including the analysis of drug resistance mutations.</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods: HIV infection rates were analyzed based on data provided by the Center for AIDS Control and Prevention in the Magadan Region and information from the Federal State Statistics Service for 2019–2024. Molecular genetics testing was performed for 39 blood plasma samples using Sanger sequencing of fragments of the pol gene encoding the protease and part of the HIV-1 reverse transcriptase.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results: HIV-1 sub-subtype A6 prevailed in the examined group (87.2 %). We detected two imported cases of subtype B infection (5.1 %) and the recombinant of CRF63_02A6 in three cases (7.7 %). Mutations associated with the development of antiretroviral drug resistance were found in 1 of 14 untreated patients (7.1 %) and in 8 of 25 patients (32.0 %) undergoing therapy.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion: The results highlight the importance of widespread introduction of modern molecular genetics methods (sequencing, phylogenetic analysis, and bioinformatic techniques) into the HIV surveillance system in certain territories of the Russian Federation.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>работа выполнена в рамках НИР «Комплексный подход к совершенствованию системы эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией (в том числе в сочетании с другими социально значимыми инфекциями) в Дальневосточном федеральном округе Российской федерации на основе молекулярно-генетических методов исследования» (Рег. № 121052600116-1)</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>epidemiological analysis</kwd><kwd>HIV infection</kwd><kwd>HIV-1 subtypes</kwd><kwd>phylogenetic analysis</kwd><kwd>drug resistance</kwd><kwd>antiretroviral therapy</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">The study was approved by the decision of the Ethics Committee of the Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor (Protocol No. 10 dated 10/25/2023)</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The study was conducted within the framework of the research “An integrated approach to improving the system of epidemiological surveillance of HIV infection (including in combination with other socially significant infections) in the Far Eastern Federal District of the Russian Federation based on molecular genetics testing” (Registration No. 121052600116-1)</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Blassel L, Zhukova A, Villabona-Arenas CJ, Atkins KE, Hué S, Gascuel O. Drug resistance mutations in HIV: New bioinformatics approaches and challenges. Curr Opin Virol. 2021;51:56-64. doi: 10.1016/j.coviro.2021.09.009</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Blassel L, Zhukova A, Villabona-Arenas CJ, Atkins KE, Hué S, Gascuel O. Drug resistance mutations in HIV: New bioinformatics approaches and challenges. Curr Opin Virol. 2021;51:56-64. doi: 10.1016/j.coviro.2021.09.009</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ouyang F, Yuan D, Zhai W, Liu S, Zhou Y, Yang H. HIV-1 drug resistance detected by next-generation sequencing among ART-naïve individuals: A systematic review and meta-analysis. Viruses. 2024;16(2):239. doi: 10.3390/v16020239</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ouyang F, Yuan D, Zhai W, Liu S, Zhou Y, Yang H. HIV-1 drug resistance detected by next-generation sequencing among ART-naïve individuals: A systematic review and meta-analysis. Viruses. 2024;16(2):239. doi: 10.3390/v16020239</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ожмегова Е.Н., Бобкова М.Р. Лекарственная устойчивость ВИЧ: прежние и современные тенденции // Вопросы вирусологии. 2022. Т. 67. № 3. С. 193-205. doi: 10.36233/0507-4088-113</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ozhmegova EN, Bobkova MR. HIV drug resistance: Past and current trends. Voprosy Virusologii. 2022;67(3):193-205. (In Russ.) doi: 10.36233/0507-4088-113</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Киреев Д.Е., Кириченко А.А., Акимкин В.Г. Геномный эпидемиологический надзор за ВИЧ-инфекцией в Российской Федерации // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2024. Т. 16. № 4. С. 17-27. doi: 10.22328/2077-9828-2024-16-4-17-27</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kireev DE, Kirichenko AA, Akimkin VG. Genomic surveillance of HIV infection in the Russian Federation. VICH-Infektsiya i Immunosupressii. 2024;16(4):17-27. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2024-16-4-17-27</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Антонова А.А., Кузнецова А.И., Ожмегова Е.Н. и др. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на современном этапе эпидемии в Российской Федерации: увеличение распространенности рекомбинантных форм // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2023. Т. 15. № 3. С. 61-72. doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-61-72</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Antonova AA, Kuznetsova AI, Ozhmegova EN, et al. Genetic diversity of HIV-1 at the current stage of the epidemic in the Russian Federation: An increase in the prevalence of recombinant forms. VICH-Infektsiya i Immunosupressii. 2023;15(3):61-72. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-61-72</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Halikov MR, Ekushov VE, Totmenin AV, et al. Identification of a novel HIV-1 circulating recombinant form CRF157_A6C in Primorsky Territory, Russia. J Infect. 2024;88(2):180-182. doi: 10.1016/j.jinf.2023.11.005</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Halikov MR, Ekushov VE, Totmenin AV, et al. Identification of a novel HIV-1 circulating recombinant form CRF157_A6C in Primorsky Territory, Russia. J Infect. 2024;88(2):180-182. doi: 10.1016/j.jinf.2023.11.005</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Халиков М.Р., Екушов В.Е., Тотменин А.В. и др. Вклад рекомбинационной изменчивости ВИЧ в формирование популяции ВИЧ-1, циркулирующих в Приморском крае // Юг России: экология, развитие. 2023. Т. 18. № 4. С. 125-133. doi: 10.18470/1992-1098-2023-4-125-133</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Halikov MR, Ekushov VE, Totmenin AV, et al. The role of recombination variability to the formation of the population the HIV-1 population circulating in the Primorsky Krai, Russia. Yug Rossii: Ekologiya, Razvitie. 2023;18(4):125-133. (In Russ.) doi: 10.18470/1992-1098-2023-4-125-133</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Осипова И.П., Тотменин А.В., Берсенев П.Г. и др. Актуальность использования методов молекулярной эпидемиологии ВИЧ для характеристики территориальных эпидемий: Сахалинская область // Юг России: экология, развитие. 2023. Т. 18. № 3. С. 126-132. doi: 10.18470/1992-1098-2023-3-126-132</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Osipova IP, Totmenin AV, Bersenev PG, Ilyina EYu, Lomakina EA, Gashnikova NM. The relevance of using methods of molecular epidemiology of HIV to characterize territorial epidemics: Sakhalin region, Russia. Yug Rossii: Ekologiya, Razvitie. 2023;18(3):126-132. (In Russ.) doi: 10.18470/1992-1098-2023-3-126-132</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Antonova A, Kazennova E, Lebedev A, et al. Recombinant forms of HIV-1 in the last decade of the epidemic in the Russian Federation. Viruses. 2023;15(12):2312. doi: 10.3390/v15122312</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Antonova A, Kazennova E, Lebedev A, et al. Recombinant forms of HIV-1 in the last decade of the epidemic in the Russian Federation. Viruses. 2023;15(12):2312. doi: 10.3390/v15122312</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Казеннова Е.В., Антонова А.А., Ожмегова Е.Н. и др. Генетический анализ ВИЧ-1 в Алтайском крае: дальнейшее распространение варианта CRF63_02A1 по территории Западной Сибири // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2020. Т. 12. № 1. С. 47-57. doi: 10.22328/2077-9828-2020-12-1-47-57</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kazennova EV, Antonova AA, Ozhmegova EN, et al. Genetic analysis of HIV-1 in the Altai Kray: The further spread of the CRF63_02A1 variant in Western Siberia. VICH-Infektsiya i Immunosupressii. 2020;12(1):47-57. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2020-12-1-47-57</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Циркулирующие рекомбинантные формы ВИЧ-1 на территориях Дальневосточного федерального округа // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2021. № 40. С. 79-87.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kotova VO, Balakhontseva LA, Bazykina EA, Trotsenko OE. Circulating recombinant forms of HIV-1 in constituent entities of the Far Eastern Federal District. Dal’nevostochnyy Zhurnal Infektsionnoy Patologii. 2021;(40):79-87. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Еврейской автономной области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2018. Т. 10. № 4. С. 90–99. doi: 10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kotova VO, Trotsenko OE, Balakhontseva LA, et al. Molecular-epidemiological characteristics of HIV-1 variants circulating in the Jewish Autonomous Region territory. VICH-Infektsiya i Immunosupressii. 2018;10(4):90-99. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2018-10-4-90-99</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tamura K, Stecher G, Kumar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Mol Biol Evol. 2021;38(7):3022-3027. doi: 10.1093/molbev/msab120</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tamura K, Stecher G, Kumar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11. Mol Biol Evol. 2021;38(7):3022-3027. doi: 10.1093/molbev/msab120</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Зырянова Д.П., Богачева Н.В., Тотменин А.В. и др. Модели CRF63_02A6 ВИЧ-1 как инструмент для оценки эффективности разрабатываемых антиретровирусных препаратов // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10. № 4. С. 769-774. doi: 10.15789/2220-7619-MHC-1261</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Zyryanova DP, Bogacheva NV, Totmenin AV, Gashnikova NM. HIV-1 CRF63_02A6 models as a tool for evaluating efficacy of developing antiretroviral drugs. Infektsiya i Immunitet. 2020;10(4):769-774. (In Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-MHC-1261</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sivay MV, Maksimenko LV, Osipova IP, et al. Spatiotemporal dynamics of HIV-1 CRF63_02A6 sub-epidemic. Front Microbiol. 2022;13:946787. doi: 10.3389/fmicb.2022.946787</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sivay MV, Maksimenko LV, Osipova IP, et al. Spatiotemporal dynamics of HIV-1 CRF63_02A6 sub-epidemic. Front Microbiol. 2022;13:946787. doi: 10.3389/fmicb.2022.946787</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Кузнецова А.И. Роль полиморфизма ВИЧ-1 в патогенезе заболевания // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2023. Т. 15. № 3. С. 26-37. doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-26-37</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuznetsova AI. The role of HIV-1 polymorphism in the pathogenesis of the disease. VICH-Infektsiya i Immunosupressii. 2023;15(3):26-37. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2023-15-3-26-37</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ожмегова Е.Н., Кузнецова А.И., Лебедев А.В. и др. Эффективность схем АРТ первой линии на основе TDF у ВИЧ-инфицированных пациентов с предсуществующей мутацией A62V в обратной транскриптазе // Вопросы вирусологии. 2024. Т. 69. № 3. С. 231-240. doi: 10.36233/0507-4088-232</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ozhmegova EN, Kuznetsova AI, Lebedev AV, et al. Efficacy of first-line ART regimens based on tenofovir in HIV-infected patients with pre-existing A62V mutation in reverse transcriptase. Voprosy Virusologii. 2024;69(3):231-240. (In Russ.) doi: 10.36233/0507-4088-232</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Щемелев А.Н., Семенов А.В., Останкова Ю.В. и др. Генетическое разнообразие и мутации лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Ленинградской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022. Т. 99. № 1. С. 28–37. doi: 10.36233/0372-9311-216</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Shchemelev AN, Semenov AV, Ostankova YuV, et al. Genetic diversity and drug resistance mutations of HIV-1 in Leningrad Region. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2022;99(1):28-37. (In Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-216</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Сидорина Ю.Н., Абашина Н.Д., Брусенцева Е.Е., Акимкин В.Г. Пилотное исследование по изучению особенностей распространения резистентных вариантов ВИЧ-1 с помощью молекулярных кластеров. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101. № 5. С. 581–593. doi: https:10.36233/0372-9311-565</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kirichenko AA, Kireev DE, Sidorina YuN, Abashina ND, Brusentseva EE, Akimkin VG. The pilot study of the features of HIV-1 resistant variants spread using molecular clusters. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2024;101(5):581-593. (In Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-565</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Парфенова О.В., Пекшева О.Ю., Зайцева Н.Н. Распространение мутаций резистентности и субтипов ВИЧ-1 как показатель динамики эпидемии ВИЧинфекции в Приволжском федеральном округе в 2016–2018 гг. // Здоровье населения и среда обитания. 2019. № 8 (317). С. 50–55. doi: 10.35627/2219-5238/2019-317-8-50-55</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Parfenova OV, Peksheva OYu, Zaitsevа NN. Spread of mutations of resistance and HIV-1 subtypes as an indicator of dynamics of HIV epidemic in the Volga Federal District in 2016–2018. Zdorov’e Naseleniya i Sreda Obitaniya. 2019;(8(317)):50-56. (In Russ.) doi: 10.35627/2219-5238/2019-317-8-50-55</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019. № 4. С. 79–90, doi: 10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ostankova YuV, Schemelev AN, Zueva EV, Churina MA, Valutite DE, Semenov AV. HIV molecular epidemiology and pharmaco-resistance in patients with antiretroviral therapy failure in Arkhangelsk district. VICH-Infektsiya i Immunosupressiya. 2019;11(4):79-90. (In Russ.) doi: 10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Питерский М.В., Гусев А.Г., Ходаков О.А. и др. Разнообразие субтипов, филогенетический анализ и изучение лекарственной устойчивости штаммов ВИЧ-1, циркулирующих в Уральском федеральном округе // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022. Т. 99. № 1. С. 38-53. doi: 10.36233/0372-9311-178</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Piterskiy MV, Gusev AG, Khodakov OA, et al. HIV-1 subtype diversity, phylogenetic analysis and study of drug resistance in strains circulating in the Ural Federal District. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2022;99(1):38-53. (In Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-178</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Капустин Д.В., Краснова Е.И., Халиков М.Р. и др. Анализ распространенности первичной резистентности ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам в Новосибирской области // Терапия. 2022. Т. 8. № 3(55). С. 35-41. doi: 10.18565/therapy.2022.3.35-41</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kapustin DV, Krasnova EI, Khalikov MR, et al. Analysis of the prevalence of HIV-1 primary resistance to antiretroviral medicinal agents in Novosibirsk region. Terapiya. 2022;8(3):35-41. (In Russ.) doi: 10.18565/ therapy.2022.3.35-41</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit24"><label>24</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kirichenko A, Kireev D, Lopatukhin A, et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022;17(1):e0257731. doi: 10.1371/journal.pone.0257731</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kirichenko A, Kireev D, Lopatukhin A, et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS One. 2022;17(1):e0257731. doi: 10.1371/journal.pone.0257731</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit25"><label>25</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Leal SDV, Pimentel V, Gonçalves P, et al. Genetic diversity and antiretroviral resistance in HIV-1-infected patients newly diagnosed in Cabo Verde. Viruses. 2024;16(12):1953. doi: 10.3390/v16121953</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Leal SDV, Pimentel V, Gonçalves P, et al. Genetic diversity and antiretroviral resistance in HIV-1-infected patients newly diagnosed in Cabo Verde. Viruses. 2024;16(12):1953. doi: 10.3390/v16121953</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
