Preview

Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО

Расширенный поиск

Современные молекулярно-генетические технологии в изучении интенсивности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в ряде субъектов Сибирского федерального округа Российской Федерации

https://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-321-12-42-50

Полный текст:

Аннотация

Введение. Энтеровирусная инфекция (ЭВИ) широко распространена в мире, имеет разнообразные эпидемиологические и клинические проявления. Однако к настоящему времени информации о закономерностях эпидемического процесса этой инфекции на территории ряда субъектов Сибирского федерального округа Российской Федерации (СФО) накоплено недостаточно. Цель исследования. Были изучены особенности эпидемического процесса ЭВИ в охваченных наблюдением субъектах СФО, в том числе с использованием высокотехнологичных молекулярно-генетических методов исследования. Материалы и методы. Проведен анализ многолетней динамики заболеваемости ЭВИ в анализируемых субъектах СФО. Методом секвенирования определены 237 типов энтеровирусов, циркулировавших в 2017-2018 гг. в изучаемых регионах, проведен филогенетический анализ полученных нуклеотидных последовательностей возбудителей. Результаты. Эпидемиологическая ситуация в отношении энтеровирусной инфекции в большинстве анализируемых субъектов СФО за последние два года характеризовалась неблагополучием. Значительный подъем заболеваемости наблюдался в Иркутской области, Забайкальском крае и республике Алтай. В регионах Сибири установлены основные проявления эпидемического процесса ЭВИ, к которым относятся: многолетнее превышение среднероссийского уровня заболеваемости с тенденцией роста ежегодных показателей; преобладание герпангины, экзантемы и энтеровирусного менингита в клинической картине заболевания; доминирование среди заболевших лиц детей в возрасте 3-6 лет; превалирование вирусов Коксаки А-6 и Коксаки А-9 в пейзаже циркулирующих на территории ряда субъектов СФО энтеровирусов; регистрация групповых и завозных случаев заболеваний. Обсуждение. Результаты исследования продемонстрировали важность такого компонента эпидемиологического надзора за ЭВИ, как молекулярно-генетический мониторинг циркулирующих энтеровирусов, проводимый на современном методическом уровне и позволяющий выявлять возможные эпидемиологические связи случаев заболеваний.

Об авторах

Елена Юрьевна Сапега
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия


Л. В. Бутакова
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО «Дальневосточный государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия


О. Е. Троценко
ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора
Россия


С. Э. Лапа
Управление Роспотребнадзора по Забайкальскому краю
Россия


А. Н. Пережогин
Управление Роспотребнадзора по Иркутской области
Россия


Л. В. Щучинов
Управление Роспотребнадзора по Республике Алтай
Россия


С. С. Ханхареев
Управление Роспотребнадзора по Республике Бурятия
Россия


Д. В. Горяев
Управление Роспотребнадзора по Красноярскому краю
Россия


Л. К. Салчак
Управление Роспотребнадзора по Республике Тыва
Россия


Т. Г. Романова
Управление Роспотребнадзора по Республике Хакасия
Россия


Список литературы

1. Канаева О.И. Энтеровирусная инфекция: многообразие возбудителей и клинических форм // Инфекция и иммунитет. 2014. Т. 4. № 1. С. 27-36.

2. Кожевникова Н.В., Резник В.И., Воронкова Г.М. и др. Проявления эпидемического процесса энтеровирусных инфекций в Дальневосточном федеральном округе // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2008. № 13 (13). С. 9-17.

3. Мартынова Г.П., Кутищева И.А., Бойцова Е.Б. и др. Энтеровирусная инфекция у детей: клинико-эпидемиологические особенности на современном этапе. // Детские инфекции. 2016. Т. 15. № 3. С. 15-18.

4. Романенкова Н.И., Бичурина М.А., Голицына Л.Н. и др. Неполиомиелитные энтеровирусы, обусловившие подъем заболеваемости энтеровирусной инфекцией на 9. ряде территорий России в 2016 г. // Журнал инфектологии. 2017. Т. 9. № 3. С. 98-108.

5. Романенкова Н.И., Канаева О.И., Бичурина М.А., Розаева Н.Р. Детекция неполиомиелитных энтеро- 10. вирусов у детей с острыми вялыми параличами из организованных коллективов и семей мигрантов // Журнал инфектологии. 2014. Т. 9. № 3. С. 43-48.

6. Севостьянова А.В., Борисова Т.И., Гаврилова Т.А. и 11. др. Этиологическая характеристика энтеровирусной инфекции в Иркутской области на основе молекулярно-генетического типирования // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2018. Т. 36. 12. № 2. С. 93-98.

7. Сергеева И.В. Особенности течения энтеровирусной инфекции в Красноярском крае в августе-сентябре 13. 2016 года // Международный академический вестник. 2016. № 5 (17). С. 38-40.

8. Тевеленок О.Г., Королева Г.А., Далматов В.В., Опейкина Н.Н. Эпидемиологические аспекты энтеровирусной 14. инфекции в Красноярском крае // Здоровье населения и среда обитания. 1999. № 7. С. 21-25.

9. Тихонова Е.П., Андронова Н.В., Кузьмина Т.Ю. и др. Особенности клиники и эпидемиологии энтеровирусной инфекции в сезон 2016 г: в Красноярском крае // Успехи современной науки и образования. 2017. Т. 6. № 2. С. 107-111.

10. Хохлова З.А., Гилёва Р.А., Середа Т.В. и др. Клинико-эпидемиологические особенности энтеровирусного менингита в период сезонной вспышки 2015 года // Журнал инфектологии. 2016. Т. 8. № 3. С. 83-91.

11. Фомина С.Г., Голицына Л.Н., Новикова Н.А. и др. Молекулярно-генетическая характеристика энтеровирусов человека, обнаруженных у детей с гастроэнтеритом в Нижнем Новгороде // Медицинский Альманах. 2009. № 2 (7). С. 121-123.

12. Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, etc. Bayesian phylogenetics with BEAUTi and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012; 29(8):1969-73. D0I: 10.1093/molbev/mss075

13. de Graaf H, Pelosi E, Cooper A, et al. Severe enterovirus infections in hospitalized children in the South of England: clinical phenotypes and causative genotypes. Pediatr Infect Dis J. 2016; 35(7):723-7. D0I: 10.1097/INF.0000000000001093

14. Guo WP, Lin XD, Chen YP, et al. Fourteen types of co-circulating recombinant enterovirus were associated with hand, foot, and mouth disease in children from Wenzhou, China. J Clin Virol. 2015; 70:29-38. D0I: 10.1016/j. jcv.2015.06.093

15. He Y-Q, Chen L, Xu W-B, et al. Emergence, circulation, and spatiotemporal phylogenetic analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated hand, foot, and mouth disease infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. J Clin Microbiol. 2013; 51(11):3560-6. D0I: 10.1128/ JCM.01231-13

16. Lukashev AN, Shumilina EY, Belalov IS, et al. Recombination strategies and evolutionary dynamics of the human enterovirus A global gene pool. J Gen Virol. 2014; 95(4):868-73. D0I: 10.1099/vir.0.060004-0

17. Mirand A, Henquell C, Archimbaud C, et al. 0utbreak of hand, foot and mouth disease/herpangina associated with Coxsackievirus A6 and A10 infections in 2010, France: a large citywide, prospective observational study. Clin Microbiol Infect. 2012; 18(5):E110-8. D0I: 10.1111/j.1469-0691.2012.03789.x

18. Nguyen AT, Tran TT, Hoang VM, et al. Development and evaluation of a non-ribosomal random PCR and next-generation sequencing based assay for detection and sequencing of hand, foot and mouth disease pathogens. J Virol. 2016; 13:125. D0I: 10.1186/s12985-016-0580-9

19. Nix WA, 0berste MS, Pallansch MA. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. J Clin Microbiol. 2006; 44(8):2698-704.

20. Shapiro B, Rambaut A, Drummond AJ. Choosing appropriate substitution models for the phylogenetic analysis of protein-coding sequences. Mol Biol Evol. 2006; 23(1):7-9.

21. Puenpa J, Vongpunsawad S, Dsterback R, et al. Molecular epidemiology and the evolution of human Сoxsacklevirus A6. J Gen Virol. 2016; 97(12):3225-31. D0I: 10.1099/ jgv.0.000619


Для цитирования:


Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Лапа С.Э., Пережогин А.Н., Щучинов Л.В., Ханхареев С.С., Горяев Д.В., Салчак Л.К., Романова Т.Г. Современные молекулярно-генетические технологии в изучении интенсивности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в ряде субъектов Сибирского федерального округа Российской Федерации. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2019;(12):42-50. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-321-12-42-50

For citation:


Sapega E.Yu., Butakova L.V., Trotsenko O.E., Lapa S.E., Perezhogin A.N., Shchuchinov L.V., Khankhareev S.S., Goryaev D.V., Salchak L.K., Romanova T.G. State-of-the-art molecular genetic techniques in surveillance over intensity of enterovirus infection epidemic process in some constituent entities of the Siberian Federal District of the Russian Federation. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2019;(12):42-50. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-321-12-42-50

Просмотров: 41


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2219-5238 (Print)
ISSN 2619-0788 (Online)