Молекулярно-эпидемиологический мониторинг циркуляции вируса Коксаки А10

Введение. Вирус Коксаки А10 (CV­-A10) в настоящее время является одним из самых распространенных этиологических агентов энтеровирусной инфекции (ЭВИ). В последнее десятилетие увеличилась частота регистрации тяжелого течения и летальных случаев при CV­-А10-­инфекции, схожих по клиническим проявлениям с инфекцией, вызванной энтерови­русом А71. Цель исследования – охарактеризовать динамику циркуляции вируса Коксаки А10 в Российской Федерации в 2008–2019 гг., изучить филогенетические взаимосвязи штаммов, выявленных в России и во Вьетнаме. Материалы и методы. С использованием молекулярно-­генетических методов в 2008–2019 гг. в Российской Федерации идентифицировано и изучено 220 штаммов CV-­A10 от больных с различной клинической манифестацией ЭВИ и из проб сточной воды. Так­же изучено 26 штаммов CV-­A10, выделенных в 2018–2019 гг. в Южном Вьетнаме от больных энтеровирусной экзантемой и острыми вялыми параличами. Результаты. Установлена двухлетняя периодичность активной циркуляции CV­-A10 в России. В структуре клинических форм CV-­A10­-инфекции преобладала герпангина (30,8 %), малая болезнь состави­ла 25,25 %, респираторные заболевания – 15,66 %, экзантемные формы – 14,65 %, желудочно-­кишечные расстройства – 8,08 %, бессимптомные инфекции – 2,02 %. Симптомы поражения ЦНС (менингит, менингоэнцефалит) были отмечены в 3,53 % случаев. Большинство штаммов CV­A10 из Вьетнама были выделены от больных с симптомами поражения ЦНС различной степени тяжести. В исследуемый период на территории РФ циркулировали штаммы CV­A10, относящие­ся к генотипам С, Е и F3, штаммы из Южного Вьетнама были представлены генотипами F3 и F1. Изученные штаммы проявили генетическое родство с вирусами CV­-A10, циркулировавшими в разных странах. Вьетнамские и некоторые российские штаммы генотипа F3 были генетически близки штаммам, выделенным от больных с тяжелой патологией. Выводы. Молекулярный мониторинг циркуляции CV­-A10 является важной составляющей глобального эпидемиологи­ческого надзора за ЭВИ.

1. Zell R, Delwart E, Gorbalenya AE, Hovi T, King AMQ, Knowles NJ et al. ICTV virus taxonomy profile: Picornaviridae. J Gen Virol. 2017;98(10):2421–2422. doi: 10.1099/jgv.0.000911

2. Dalldorf G. The coxsackie virus group. Ann N Y Acad Sci. 1953;56(3):583–6. doi: 10.1111/j.1749-6632.1953. tb30251.x

3. Blomqvist S, Klemola P, Kaijalainen S, Paananen A, Simonen M-L, Tvuorinen T, et al. Co-circulation of coxsackieviruses A6 and A10 in hand, foot and mouth disease outbreak in Finland. J Clin Virol. 2010;48(1):49–54. doi: 10.1016/j.jcv.2010.02.002

4. Bracho MA, González-Candelas F, Valero A, Cуrdoba J, Salazar A. Enterovirus co-infections and onychomadesis after hand, foot, and mouth disease, Spain, 2008. Emerg Infect Dis. 2011;17(12):2223–31. doi: 10.3201/eid1712.110395

5. Wu Y, Yeo A, Phoon MC, Tan EL, Poh CL, Quak SH, et al. The largest outbreak of hand; foot and mouth disease in Singapore in 2008: the role of enterovirus 71 and coxsackievirus A strains. Int J Infect Dis. 2010;14(12):e1076–81. doi: 10.1016/j.ijid.2010.07.006

6. Lu QB, Zhang XA, Wo Y, Xu H-M, Li X-J, Wang X-J et al. Circulation of Coxsackievirus A10 and A6 in hand-foot-mouth disease in China, 2009–2011. PLoS ONE 2012;7(12):e52073. doi: 10.1371/journal.pone.0052073

7. Munivenkatappa A, Yadav PD, Nyayanit DA, Majumdar TD, Sangal L, Jain S, et al. Molecular diversity of Coxsackievirus A10 circulating in the southern and northern region of India [2009–17]. Infect Genet Evol. 2018;66:101–110. doi: 10.1016/j.meegid.2018.09.004

8. Hoang MTV, Nguyen TA, Tran TT, Vu TTH, Le NTN, Nguyen THN, et al. Clinical and aetiological study of hand, foot and mouth disease in southern Vietnam, 2013–2015: Inpatients and outpatients. Int J Infect Dis. 2019;80:1–9. doi: 10.1016/j.ijid.2018.12.004

9. Bian L, Gao F, Mao Q, Sun S, Wu X, Liu S, et al. Hand, foot, and mouth disease associated with coxsackievirus A10: more serious than it seems. Expert Rev Anti Infect Ther. 2019;17(4):233–242. doi: 10.1080/14787210.2019.1585242

10. Chen M, He S, Yan Q, Xu X, Wu W, Ge S, et al. Severe hand, foot and mouth disease associated with Coxsackievirus A10 infections in Xiamen, China in 2015. J Clin Virol. 2017;93:20–24. doi: 10.1016/j.jcv.2017.05.011

11. Fuschino ME, Lamson DM, Rush K, Carbone LS, Taff ML, Hua Z, et al. Detection of coxsackievirus A10 in multiple tissues of a fatal infant sepsis case. J Clin Virol. 2012;53(3):259–61. doi: 10.1016/j.jcv.2011.12.011

12. Ji H, Fan H, Lu PX, Zhang X-F, Ai J, Shi C, et al. Surveillance for severe hand, foot, and mouth disease from 2009 to 2015 in Jiangsu province: epidemiology, etiology, and disease burden. BMC Infect Dis. 2019;19(1):79. doi: 10.1186/s12879-018-3659-7

13. Okada H, Wada M, Sato H, Yamaguchi Y, Tanji H, Kurokawa K, et al. Neuromyelitis optica preceded by hyperCKemia and a possible association with coxsackie virus group A10 infection. Intern Med. 2013;52(23):2665–8. doi: 10.2169/internalmedicine.52.1042

14. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Сашина Т.А., Епифанова Н.В., Новикова Н.А.. Эпидемические варианты неполиомиелитных энтеровирусов в Российской Федерации // Сборник трудов IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика-2017», 18-20 апреля 2017 г. М., 2017. Т. 2. С. 351–352.

15. Романенкова Н.И., Голицына Л.Н., Канаева О.И., Переладова И.В, Федюшкина И.В., Столярова Е.А. и др. Эпидемиологические особенности и этиологическая структура энтеровирусной инфекции в России, Вьетнаме и других странах Юго-Восточной Азии. В кн.: Актуальные направления и перспективы российско-вьетнамского сотрудничества в сфере обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия: коллективная монография / Под ред. А.Ю. Поповой. Волгоград: ООО «Издательство «Волга-Пресс», 2019. С. 215–243.

16. Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. J Clin Microbiol. 2006;44(8):2698–704. doi: 10.1128/ JCM.00542-06

17. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Селиванова-Фомина С.Г., Пономарева Н.В., Кашников А.Ю., Созонов Д.В. и др. Этиологическая структура энтеровирусных инфекций в Российской Федерации в 2017–2018 гг. // Здоровье населения и среда обитания. 2019. № 8 (317). С. 30–38. doi: https://doi.org/10.35627/2219-5238/2019-317-8-30-38

18. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Пономарева Н.В., Кашников А.Ю., Леонов А.В., Сашина Т.А. и др. Эпидемиологическая ситуация по энтеровирусной инфекции в РФ в 2019 году: заболеваемость, результаты лабораторной диагностики, прогноз на 2020 г. // Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. 2020. № 7. С. 5–12. Доступно по https://www.nniiem.ru/ file/razrabotki/2020/byulleten-evi-2019-n7-may-2020-02. pdf Ссылка активна на 28 февраля 2021.

19. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011;28(10):2731–9. doi: 10.1093/molbev/msr121

20. Drummond AJ, Suchard MA, Xie D, Rambaut A. Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7. Mol Biol Evol. 2012;29(8):1969–73. doi: 10.1093/molbev/mss075

21. Ji T, Guo Y, Huang W, Shi Y, Xu Y, Tong W, et al. The emerging sub-genotype C2 of CoxsackievirusA10 Associated with Hand, Foot and Mouth Disease extensively circulating in mainland of China. Sci Rep. 2018;8(1):13357. doi: 10.1038/s41598-018-31616-x

22. Nhan LNT, Khanh TH, Hong NTT, Van HMT, Nhu LNT, Ny NTH, et al. Clinical, etiological and epidemiological investigations of hand, foot and mouth disease in southern Vietnam during 2015 – 2018. PLoS Negl Trop Dis. 2020;14(8):e0008544. doi: 10.1371/journal.pntd.0008544

23. Hoa-Tran TN, Nguyen AT, Dao ATH, Kataoka C, Ta HTT, Nguyen HTV, et al. Genetic characterization of VP1 of coxsackieviruses A2, A4, and A10 associated with hand, foot, and mouth disease in Vietnam in 2012–2017: endemic circulation and emergence of new HFMD-causing lineages. Arch Virol. 2020;165(4):823–834. doi: 10.1007/s00705-020-04536-3

24. Gonzalez G, Carr MJ, Kobayashi M, Hanaoka N, Fujimoto T. Enterovirus-associated hand–foot and mouth disease and neurological complications in Japan and the rest of the world. Int J Mol Sci. 2019;20(20):5201. doi: 10.3390/ ijms20205201

25. Kang HJ, Yoon Y, Lee YP, Kim H-J, Lee D-Y, Lee JW, et al. A different epidemiology of enterovirus A and enterovirus B co-circulating in Korea, 2012–2019. J Pediatric Infect Dis Soc. 2020;piaa111. doi: 10.1093/jpids/ piaa111

26. Li J, Wang X, Cai J, Ge Y, Wang C, Qiu Y, et al. Nonpolio enterovirus infections in children with central nervous system disorders in Shanghai, 2016–2018: Serotypes and clinical characteristics. J Clin Virol. 2020;129:104516. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104516

27. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Гoряев Д.В., Дмитриева Г.М., Детковская Т.Н. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ энтеровирусов, циркулирующих на территории Дальневосточного и Сибирского федеральных округов Российской Федерации, в том числе участвующих в возникновении очагов групповой заболеваемости // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2018. № 35 (35). С. 5–14.

28. Tu PV, Thao NTT, Perera D, Truong KH, Tien NTK, Thuong TC, et al. Epidemiologic and virologic investigation of hand, foot, and mouth disease, southern Vietnam, 2005. Emerg Infect Dis. 2007;13(11):1733–41. doi: 10.3201/eid1311.070632

29. Lukashev AN, Shumilina EYu, Belalov IS, Ivanova OE, Eremeeva TP, Reznik VI, et al. Recombination strategies and evolutionary dynamics of the Human enterovirus A global gene pool. J Gen Virol. 2014;95(Pt 4):868–873. doi: 10.1099/vir.0.060004-0