Development of a method for identifying of V. parahaemolyticus by real-time PCR
Abstract
Bacteria of the species V. parahaemolyticus are halophilic microorganisms that may be causing acute enteric disease in humans, occurring according to the type of foodborne illness. The success of the treatment-and-nrophylactic and sanitary-epidemiological measures aimed at the prevention of the proliferation of «halophiles» largely depends on timely and accurate identification of strains of Vibrio secreted from patients, seafood, as well as in monitoring of environmental objects. This paper presents a method of identifying strains of the species V. parahaemolyticus by PCR in «real time» (Real-Time PCR), which enables the selection of chromosomal DNA from the test material, the PCR with the designed by us primers specific to the portion of a gene collagenase vppC and the probe, allowing to detect amplificatory the fragment and to incorporate the results in real-time.
About the Authors
O. A. Rykovskaya
Rostov-on-Don Research Institute for Plaque Control of Rospotrebnadzor
Russian Federation
Russian Federation
M. V. Poleeva
Rostov-on-Don Research Institute for Plaque Control of Rospotrebnadzor
Russian Federation
Russian Federation
O. S. Chemisova
Rostov-on-Don Research Institute for Plaque Control of Rospotrebnadzor
Russian Federation
Russian Federation
A. L. Trukhachev
Rostov-on-Don Research Institute for Plaque Control of Rospotrebnadzor
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемоли-тическими и другими патогенными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. 26 с.
2. Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09 М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. 51 с.
3. Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. и др. ПЦР в реальном времени. М: Бином. Лаборатория знаний, 2009. 223 с.
4. Рыковская О.А., Чемисова О.С., Смоликова Л.М. и др. Дифференциация представителей Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus // Клиническая лабораторная диагностика. 2014. Т. 59. № 12. С. 50-55.
5. Чемисова О.С., Телесманич Н.Р., Рыковская О.А. и др. Масс-спектрометрический анализ как метод идентификации и внутривидовой дифференциации Vibrio parahaemolyticus // Холера и патогенные для человека вибрионы: Материалы проблемной комиссии. Ростов-на-Дону. 2013. Вып. 26. С. 153-157.
6. Chakraborty R. et al. Species-specific identification of Vibrio fluvialis by PCR taigeted to the conserved transcriptional activation and variable membrane tether regions of the toxRgene / R. Chakraborty, S. Sinha, A.K. Muk-hopadhyay [et al.] // J. Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. pp. 805-808.
7. Di Pinto A. et al. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus/ A Di Pinto, G. Ciccarese, G. Tantillo // J. of Food Protection. 2005. Vol. 68. № 1. pp. 150-153.
8. Khamesipour F. et al. Detection of Vibrio spp. in shrimp from aquaculture sites in Iran using polymerase chain reaction (PCR) / F. Khamesipour, E. Noshadi, M. Moradi [et al.] // J. AACL Bioflux. 2014. Vol. 7. № 1. pp. 1-7.
9. Panicker G. et al. Red-time PCR detection of Vibrio vulnificus in oysters: comparison of oligonucleotide primers and probes taigeting whA / G. Panicked A.K. Bej HI Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71. № 10. pp. 5702-5709.
10. Reham A.A. et al. Specific Detection of Pathogenic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction / A.A. Reham., M.S. Amani // J. Global Veterinaria. 2012. Vol. 8. № 5. pp. 525-531.
Review
For citations:
Rykovskaya O.A., Poleeva M.V., Chemisova O.S., Trukhachev A.L. Development of a method for identifying of V. parahaemolyticus by real-time PCR. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2018;(3):48-50. (In Russ.)
Views:
227
.png)
Email this article 