Роль молекулярно-генетических методов исследования в выявлении потенциальных рисков завоза энтеровирусной инфекции на территорию Хабаровского края

Нестабильная эпидемиологическая ситуация по энтеровирусной инфекции в мире на фоне тесных международных взаимоотношений значительно повышает риск завоза возбудителей на территорию Российской Федерации. Целью исследования было выявление эпидемиологических рисков завоза энтеровирусной инфекции на территорию Хабаровского края. Проведены молекулярно-эпидемиологические исследования 481 пробы из объектов окружающей среды и клинического материала от больных энтеровирусной инфекцией, контактных лиц. Реконструкцию филогенетических взаимоотношений осуществляли с использованием методов байесовского моделирования. При молекулярно-эпидемиологическом исследовании установлено, что доминирующими серотипами для Хабаровского края являются энтеровирусы группы В (Коксаки В-4, В-5, ЕСНО-6,9,30). Проведенный с помощью метода молекулярных часов анализ эволюционных дистанций позволил выявить возможную эпидемиологическую связь между случаями заболеваний в Хабаровском крае и в других субъектах Российской Федерации, а также связь со случаями энтеровирусной инфекции в таких странах, как Китайская Народная Республика, Нидерланды, Индия. Выявлены потенциальные риски завоза энтеровирусов Коксаки В-4, В-5, ЕСНО-6,9,30 в Хабаровский край из стран Азиатско-Тихоокеанского региона и Европы, а также других регионов России.

энтеровирусная инфекция, энтеровирусы, риск завоза возбудителей, молекулярно-эпидемиологические исследования, enterovirus infection, enteroviruses, the risk of importation of the pathogens, molecular epidemiologic research

1. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Епифанова Н.В. и др. Неполиомиелитные энтеровирусы в Российской Федерации в 2016 году // Информационный бюллетень. 2017. № 4. С. 25-31.

2. Голицына Л.Н., Зверев В.В., Парфенова О.В. и др. Вирус Коксаки А6 в Российской Федерации в 2014 году // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015. № 28. С. 12-20.

3. Лукашев А.Н., Резник В.И., Иванова О.Е. и др. Молекулярная эпидемиология вируса ECHO 6 - возбудителя вспышки серозного менингита в Хабаровске в 2006 г. // Вопросы вирусологии. 2008. № 1 (53). С. 16-21.

4. Лукашев А.Н. Роль рекомбинации в эволюции неполиомиелитных энтеровирусов // Вопросы вирусологии. 2005. № 3 (50). С. 46-51.

5. Онищенко Г.Г., Осипова Т.В., Грачева Е.В. и др. Сезон энте-ровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты // Журнал микробиологии. 2009. № 2. С. 24-30.

6. Троценко О.Е., Курганова О.П., Зайцева Т. А. и др. Использование научного потенциала в международном сотрудничестве России и Китая по вопросам противодействия эпидемическому распространению энтеровирусных инфекций // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015. № 28. С. 6-12.

7. Шишко Л.А., Романенкова Н.И., Бичурина М.А. и др. Этиология сезонных подъемов заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Архангельской области // Инфекция и иммунитет. 2013. № 1 (3). С. 65-72.

8. Alidjinou E.K., Sané F., Bertin A. et al. Persistent infection of human pancreatic cells with Coxsackievirus B4 is cured by fluoxetine. / E.K. Alidjinou, F. Sané, A. Bertin [et al.] // Antiviral Research. 2015. Vol. 116. P. 51-4.

9. Bailly J.L., Mirand A., Henquell C. et al. Phylogeography of circulating populations of human echovirus 30 over 50 years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 cap-sid protein gene / J.L. Bailly, A. Mirand, C. Henquell [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. 2009. Vol. 9(4). P. 699-708.

10. Benschop K.S., Geeraedts F., Beuvink B., Spit S.A., Fanoy E.B., Claas E.C. et al. Increase in ECHOvirus 6 infections associated with neurological symptoms in the Netherlands, June to August 2016 / K.S. Benschop, F. Geeraedts, B. Beuvink [et al.] // Eurosurveillance. 2016. Vol. 21(39). DOI: 10.2807 / 1560-7917.

11. Bissel S.J., Winkler C.C., DelTondo J. Coxsackievirus B4 myocarditis and meningoencephalitis in newborn twins / S.J. Bissel, C.C. Winkler, J. DelTondo // Neuropathology. 2014. Vol. 34(5). P. 429-37.

12. Chen P., Tao Z., Song Y., Liu G., Wang H., Liu Y. et al. A Coxsackievirus B5-associated aseptic meningitis outbreak in Shandong Province, China in 2009 / P. Chen, Z. Tao, Y. Song [et al.] // Journal of Medical Virology 2013. Vol. 85(3). P. 483-9.

13. Drummond A.J., Suchard M.A., Xie D., Rambaut A.Bayesian phylogenetics with BEAUTi and the BEAST 1.7. / A.J. Drummond, M.A. Suchard, D. Xie, A. Rambaut // Molecular Biology and Evolution. 2012 Vol. 29(8). P. 1969-73.

14. Dorta-Contreras A.J., Reiber H., Magraner-Tarrau M.E., Weissbrich B., Interian-Morales M.T., Noris-Garcfa E. et al. Intrathecal synthesis pattern of immunoglobulins in meningoencephalitis epidemic due to echovirus 9 / A.J. Dorta-Contreras, H. Reiber, M.E. Magra-ner-Tarrau [et al.] // Revista de Neurologia. 2002. Vol. 35(10). P. 904-7.

15. Feder HM Jr., Bennett N., Modlin J.F. Atypical hand, foot, and mouth disease: a vesiculobullous eruption caused by Coxsackievirus A6 / H.M. Jr. Feder, N. Bennett, J.F. Modlin // The Lancet Infectious Disease. 2014 Vol. 14(1). P. 83-6. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (13) 70264-0.

16. Kim KW, Ho A, Alshabee-Akil A., Hardikar A.A., Kay T.W., Rawlinson W.D. et al. Coxsackievirus B5 Infection Induces Dysregulation of microRNAs Predicted to Target Known Type 1 Diabetes Risk Genes in Human Pancreatic Islets / K.W. Kim, A. Ho, A. Alshabee-Akil [et al.] // Diabetes. 2016. Vol. 65(4). P. 996-1003.

17. Kim H.J., Kang B., Hwang S. et al. Epidemics of viral meningitis caused by echovirus 6 and 30 in Korea in 2008 / H.J. Kim, B. Kang, S. Hwang [et al.] // Virology Journal. 2012. Vol. 9. P. 38.

18. Lee CJ, Huang YC, Yang S., Tsao K.C., Chen C.J., Hsieh Y.C. et al. Clinical features of Coxsackievirus A4, B3 and B4 infections in children / C.J. Lee, Y.C. Huang, S. Yang [et al.] // PLoS One.2014; 9(2):e87391. DOI: 10.1371 / journal.pone.0087391.

19. Liu N., Jia L., Yin J., Wu Z., Wang Z., Li P. et al. An outbreak of aseptic meningitis caused by a distinct lineage of Coxsackievirus B5 in China / N. Liu, L. Jia, J. Yin [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. 2014. Vol. 23. P. 101-4.

20. Morgan C, Thomson SJ, Legg J, Narat S.A Case of Fulminant Hepatitis due to Echovirus 9 in a Patient on Maintenance Rituxi-mab Therapy for Follicular Lymphoma / C. Morgan, S.J. Thomson, J. Legg [et al.] // Case Reports in Hematology. Volume 2015 (2015), Article ID 454890. DOI:10.1155 / 2015/454890.

21. Nix W.A, Oberste M.S, Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens / W.A. Nix, M.S. Oberste, M.A. Pallansch // Journal of Clinical Microbiology 2006. Vol. 44(8). P. 2698-704.

22. Österback R., Vuorinen T., Linna M., Susi P., Hyypiä T., Waris M. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland / R. Österback, T. Vuorinen, M. Linna [et al.] // Emerging Infections Diseases. 2009. Vol. 15(9). P. 1485-8.

23. Renert-Yuval Y., Marva E., Weil M., Shulman L.M., Gencylmaz N., Sheffer S. et al. Coxsackievirus A6 Polymorphic Exanthem in Israeli Children / Y. Renert-Yuval, E. Marva, M. Weil [et al.] Acta Dermato-Venereologica. 2016. Vol. 96 (4). P. 546-9.

24. Shapiro B, Rambaut A, Drummond AJ. Choosing appropriate substitution models for the phylogenetic analysis of protein-coding sequences / B. Shapiro, A. Rambaut, A.J. Drummond // Molecular Biology and Evolution. 2006. Vol. 23(1). P. 7-9.

25. Tian X, Zhang Y, Gu S. at al. New Coxsackievirus B4 genotype circulating in Inner Mongolia Autonomous Region, China / X. Tian, Y. Zhang, S. Gu [et al.] // PLoS One. 2014; 9(3):e90379. DOI: 10.1371/journal.pone.0090379.

26. Wieczorek M., Krzysztoszek A., Ci^cka A., Figas A. Molecular characterization of environmental and clinical echovirus 6 isolates from Poland, 2006-2014 / M. Wieczorek, A. Krzysztoszek, A. Ciqcka [et al.] // Journal of Medical Virology. 2017. Vol. 89(5). P. 936-40.

27. Xiao H., Huang K., Li L. et al. Complete genome sequence analysis of human echovirus 30 isolated during a large outbreak in Guangdong Province of China, in 2012 / Xiao H., K. Huang, L. Li [et al.] // Archives of Virology. 2014. Vol. 159. P. 379-83.

28. Zhou Y., Fernandez S., Yoon I.K., Simasathien S., Watanaveeradej V., Yang Y. et al. Metagenomics Study of Viral Pathogens in Undiagnosed Respiratory Specimens and Identification of Human Enteroviruses at a Thailand Hospital / Y. Zhou, S. Fernandez, I.K. Yoon [et al.] // The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. 2016. Vol. 95(3). P. 663-9.

29. Zhu Y., Zhou X., Liu J., Xia L., Pan Y., Chen J. et al. Molecular identification of human enteroviruses associated with aseptic meningitis in Yunnan province, Southwest China / Y. Zhu, X. Zhou, J. Liu [et al.] // SpringerPlus 2016. Vol. 5(1). P. 1515. DOI.org/10.1186/s40064-016-3194-1.