Эпидемиологический и молекулярно-генетический мониторинг коревой инфекции в Казахстане в 2023 году

Введение. Вирус кори продолжает оставаться одной из основных причин детской заболеваемости и смертности, представляя серьезную угрозу для большинства стран. В Казахстане с марта 2023 года наблюдается осложнение эпидемиологической ситуации по кори. Основная заболеваемость регистрировалась у ранее не привитых, недостаточно или несвоевременно привитых детей и взрослых, которые формируют широкую неиммунную прослойку населения.
Цель исследования: проведение эпидемиологического и молекулярно-генетического мониторинга вирусов кори, вызвавших рост заболеваемости в Казахстане в 2023 году.
Материалы и методы. Анализ заболеваемости вирусов кори в Республике Казахстан в 2023 году проведен с использованием данных государственных статистических форм. В целях генотипирования циркулирующих штаммов кори проводился анализ нуклеотидной последовательности С-терминальной области N-гена 69 клинических образцов мочи вируса кори методом Сэнгера.
Результаты. В Казахстане в 2023 году зарегистрирован 29 731 случай кори, показатель на 100 тысяч населения составил 149,95. Значительную часть заболевших составили дети от 1 до 4 лет – 43,3 %, далее дети 5–14 лет – 19,9 % и дети до года – 16,1 %, из которых 65,9 % заболевших не были привиты против кори. По результатам анализа нуклеотидных последовательностей 69 образцов кори было выявлено, что исследованные образцы принадлежали двум генотипам – D8 и B3.
Обсуждение. Заболеваемость корью в 2023 году была зарегистрирована по всей территории Казахстана. Генотип D8 был представлен преобладающей линией 8248, идентифицированной в Таджикистане в 2021 году и циркулировавшей в Европе. Генотип B3 был связан с штаммами, впервые выявленными в Индии и Саудовской Аравии. Эти данные подтверждают, что заболеваемость корью в Казахстане была вызвана импортированием вирусов из других стран.
Заключение. Эпидемиологический и молекулярно-генетический анализ вирусов кори подтверждает продолжение циркуляции генотипов B3 и D8. Эти данные подчеркивают необходимость продолжения мониторинга и повышения уровня вакцинации для контроля распространения кори.

1. Riddell MA, Rota JS, Rota PA. Review of the temporal and geographical distribution of measles virus genotypes in the prevaccine and postvaccine eras. Virol J. 2005;2:87. doi: 10.1186/1743-422X-2-87

2. Rota PA, Brown K, Mankertz A, et al. Global distribution of measles genotypes and measles molecular epidemiology. J Infect Dis. 2011;204(Suppl 1):S514-S523. doi: 10.1093/infdis/jir118

3. Santibanez S, Tischer A, Heider A, Siedler A, Hengel H. Rapid replacement of endemic measles virus genotypes. J Gen Virol. 2002;83(Pt 11):2699-2708. doi: 10.1099/0022-1317-83-11-2699

4. Wolfson LJ, Grais RF, Luquero FJ, Birmingham ME, Strebel PM. Estimates of measles case fatality ratios: A comprehensive review of community-based studies. Int J Epidemiol. 2009;38(1):192-205. doi: 10.1093/ije/dyn224

5. Moss WJ. Measles. Lancet. 2017;390(10111):2490-2502. doi: 10.1016/S0140-6736(17)31463-0

6. Ma DZ, Pfaller CK, eds. Measles and Related Morbilliviruses: Methods and Protocols. Humana New York, NY; 2024. doi: 10.1007/978-1-0716-3870-5

7. Naim HY. Measles virus: a pathogen, vaccine, and a vector. Hum Vaccin Immunother. 2015;11(1):21-26. doi: 10.4161/hv.34298

8. Abeev A, Zhylkibayev A, Kamalova D, et al. Epidemiological outbreaks of measles virus in Kazakhstan during 2015. Jpn J Infect Dis. 2018;71(5):354-359. doi: 10.7883/yoken.JJID.2017.565

9. Тлеумбетова Н., Нусупбаева Г., Амандосова Д., Кулжабаева А., Дурумбетов Е., Магай А. Результаты молекулярно-генетического мониторинга вирусов кори, циркулировавших на территории Казахстана в 2015 году // Вестник КазНМУ. 2017. №4. С. 27-30.

10. Kumar S., et al. Epidemiology and control of measles: A global perspective. Journal of Infectious Diseases. 2019; 219(Supplement_1): S11-S18. https://doi.org/10.1093/infdis/jiy600

11. Parker EP, et al. Global epidemiology of measles: trends and future directions. The Lancet Infectious Diseases. 2019;19(9):e291-e300. doi: 10.1016/S1473-3099(19)30306-1

12. Рубальская Т.С., Ерохов Д.В., Жердева П.Е., Мамаева Т.А., Тихонова Н.Т. Глобальное генетическое разнообразие вируса кори (Paramyxoviridae: Morbillivirus: Morbillivirus hominis): исторические аспекты и современное состояние // Вопросы вирусологии. 2023. Т. 68. № 5. С. 361–371. doi: 10.36233/0507-4088-187

13. Ackley SF, Hacker JK, Enanoria WTA, et al. Genotype-specific measles transmissibility: A branching process analysis. Clin Infect Dis. 2018;66(8):1270-1275. doi: 10.1093/cid/cix974

14. Rota PA, Bellini WJ. Update on the global distribution of genotypes of wild type measles viruses. J Infect Dis. 2003;187(Suppl 1):S270-S276. doi: 10.1086/368042

15. Klein N. P., et al. The changing epidemiology of measles in the 21st century. Vaccine. 2019; 37(37): 5485-5492. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.06.017

16. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011;28(10):2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121

17. Letunic I, Bork P. Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: An online tool for phylogenetic tree display and annotation. Nucleic Acids Res. 2021;49(W1):W293-W296. doi: 10.1093/nar/gkab301

18. Ali I. Impact of COVID-19 on vaccination programs: Adverse or positive? Hum Vaccin Immunother. 2020;16(11):2594-2600. doi: 10.1080/21645515.2020.1787065

19. Moss WJ, Griffin DE. Paramyxoviruses: Measles. In: Kaslow RA, Stanberry LR, Powers AM, eds. Viral Infections of Humans. New York, NY: Springer; 2023:1-29. doi: 10.1007/978-1-4939-9544-8_23-1

20. Santibanez S, Hübschen JM, Ben Mamou MC, et al. Molecular surveillance of measles and rubella in the WHO European Region: New challenges in the elimination phase. Clin Microbiol Infect. 2017;23(8):516-523. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.030

21. Chatterjee P., Dutta, A. Molecular methods for the detection of measles virus: Current status and future prospects. Journal of Clinical Virology. 2022; 149: 104213. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2022.104213

22. Lüthy IA, Kantor IN. Measles. Medicina (B Aires). 2020;80(2):162-168. (In Spanish.)

23. Ciceri G, Canuti M, Bianchi S, et al. Genetic variability of the measles virus hemagglutinin gene in B3 genotype strains circulating in Northern Italy. Infect Genet Evol. 2019;75:103943. doi: 10.1016/j.meegid.2019.103943

24. Khan S, Kulp D. Genetic diversity of measles virus strains: Insights from recent outbreaks. Virus Research. 2019;263:198205. doi: 10.1016/j.virusres.2019.198205

25. O’Connor P, Jankovic D, Muscat M, et al. Measles and rubella elimination in the WHO Region for Europe: Progress and challenges. Clin Microbiol Infect. 2017;23(8):504-510. doi: 10.1016/j.cmi.2017.01.003