Перейти к:
Ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях
https://doi.org/10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93
Аннотация
Введение. В обзоре приведены данные ретроспективного анализа заболеваемости холерой и распространенности холерного вибриона в объектах окружающей среды на территориях Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей.
Цель исследования: ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях и на пограничных территориях в период седьмой пандемии и оценка рисков завоза и распространения инфекции.
Материалы и методы. Источники информации – публикации в рецензируемых журналах и данные Референсцентра по мониторингу за холерой за период с 1970 по 2023 г. В SNP-анализе использованы полногеномные сиквенсы ДНК штаммов Vibrio cholerae О1, международных баз данных нуклеотидных последовательностей ДНК – NCBI и ENA, алгоритмы UPGMA и ML, авторское программное обеспечение, MEGA 5.
Результаты. Установлено, что на территориях Донбасского региона (Донецкой и Луганской Народных Республиках, бывших Донецкой и Луганской областей), Запорожской и Херсонской областей имели место осложнения эпидемической ситуации по холере, связанные с завозом инфекции из эндемичных стран и распространением водным и пищевым путями. Пики заболеваемости холерой отмечались в 1970-х и в 1990-х гг. (последняя вспышка – 2011 г.). С 1989 по 2022 г. из водных объектов Донецкой Народной Республики (бывшая Донецкая область) изолировано 490 штаммов V. cholerae О1 (51 токсигенный), в Луганской Народной Республике (бывшая Луганская область) – 8 (2); в Запорожской области – 183 (6), в Херсонской области – 66 (51). Токсигенные штаммы представляли гетерогенную группу вследствие многократных завозов возбудителя. Выявлено сходство генотипов штаммов V. cholerae из воды на отдельных территориях в течение нескольких лет, что свидетельствует о наличии климатических и социальных условий для сохранения и формирования локальных популяций холерного вибриона.
Заключение. Современная эпидемиологическая ситуация по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях стабильная. В связи с чрезвычайной ситуацией и с состоянием инфраструктуры сохраняются высокие риски завоза холеры с эндемичных и с сопредельных территорий и распространения инфекции водным путем. Это свидетельствует о необходимости проведения на данных территориях системного мониторинга за холерой в максимальном объеме мероприятий, предусмотренном для территорий I типа по эпидемическим проявлениям холеры.
Ключевые слова
Для цитирования:
Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Миронова Л.В., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Подойницына О.А., Хунхеева Ж.Ю., Водопьянов А.С., Галачьянц Ю.П. Ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2023;31(11):82-93. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93
For citation:
Popova A.Yu., Noskov A.K., Ezhlova E.B., Kruglikov V.D., Mironova L.V., Monakhova E.V., Chemisova O.S., Podoynitsina O.A., Khunkheeva Zh.Yu., Vodopyanov A.S., Galachyants Yu.P. Retrospective Analysis of the Cholera Situation in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson Regions. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2023;31(11):82-93. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93
Введение. В рамках эпидемиологического надзора за холерой на территории РФ одним из приоритетных направлений является информационный анализ заболеваемости холерой и распространение возбудителя в объектах окружающей среды (ООС) на различных территориях для оценки ситуации, а также выявление внутренних и внешних рисков развития осложнений эпидемиологического характера в аспекте проактивного надзора на путях возможного распространения возбудителя.
В настоящее время в Донбасском регион е (Донецкая Народная Республика (ДНР), Луганская Народная Республика (ЛНР)), Запорожской и Херсонской областях имеет место чрезвычайная ситуация (ЧС) и связанные с ней нарушения социальной инфраструктуры (водоснабжения, водоотведения и др.). Указанные факторы в совокупности с интенсификацией миграционных процессов могут способствовать повышению вероятности осложнения эпидемиологической ситуации по холере в результате завоза этой инфекции, в том числе с пограничных территорий, с последующей реализацией водного пути распространения инфекции [1].
Кроме того, исходя из природно-климатических и социальных особенностей, не исключена возможность создания в определенные сезонные периоды условий, благоприятных для размножения нетоксигенных штаммов, ранее встречавшихся и сохранившихся в ООС (открытых водоемах, сточных водах) как в ДНР и ЛНР, так и на сопредельных территориях с последующим распространением инфекции. Такие штаммы, хотя и не представляют эпидемической опасности, могут вызывать спорадические случаи и даже локальные вспышки острых кишечных инфекций [2–6].
Вышеперечисленные обстоятельства свидетельствуют о необходимости анализа и оценки имевших место эпидемических проявлений холеры на данных территориях.
Цель исследования: ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях и на пограничных территориях в период седьмой пандемии и оценка рисков завоза и распространения инфекции.
Материалы и методы. Использованы данные научных публикаций за период 1993–2023 гг. и информация Референс-центра по мониторингу за холерой ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора» в период с 1970–2023 гг. В биоинформационном анализе использованы полногеномные сиквенсы ДНК холерных вибрионов О1 серогруппы, полученные на платформе MiSeq Illumina1 в рамках федерального проекта «Санитарный щит – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование)», а также найденные в международных базах NCBI (National Center for Biotechnology Information)2 (www.ncbi.nlm.nih.gov) и ENA (European Nucleotide Archive)3 (www.ebi.ac.uk). Сборку геномов, представленных в виде ридов, проводили с использованием программы Spades [7]. Набор из 54 858 единичных нуклеотидных замен (SNP) был составлен на основе данных первичного секвенирования, кластерный анализ и построение дендрограммы проводили с помощью авторского программного обеспечения [8] по методу UPGMA и программы MEGA 5 [9]. Филогеномный анализ ctxA–tcpA+ штаммов проводили с использованием алгоритма, основанного на последовательном применении k-мерного анализа для установления их принадлежности к генетической линии с последующим построением полногеномного SNP-выравнивания, исключением из него блоков рекомбинации и молекулярно-филогенетическим анализом очищенного выравнивания в программе iqtree v.2.0.3 методом максимального правдоподобия (maximum likelihood) [6][10].
Результаты. Эпидемические проявления холеры на пограничных территориях. По доступным данным установлено, что в период с 1970 по 1995 г. на территории Украины было зарегистрировано 2343 случая холеры с двумя пиками заболеваемости, приходящимися на начало 1970-х гг., а также на начало и середину 1990-х гг. Эпидемические осложнения регистрировались с 1970 г. (г. Одесса) вследствие завоза возбудителя из стран Азии с реализацией водного пути передачи инфекции за счет контаминации сточными водами акваторий портов и зон рекреации на Черном море. Впоследствии были зарегистрированы вспышки в Николаевской, Черкасской, Харьковской, Черниговской и других областях4,5. В г. Вилково Одесской области (1991 г.) имела место вспышка, вызванная заносом возбудителя холеры водным путем из Румынии. В этом же году эпидемические осложнения по холере имели место в других городах Одесской области (Одесса, Килия, Балту, Измаил, Арциз), а также в Николаевской области [11][12]. В 1994–1995 гг. на территории Украины была зарегистрирована самая масштабная эпидемия холеры в период седьмой пандемии с водным путем распространения. В этот период времени наиболее выраженные эпидемические проявления холеры отмечались в Республике Крым и в Николаевской области, где вспышка (1994 г.) носила взрывной характер, и основная масса заболевших зарегистрирована за два инкубационных периода, а фактором передачи послужила рыба (тюлька), выловленная в р. Южный Буг. Вспышка 1995 г. имела длительный характер (около пяти месяцев), в этот период было выявлено 467 больных и 319 вибриононосителей, основные пути передачи инфекции – водный и пищевой (сточные воды, морская, пресная вода и морская рыба). Выделенные во время эпидемии из ООС токсигенные штаммы холерного вибриона O1 серотипа Огава, биовара Эль Тор были схожи с клиническими изолятами, что подтверждает роль ООС в распространении болезни [12][13].
Эпидемические проявления холеры в период седьмой пандемии на территории Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей имели место с 1970 по 2011 г. и характеризовались различной степенью интенсивности (рис. 1).
Рис. 1. Территориальное распределение вспышек холеры
в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях
в 1970-е и 1990-е гг. с регистрацией больных и носителей
Fig. 1. Territorial distribution of cholera outbreaks
registered in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson Regions
in the 1970-s and 1990-s
Первый пик заболеваемости отмечен в 70-е гг. XX века (рис. 2). В структуре вовлеченных в эпидпроцесс территорий в 1970-х гг. доминировала Донецкая область, на ее долю приходилось 56,8 % от всех зарегистрированных случаев заболеваний холерой.
Рис. 2. Динамика зарегистрированных случаев холеры/вибриононосительства
в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях с 1970 по 1979 г.
Fig. 2. Registered cases of cholera/vibrio carriers
in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson regions in 1970–1979
Второй пик заболеваемости в период седьмой пандемии холеры в мире приходился на начало 1990-х гг. и был обусловлен как интенсификацией международных миграционных процессов, так и значительными преобразованиями биологических свойств этиологического агента инфекции. Именно в этот период на эндемичных по холере территориях произошло формирование генетически измененного холерного вибриона биовара Эль Тор с повышенным патогенным потенциалом. В Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях с 1990 по 2011 г. также регистрировались серьезные эпидемические осложнения по холере (рис. 3). В это время наибольший удельный вес случаев заболеваний был отмечен в Херсонской области и составил 50,3 % от общего числа заболеваний, зарегистрированных на анализируемых территориях4 [11].
Рис. 3. Динамика зарегистрированных случаев холеры/вибриононосительства
в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях с 1990 по 2011 г.
Fig. 3. Dynamics of the registered cholera cases/vibrio carriers
on the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson regions in 1990–2011
Доминирующий путь передачи в период эпидемических осложнений – водный, обусловленный контаминацией холерным вибрионом водных объектов и инфицированием населения при рекреационном водопользовании. Наряду с этим в отдельных случаях эпидпроцесс был обусловлен реализацией пищевого пути передачи возбудителя.
ДНР (бывшая Донецкая область). Первые эпидемические проявления холеры были зарегистрированы в 1971 г. в гг. Донецке и Марьянске в виде вспышки, вызванной завозом с соседних территорий Украины, в период которой было выявлено 17 больных и 278 вибриононосителей. Доминирующий путь передачи инфекции был связан с контаминацией возбудителем холеры молочных продуктов. Вибриононосители были выявлены среди работников молочно-товарных ферм и Марьянского молокозавода, а также населения Донецка, употреблявшего некипяченое молоко, из проб которого был выделен холерный вибрион. В 1972 и 1973 гг. в Донецке выявлены случаи вибриононосительства, в 1974 г. – два случая заболевания и два – вибриононосительства. Однако, как показали в дальнейшем результаты ПЦР, все эти штаммы оказались нетоксигенными (генотип ctxAB–tcpA–) [14].
Крупная вспышка холеры протекала в г. Мариуполе в 1974 г. с регистрацией 29 больных и 36 вибриононосителей. Эпидпроцесс был обусловлен завозом инфекции из стран Азии на территорию Украины и реализацией водного пути передачи возбудителя при рекреационном водопользовании. Фактор передачи – морская вода в акватории портов и зонах рекреации, контаминированная холерным вибрионом в результате сброса сточных вод. В последующем, в 1991 г., в Донецке зарегистрирован один случай холеры. В 1994 г. в Мариуполе зарегистрирована вспышка холеры, в период которой выявлены 21 больной и 45 вибрионосителей. Вспышка протекала на фоне эпидемии холеры на Украине, происхождение которой, по-видимому, обусловлено завозом из Республики Дагестан, где в июле – августе 1994 г. регистрировались крупные эпидемические осложнения по холере. Отмечено, что токсигенные штаммы V. cholerae, циркулировавшие в Дагестане, по своим биологическим свойствам были идентичны выделенным на Украине. Эпидемический процесс в Мариуполе был связан с контаминацией водопроводной воды за счет аварий на водопроводной и канализационной сетях, подачей воды с перебоями, отрицательным давлением в водопроводе. Впоследствии наблюдалось распространение возбудителя инфекции контактным и пищевым путями передачи6 [11][15] Вместе с тем имело место сходство обнаруженного возбудителя с с этиологическим агентом эпидемического осложнения 1993 г. (г. Одесса) [12][13][16].
Последнее эпидемическое осложнение по холере в ДНР (бывшая Донецкая область), вызванное токсигенным штаммом возбудителя (V. cholerae Ol El Tor Ogawa ctxA+tcpA+), было зарегистрировано в Мариуполе в 2011 г., в период которого заболело 33 человека, выявлено 25 вибриононосителей. Среди инфицированных 30 проживали в Мариуполе, один – в Волновахском районе, двое прибывших на отдых на Азовское побережье – в РФ [11][15]. Случаи заболевания регистрировали у лиц в возрасте от 25 до 90 лет, по гендерному составу: у 20 мужчин (62,5 %) и 12 женщин (37,5 %). Удельный вес пожилых лиц среди заболевших составил 59,4 %. Социальный состав пострадавших представлен рабочими предприятий города (32,0 %), пенсионерами (20,8 %), лицами без определенного места жительства (9,3 %). Развитию вспышки способствовали интенсивные дождевые осадки, подтопления частных канализационных колодцев, аварии в централизованной канализационной системе города, несанкционированные сбросы сточных вод в ливневую канализацию и впоследствии в реки Кальчик, Кальмиус и Азовское море. Основной путь передачи возбудителя – пищевой, фактор передачи – рыба, выловленная в контаминированной холерными вибрионами речной и морской воде. Заболеваемость регистрировали во всех районах города, но наибольшее число больных отмечено в Ильичевском и Жовтневском, наиболее близко расположенным к рекам Кальчик и Кальмиус [17][18].
ЛНР (бывшая Луганская область). По данным Референс-центра по мониторингу за холерой эпидемические проявления холеры регистрировали в 1994 г. (два заболевших, один вибрионоситель).
Запорожская область. Вспышка холеры имела место в 1974 г. в г. Бердянске, когда с 26 июня по 25 августа было выявлено 29 больных и 95 вибриононосителей, показатель заболеваемости составил 5,8 на 100 тыс. населения6,7. Доказана преимущественная роль водного фактора в возникновении вспышки – заражение 85,5 % человек произошло при рекреационном водопользовании [11][13]. В 1994 г. (сентябрь – октябрь) на фоне крупномасштабной эпидемии холеры на Украине в Каменско-Днепровском районе Запорожской области зарегистрирована вспышка с девятью заболевшими и 28 вибриононосителями.
После отсутствия на протяжении более чем 20 лет информации в доступных источниках литературы о случаях заболевания холерой в Запорожской области один случай заболевания выявлен в 2016 г. у ребенка, из клинического материала изолирован нетоксигенный холерный вибрион О1 Эль Тор Огава. При эпидемиологическом расследовании установлено, что заболевший купался в реке Молочной8. Кроме того, единичные случаи инфицирования нетоксигенным вариантом V. cholerae О1 или nonО1/ nonО139 зарегистрированы в Запорожской области в 2017 и в 2018 гг.9
Херсонская область. В 1970 г. была зарегистрирована вспышка холеры, обусловленная завозом инфекции из г. Одессы. Всего было выявлено 16 больных и шесть вибриононосителей, 70 % случаев инфицирования были связаны с реализацией вод ного пути передачи инфекции7. Позднее, в 1972 г., крупная вспышка холеры протекала в Херсоне, в период которой было выявлено 16 больных и 136 вибриононосителей. От инфицированных лиц выделен токсигенный штамм V. cholerae О1 El Tor Inaba. Показатель заболеваемости составил 14,1 на 100 тыс. населения. Возникновение вспышки было обусловлено завозом инфекции из г. Астрахани, что подтверждалось сходством биологических свойств возбудителя и отсутствием выделения этого сероварианта возбудителя от людей и из объектов окружающей среды в Херсоне в период, предшествующий вспышке. В 1991 г. на территории области отмечалась вспышка холеры, в период которой заболело 10 человек, выявлено 19 вибрионосителей. Установлен основной путь передачи – водный. По биологическим свойствам выделенные штаммы возбудителя были отнесены к токсигенным, большая часть из них принадлежала к 19-му фаготипу, который был распространен среди штаммов V. cholerae, выделенных в Николаевской области Украины в данный период. Во время масштабных эпидемических осложнений на Украине в 1994–1995 гг. вспышки холеры в Херсонской области были зарегистрированы в 1994 г. (68 больных и 49 вибрионосителей) и в 1995 г. (10 больных и 21 вибриононоситель). Отдельные завозные случаи холеры имели место в 1991, 1993, 1994 и 1995 гг.6,7 Необходимо отметить, что эпидемически опасные вибрионы Эль Тор обнаруживались в пробах из ООС на указанных территориях во время зарегистрированных эпидемических осложнений. Так, в 1994 г. 20 из 39 изолированных из водных ООС в Донецкой области штаммов были отнесены к эпидемически опасным. В 2011 г. в Мариуполе из 31 исследуемой пробы, в т. ч. вода морская, пресных водоемов, техническая и сточная вода промышленных предприятий, городских канализационных сооружений, рыба, креветки, были изолированы штаммы V. cholerae O1 ctxA+tcpA+, идентичные по серологическим, биохимическим свойствам, чувствительности к фагам и гемолитической активности штаммам, выделенным от больных и носителей в период вспышки.
По данным Референс-центра по мониторингу за холерой, (с учетом информационных материалов бывшей Крымской противочумной станции) в период 1989–2022 гг. в ДНР (бывшая Донецкая область) из водных ООС изолирован 51 токсигенный штамм, в ЛНР (бывшая Луганская область) – 2, в Запорожской области – 6, в Херсонской области – 44, причем доля штаммов, выделенных из сточных вод во время вспышек, составила 51,5 % от общего числа.
В целях установления связей между токсигенными штаммами, выделенными в различных регионах Донбасса, Запорожской и Херсонской областях, а также их возможного происхождения проведен SNP-анализ полногеномных сиквенсов ДНК. Выборка включала изоляты 1991–1995 и 2011 гг., а также ряд геномов штаммов из других регионов мира, размещенных в международных базах NCBI и ENA.
В результате установлено, что включенные в выборку штаммы V. cholerae распределились на семь кластеров, при этом выделенные в различных регионах Донбасса, Запорожской и Херсонской областях входят в состав пяти кластеров (рис. 4).
Рис. 4. Дендрограмма, построенная по итогам SNP-анализа
геномов токсигенных штаммов V. cholerae
по алгоритму UPGMA c использованием набора из 54858 SNP
Fig. 4. The dendrogram constructed based on the results of SNP analysis
of genomes of toxigenic V. cholerae strains
using the UPGMA algorithm and a set of 54,858 SNPs
В частности, изоляты из Херсонской области в 1991 г. входят в кластеры B и C, включающие в том числе штаммы, изолированные на территории Одесской и Николаевской областей. Штаммы, выделенные в период масштабной эпидемии в 1994 году, представляют довольно гетерогенную группу, распределившись между тремя различными кластерами: D, E и G. Примечательно, что штаммы этих кластеров в это же время выделялись как в других субъектах РФ (Республика Дагестан, города Омск, Барнаул, Новосибирск), так и в ряде зарубежных стран (Индия, Турция, Алжир, Румыния, Палестина, Албания, Италия). Наконец, штаммы, вызвавшие вспышку холеры в Мариуполе в 2011 году, образовали отдельный кластер F, в который также вошли штаммы, изолированные на Гаити (2010 г.) и в Москве (2010 и 2012 гг.). Принадлежность этих штаммов к «гаитянской» группе была установлена ранее рядом авторов [19–22], и образование ими отдельного, отличного от остальных кластера является еще одним подтверждением этих данных.
Таким образом, исследуемые токсигенные штаммы представляют собой довольно гетерогенную группу, что может быть следствием многократных завозов возбудителя.
В 1995 г. в г. Мариуполе зарегистрировано два случая вибриононосительства V. cholerae О1 El Tor. Факт ором передачи послужила рыба, выловленная в р. Кальмиус. Выделенные штаммы содержали ген tcpA при отсутствии ctxA. Последующие эпидосложнения 1999 г. в Мариуполе также были обусловлены вариантом холерного вибриона с генотипом ctxAB–tcpA+.
При филогенетическом анализе клинические штаммы, выделенные в Мариуполе (1995, 1999) и в Запорожской области (1999), вошли в состав линии L3, сублинии L3b, для которой характерен генотип ctxA–tcpA+ (рис. 5).
Рис. 5. Фрагмент дендрограммы,
реконструированной с помощью метода максимального правдоподобия (ML)
на основании филогеномного анализа ctxAB–tcpA+ штаммов холерного вибриона
филогенетической линии L3b
Fig. 5. Fragment of a dendrogram
reconstructed using the maximum likelihood (ML) estimation
based on a phylogenomic analysis of ctxAB–tcpA+ strains of Vibrio cholerae
of the L3b phylogenetic line
Оценка контаминации холерным вибрионом поверхностных водоемов и других ООС в ДНР (бывшая Донецкая область), ЛНР (бывшая Луганская область), Запорожской и Херсонской областях основывалась на результатах мониторинговых исследований, которые проводились на территории бывшего СССР с 1970-х гг. Исследования были направлены на выявление и предотвращение рисков реализации водного пути передачи инфекции. На территории ДНР (бывшая Донецкая область) насчитывается семь крупных водохранилищ питьевого назначения, открытый канал Северский Донец – Донбасс протяженностью 132 км, 232 реки и около 3 тыс. прудов и озер, в которых вода хорошо прогревается в летнее время, рН среды находится в пределах 7,2–7,4. Протяженность морского побережья Азовского моря – 120 км.7
Во время VII пандемии холеры в Донецкой области в период с 1970 по 1988 г. из поверхностных водоемов и сточных вод выделено 692 нетоксигенных и токсигенных штаммов V. cholerae O1, которые обнаруживались в водоемах 14 населенных пунктов. С 2002 по 2004 г. штаммы холерного вибриона О1 серогруппы постоянно выделяли в летний период в Ольховском питьевом водохранилище г. Харцызска, в прудах в черте г. Донецка, Азовском море, реках Кальчик и Кальмиус в черте г. Мариуполя. С 2002 по 2004 г. холерные вибрионы О1 серогруппы выделяли из воды Светлодарского водохранилища г. Дебальцево. В 2002 г. на территории Донецкой области было изолировано 36 штаммов V. cholerae O1. В 2006 г. выделено 22 культуры. Большинство холерных вибрионов выделили из проб морской и речной воды. Максимальный удельный вес штаммов, выделенных из проб воды прудов и сточных вод, приходился на гг. Донецк, Красноармейск и Мариуполь (29, 35,7 и 14,5 % соответственно)10.
По данным Референс-центра по мониторингу за холерой (с учетом информационных материалов бывшей Крымской противочумной станции) с 1989 по 2022 г. в ДНР (бывшая Донецкая область) из ООС всего было изолировано 490 штаммов холерного вибриона О1 различной эпидемической значимости. Из них 57,3 % штаммов выделено из проб пресной воды, 15,7 % – морской воды, 20,8 % – сточных вод, 1,8 % – от рыбы и 4,4 % – из смывов. Максимальный удельный вес выделенных штаммов приходится на период 1990–1999 гг. – 51,6 %. В 2000–2009 гг. выделено 33,3 % штаммов, а в 2010–2019 гг. – 14,7 % (рис. 6).
Рис. 6. Динамика изоляции штаммов V. cholerae O1
из объектов окружающей среды ДНР в 1989–2022 гг.
Fig. 6. Dynamics of isolation of V. cholerae O1 strains
from environmental media in the DPR in 1989–2022
Что касается нетоксигенных штаммов, то по имеющейся информации 4 и по данным Референс-центра по мониторингу за холерой (с учетом информационных материалов бывшей Крымской противочумной станции) на территории ДНР (бывшая Донецкая область) всего в период 1989–2022 гг. из водных ООС изолировано 439 ctx–tcp– штаммов. Нетоксигенные холерные вибрионы О1 серогруппы выделялись в основном из морской, речной и сточной воды. В 2012–2013 гг. были изолированы единичные нетоксигенные штаммы V. cholerae Ol El Tor Ogawa, Inaba.
C 2015 по 2022 г. на территориях нынешних ДНР и ЛНР проводился плановый мониторинг поверхностных водоемов на вибриофлору с ежегодным исследованием более 800 проб. В ДНР за этот период выделено 25 нетоксигенных штаммов V. cholerae О1.
В Луганской области с 1970 по 1988 г. было изолировано шесть нетоксигенных штаммов холерного вибриона О1 из поверхностных водоемов и из сточных вод. За 1989–2022 гг. из водных ООС изолировано шесть таких штаммов.
В Херсонской области (г. Херсон) с 1970 по 1988 г. из поверхностных водоемов и сточных вод выделено 15 штаммов холерного вибриона О18. Всего в период 1989–2022 гг. из водных ООС изолировано 22 нетоксигенных штаммов холерного вибриона О1. В благополучный по холере период вибрионы О1 серогруппы выделялись преимущественно из проб пресной воды.
В Запорожской области с 1970 по 1988 г. в гг. Запорожье, Мелитополе, Бердянске из ООС выделено 53 ctx–tcp– штамма холерного вибрионы О1 серогруппы8. За период 1989–2022 гг. из поверхностных водоемов и других объектов (рыба, смывы в очаге, сточные воды) в Запорожской области изолировано 177 нетоксигенных штаммов холерного вибриона О1.
В связи с этим необходимо проведение динамичного наблюдения за выделением штаммов холерного вибриона О1 и геномного мониторинга изолированных культур.
Результаты молекулярно-генетического исследования нетоксигенных ctx–tcp– штаммов показали, что они, как отмечено выше, ранее постоянно обнаруживались в ООС и их выделение продолжается вплоть до настоящего времени в рамках усиленного мониторинга за холерой на изучаемых территориях. На рис. 7 показана дендрограмма, построенная по результатам SNP-анализа полных геномов изолятов последнего десятилетия в сравнении с некоторыми штаммами из других регионов.
Рис. 7. Дендрограмма, построенная по итогам SNP-анализа
геномов нетоксигенных (ctx– tcp–) штаммов V. cholerae, выделенных из ООС,
по алгоритму UPGMA c использованием набора из 54 858 SNP
Fig. 7. The dendrogram constructed based on the results of SNP analysis
of genomes of non-toxigenic (ctx– tcp–) V. cholerae environmental isolates
using the UPGMA algorithm and a set of 54,858 SNPs
Все они имели генотип ctx–tcp–, но, несмотря на отсутствие эпидемической опасности, потенциально могли вызвать у населения острые диарейные заболевания за счет экспрессии других факторов патогенности, которые присутствовали в их геномах в различных сочетаниях. Группа отличалась характерной для нетоксигенных вибрионов значительной гетерогенностью. Тем не менее обращает на себя внимание близкое родство штаммов, выделенных в разные годы как на территориях различных регионов Донбасса, Запорожской и Херсонской областей (кластеры B, D, F), так и в других регионах (кластер С).
В 2023 г. на территории новых субъектов РФ проводится плановый мониторинг поверхностных водоемов и сточных вод на вибриофлору по актуализированным стационарным точкам отбора: в ДНР – по 102 точкам, в ЛНР – по 63, в Запорожской области – по 16, а в Херсонской области – по 29.
Наряду с вышеизложенным относительно мониторинга за холерой на территориях новых субъектов РФ, считаем необходимым учитывать данные о выделении в 2022 г. на территории ДНР нетоксигенных штаммов V. сholeraе nonО1/nonO139 от больных ОКИ, что показывает наличие контактов населения с ООС, контаминированными холерными вибрионами, а также о повышенном уровне риска распространения инфекции в случае попадания токсигенного штамма – возбудителя холеры в водные экосистемы [1].
Обсуждение. На территории Украины в период VII пандемии холеры имели место разной степени интенсивности эпидемические осложнения, связанные с завозом инфекции из эндемичных стран и последующим ее распространением, в основном водным и пищевыми путями, в том числе на территориях Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей. С 1970 по 1995 г. на Украине были отмечены два пика заболеваемости холерой – в начале 1970-х гг. и в начале и в середине 1990-х гг., в т. ч. и в Донецкой и Луганской, Запорожской, Херсонской областях. В структуре вовлеченных в эпидпроцесс территорий доминировали Донецкая и Херсонская области. Не исключено, что эпидемические осложнения 1994–1995 гг. могли быть связаны с завозом инфекции из Республики Дагестан, где в июле-августе 1994 г. протекала эпидемия холеры, поскольку циркулировавшие в Дагестане штаммы V. cholerae по биологическим свойствам были идентичны выделенным на Украине [13][14].
Последняя вспышка холеры, зарегистрированная в Донецкой области в 2011 г., была связана с завозом инфекции из эндемичной по холере страны с реализацией водного пути передачи. Вместе с тем, обнаружение холерного вибриона в водоеме Одесской области накануне эпидемии (в 1993 г.) и нарастание числа вибриононосителей на указанной территории в этот же период, а также сходство биологических свойств изолятов из Одессы с этиологическим агентом эпидемических осложнений 1994–1995 гг. позволило Clark C.G. et al. [12][13][16] предположить возможность сохранения возбудителя в межэпидемический период в ООС на Украине с последующим взрывообразным развитием эпидемии при наступлении благоприятных климатических условий.
С 1989 по 2022 г. из водных ООС в ДНР (бывшая Донецкая область) изолировано 490 штаммов (51 токсигенный), в ЛНР (бывшая Луганская область) – 8 (2), в Запорожской области – 183 (6), в Херсонской области – 66 (44). Токсигенные штаммы выделялись до 2011 г. включительно. Прослеживалась связь между возникновением эпидемических осложнений по холере на территориях Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей и завозами на Украину с распространением инфекции. Так, биоинформационный анализ выделенных штаммов показал, что токсигенные штаммы, изолированные на этих территориях, представляют собой гетерогенную группу, что может быть следствием многократных завозов возбудителя.
Токсигенные штаммы, выделенные в Мариуполе (1995, 1999) и в Запорожской области (1999), принадлежали филогенетической линии L3, сублинии L3b, для которой характерен генотип ctxA–tcpA+. Впервые указанная филогенетическая линия, включающая штаммы V. cholerae с побережья Мексиканского залива США (обозначенные как US Gulf группа), была идентифицирована Mutreja et al. [23] при изучении закономерностей глобального распространения холеры в период седьмой пандемии. Позднее было показано [24], что изоляты линии L3 входят в самостоятельную группу, дивергировавшую в процессе эволюции пандемичного клона вибриона Эль Тор, а US Gulf-подобные варианты распространены на востоке Китая и обнаруживаются в материале от больных с диареей, вибриононосителей и в ООС [25] и дифференцируются на сублинии, характеризующиеся территориально-временными особенностями [6]. Данные о том, что относящиеся к филогенетической линии L3 штаммы исходно могут нести в геноме нестабильные формы СТХ профага [25], обнаружение демонстрирующих принадлежность к L3b-подобной линии токсигенных изолятов [10], а также случаи выделения их от лиц с клиническими проявлениями диареи свидетельствуют о клинико-эпидемиологическом значении этих вариантов холерного вибриона.
Выделение нетоксигенных штаммов из ООС свидетельствует о наличии в водных объектах оптимальных условий для сохранения и формирования локальных популяций холерного вибриона, а также о потенциальной возможности накопления токсигенных вариантов возбудителя при их заносе и вероятности последующего распространения инфекции водным путем.
Нетоксигенные штаммы, содержащие гены tcp, могут обладать повышенным патогенным потенциалом, поскольку токсин-корегулируемые пили обеспечивают эффективную колонизацию кишечника хозяина. Несмотря на отсутствие эпидемической опасности, такие штаммы потенциально могли вызвать у населения острые диарейные заболевания за счет экспрессии других факторов патогенности, которые присутствовали в их геномах в различных сочетаниях [5][6].
Близкое родство штаммов, выделенных в разные годы на территориях Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей свидетельствует в пользу возможного длительного сохранения холерных вибрионов в ООС, а также их заносов извне за счет тесных транспортных связей и других путей распространения, а также подчеркивает необходимость дальнейшего мониторинга, значимость которого возрастает при нынешнем состоянии инфраструктуры и рисков возникновения чрезвычайных ситуаций.
Заключение. Таким образом, проведенный ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях выявивший отсутствие эпидемических проявлений после 2011 г., и анализ динамики выделения культур холерного вибриона О1 из воды поверхностных водоемов, показавший отсутствие выделения из ООС токсигенных штаммов возбудителя с этого же времени, позволяет оценить современную эпидемиологическую ситуации по холере на указанных территориях как стабильную. Вместе с тем сохраняются повышенные риски завоза холеры с эндемичных и с пограничных территорий, а в связи с ЧС и при нынешнем состоянии социальной инфраструктуры – угрозы распространения инфекции водным путем. Это свидетельствует о необходимости проведения в ДНР, ЛНР, Запорожской и Херсонской областях системного мониторинга за холерой в максимальном объеме мероприятий, предусмотренном для территорий I типа по эпидемическим проявлениям холеры с оперативным молекулярно-генетическим изучением изолированных культур.
1. Санитарный щит – безопасность для здоровья (предупреждение, выявление, реагирование). [Электронный ресурс] Режим доступа: https://www.rospotrebnadzor.ru (дата обращения: 14.03.2023).
2. The National Center for Biotechnology Information (NCBI). [Электронный ресурс] Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov (дата обращения: 14.03.2023).
3. The European Nucleotide Archive (ENA). [Электронный ресурс] Режим доступа: https://www.ebi.ac.uk (дата обращения: 19.03.2023).
4. Покровский В.И., ред. Холера в СССР в период VII пандемии. М.: Медицина, 2000.
5. Алексеенко В.В. Холера в Украине. История и современность. Кировоград: Цент. – Укр. Изд-во. 2007. 171 с.
6. Алексеенко В.В. Холера в Украине. История и современность. Кировоград: Цент. – Укр. Изд-во. 2007. 171 с.
7. Покровский В.И., ред. Холера в СССР в период VII пандемии. М.: Медицина, 2000.
8. International Society For Infectious Diseases. PRO/RUS> Холера – Украина (Мелитополь) (3). ArchiveNumber: 20160723.4364995. [Электронный ресурс] Режим доступа: https://promedmail.org/promed-post/?id=4364995 (дата обращения: 19.03.2023).
9. International Society for Infectious Diseases. PRO/RUS> Холероподобное заболевание – Украина (Запорожье). Archive Number: 20170822.5267926. [Электронный ресурс] Режим доступа: https://promedmail.org/promed-post/?id=5267926 (дата обращения: 19.03.2023).
10. Справочник-кадастр распространения вибрионов эльтор в поверхностных водоемах и сточных водах на территории СССР во время 7-й пандемии холеры. Ростов-на-Дону, 1991.171 c.
Список литературы
1. Носков А.К., Кругликов В.Д., Москвитина Э.А. и др. Холера: анализ и оценка эпидемиологической обстановки в мире и России. Прогноз на 2023 год // Проблемы особо опасных инфекций. 2023. № 1. С. 56–66 (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2023-1-56-66
2. Онищенко Г.Г., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А. и др. Холера, обусловленная Vibrio cholerae O1 ctxAB–tcpA+ // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2007. № 1. С. 23–29.
3. Lizárraga-Partida ML, Quilici ML. Molecular analyses of Vibrio cholerae O1 clinical strains, including new nontoxigenic variants isolated in Mexico during the Cholera epidemic years between 1991 and 2000. J Clin Microbiol. 2009;47(5):1364-1371. doi: 10.1128/JCM.00720-08
4. Islam A, Labbate M, Djordjevic SP, et al. Indigenous Vibrio cholerae strains from a non-endemic region are pathogenic. Open Biol. 2013;3(2):120181. doi: 10.1098/rsob.120181
5. Титова С.В., Монахова Е.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-корегулируемых пилей адгезии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016. № 5. С. 65–72.
6. Wang H, Yang C, Sun Z, et al. Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages. PLoS Negl Trop Dis. 2020;14(2):e0008046. doi: 10.1371/journal.pntd.0008046
7. Bankevich A, Nurk S, Antipov D, et al. SPAdes: A new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol. 2012;19(5):455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021
8. Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О. и др. Молекулярная эпидемиология Vibrio cholerae – разработка алгоритма анализа данных полногеномного секвенирования // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2016. Т. 21. № 3. С. 146–152.
9. Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011;28(10):2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121
10. Yan H, Pang B, Lu X, et al. Cholera caused by a new clone of serogroup O1 Vibrio cholerae – Beijing Municipality, China, June 2021. China CDC Wkly. 2022;4(2):31-32. doi: 10.46234/ccdcw2021.279
11. Онищенко Г.Г., Попова А.Ю., Москвитина Э.А. и др. Определение типов эпидемических проявлений холеры в субъектах Крымского федерального округа (Республики Крым) // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 6. С. 37–43.
12. Clark CG, Kravetz AN, Alekseenko VV, Krendelev YuD, Johnson WM. Microbiological and epidemiological investigation of cholera epidemic in Ukraine during 1994 and 1995. Epidemiol Infect. 1998;121(1):1–13. doi: 10.1017/s0950268898008711
13. Clark CG, Kravetz AN, Dendy C, Wang G, Tyler KD, Johnson WM. Investigation of the 1994-5 Ukrainian Vibrio cholerae epidemic using molecular methods. Epidemiol Infect. 1998;121(1):15-29. doi: 10.1017/s0950268898008814
14. Монахова Е.В., Смоликова Л.М., Божко Н.В. ПЦР-детекция генов системы секреции третьего типа (TTSS) и других факторов патогенности/персистенции у холерных вибрионов различных серогрупп // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. № 6. С. 20–25. doi: 10.17816/EID40460
15. Алексеенко В.В. Проблема холери в Украiнi // Інфекційні хвороби. 2008. № 4. С. 5–12.
16. Савельева И.В., Тихонов С.Н., Савельев В.Н. и др. Ретроспективный анализ биологических и молекулярногенетических свойств штаммов возбудителя холеры, выделенных в Украине в 1994–2011 гг. // Журнал. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. Т. 94. № 1. С. 49–55. doi: 10.36233/0372-9311-2017-1-49-55
17. Домашенко О.Н., Беломеря Т.А., Мартынова Н.В. и др. Холера в Приазовье // Журнал инфектологии. 2015. Т. 7. № 2. С. 92–97.
18. Беломеря Т.А., Дараган Г.Н., Денисенко В.И. и др. Организация противоэпидемических мероприятий по локализации очага холеры в Донецкой области // Медицинский вестник Юга России. 2014. №2. С. 118–122.
19. Kuleshov KV, Kostikova A, Pisarenko SV, et al. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infect Genet Evol. 2016;44:471–478. doi: 10.1016/j.meegid.2016.07.039
20. Smirnova NI, Krasnov YM, Agafonova EY, Shchelkanova EY, Alkhova ZV, Kutyrev VV. Whole-genome sequencing of Vibrio cholerae O1 El Tor strains isolated in Ukraine (2011) and Russia (2014). Genome Announc. 2017;5(8):e0164016. doi: 10.1128/genomeA.01640-16
21. Monakhova EV, Ghosh A, Mutreja A, Weill F-X, Ramamurthy T. Endemic cholera in India and imported cholera in Russia: What is Common? Problemy Osobo Opasnykh Infektsiy. 2020;(3):17–26 (In Engl.). doi: 10.21055/03701069-2020-3-17-26
22. Смирнова Н.И., Рыбальченко Д.А., Плеханов Н.А., Лозовский Ю.В., Федоров А.В., Кутырев В.В. Новые генетические варианты возбудителя холеры и их распространение в эндемичных странах и России. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т. 41. № 1. С. 10–17. doi:10.17116/molgen20234101110.
23. Mutreja A, Kim DW, Thomson NR, et al. Evidence for several waves of global transmission in the seventh cholera pandemic. Nature. 2011;477(7365):462-465. doi: 10.1038/nature10392
24. Hu D, Liu B, Feng L, et al. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc Natl Acad Sci USA. 2016;113(48):E7730-E7739. doi: 10.1073/pnas.1608732113
25. Luo Y, Octavia S, Jin D, et al. US gulf-like toxigenic O1 Vibrio cholerae causing sporadic cholera outbreaks in China. J Infect. 2016;72(5):564-572. doi: 10.1016/j.jinf.2016.02.005
Об авторах
А. Ю. ПоповаРоссия
Попова Анна Юрьевна – д.м.н., проф., заслуженный врач РФ, руководитель; заведующий кафедрой организации санитарно-эпидемиологической службы
Вадковский пер., д. 18, г. Москва, 127994
ул. Баррикадная, д. 2/1, г. Москва, 125993
А. К. Носков
Россия
Носков Алексей Кимович – к.м.н., директор
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
Е. Б. Ежлова
Россия
Ежлова Елена Борисовна – к.м.н., заместитель руководителя
Вадковский пер., д. 18, г. Москва, 127994
В. Д. Кругликов
Россия
Кругликов Владимир Дмитриевич – д.м.н., главный научный сотрудник отдела микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
Л. В. Миронова
Россия
Миронова Лилия Валерьевна – д.м.н., заместитель директора по научной и лабораторно-диагностической работе
ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047
Е. В. Монахова
Россия
Монахова Елена Владимировна – д.б.н., главный научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
О. С. Чемисова
Россия
Чемисова Ольга Сергеевна – к. биол. н., ведущий научный сотрудник, врио заместителя директора по научной и экспериментальной работе
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
О. А. Подойницына
Россия
Подойницына Оксана Андреевна – к.б.н., старший научный сотрудник отдела микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
Ж. Ю. Хунхеева
Россия
Хунхеева Жанна Юрьевна – врач-бактериолог лаборатории холеры
ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047
А. С. Водопьянов
Россия
Водопьянов Алексей Сергеевич – к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии природно-очаговых и зоонозных инфекций
ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002
Ю. П. Галачьянц
Россия
Галачьянц Юрий Павлович – к.б.н., научный сотрудник отдела научного и учебно-методического обеспечения
ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047
Рецензия
Для цитирования:
Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Миронова Л.В., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Подойницына О.А., Хунхеева Ж.Ю., Водопьянов А.С., Галачьянц Ю.П. Ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2023;31(11):82-93. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93
For citation:
Popova A.Yu., Noskov A.K., Ezhlova E.B., Kruglikov V.D., Mironova L.V., Monakhova E.V., Chemisova O.S., Podoynitsina O.A., Khunkheeva Zh.Yu., Vodopyanov A.S., Galachyants Yu.P. Retrospective Analysis of the Cholera Situation in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson Regions. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2023;31(11):82-93. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93