Preview
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Этиология внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения Covid-19 и оценка риска возникновения пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи

https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75

Полный текст:

Аннотация

Введение. Пандемия COVID-19 в 2020 году внесла свой вклад в эпидемиологию респираторных инфекций. Важным является своевременное проведение дифференциальной диагностики COVID-19 и сезонных острых респираторных заболеваний. У пациентов с новой коронавирусной инфекцией возрастает риск развития госпитальной пневмонии. Актуальным является анализ особенностей циркуляции резистентных к антибактериальным химиопрепаратам штаммов возбудителей внутрибольничных инфекций.
Цель – изучение этиологической структуры внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения COVID-19 и оценка рисков возникновения пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи.
Материалы и методы. Исследовали биологический материал от 446 пациентов с диагнозом «внебольничная пневмония», находившихся на амбулаторном лечении или в стационарах г. Ростова-на-Дону. Верификация респираторных вирусов, включая РНК SARS-CoV-2, а также M. pneumoniae, C. pneumoniae, L. pneumophila выполнена методом полимеразной цепной реакции в мазках носоглотки. Бактериологический анализ мокроты проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентификацию выделенных патогенов осуществляли с помощью времяпролетной масс-спектрометрии на приборе Autoflex (Bruker Daltonics) c программным обеспечением BioTyper 3,0.
Результаты и обсуждение. В период распространения новой коронавирусной инфекции в Ростовской области доля положительных результатов на SARS-CoV-2 среди пациентов с диагнозом «внебольничная пневмония» составляет 35,6 %. Частота микст-инфекций вирусной природы достоверно не отличалась среди пациентов с лабораторно подтвержденным диагнозом COVID-19 и пациентов с отрицательным результатом на SARS-CoV-2 (25,9 и 26,2 % соответственно). В структуре микробиоты пневмоний, не обусловленных SARS-CoV-2, превалировали грибы рода Candida и плазмокоагулирущие стафилококки. Достоверно чаще от пациентов с лабораторно подтвержденным COVID-19 изолировали культуры неферментирующих грамотрицательных бактерий. У 51,6 % пациентов, проходивших лечение в стационаре, отмечено вторичное коинфицирование, вероятно, связанное с объектами внешней среды или с передачей инфекции от персонала. Передача ИСМП между пациентами не установлена.

Об авторах

А. Ю. Попова
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования
Россия

Попова Анна Юрьевна – д-р мед. наук, профессор, руководитель Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, главный государственный санитарный врач Российской Федерации; заведующий кафедрой организации санитарно-эпидемиологической службы ФГБОУ Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России

пер. Вадковский, д. 18, г. Москва, 127994
ул. Баррикадная, д. 2/1, г. Москва, 125993



Е. Б. Ежлова
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Россия

Ежлова Елена Борисовна – канд. мед. наук, заместитель руководителя

пер. Вадковский, д. 18, г. Москва, 127994



Ю. В. Демина
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования
Россия

Демина Юлия Викторовна – д-р мед. наук, заместитель начальника управления эпидемиологического надзора Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, профессор кафедры организации санитарно-эпидемиологической службы ФГБОУ Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования Минздрава России

пер. Вадковский, д. 18, г. Москва, 127994
ул. Баррикадная, д. 2/1, г. Москва, 125993



А. К. Носков
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Носков Алексей Кимович – канд. мед. наук, директор

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



Е. В. Ковалев
Управление Роспотребнадзора по Ростовской области
Россия

Ковалев Евгений Владимирович – руководитель

ул. 18-я линия, д. 17, г. Ростов-на-Дону, 344019



Г. В. Карпущенко
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ростовской области» Роспотребнадзора
Россия

Карпущенко Гарри Викторович – канд. мед. наук, главный врач

ул. 7-я линия, д.67, г. Ростов-на-Дону, 344019



О. С. Чемисова
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Чемисова Ольга Сергеевна – канд. биол. наук, заведующая музеем живых культур

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



Н. Л. Пичурина
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Пичурина Наталья Львовна – канд. мед. наук, заведующая лабораторией эпидемиологии особо опасных инфекций

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



Н. В. Павлович
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Павлович Наталья Владимировна – д-р мед. наук, заведующая лабораторией

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



С. О. Водопьянов
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Водопьянов Сергей Олегович – д-р мед. наук, заведующий лабораторией биохимии микробов

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



Е. Н. Гудуева
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора
Россия

Гудуева Елена Николаевна – мл. науч. сотр. музея живых культур

ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002



С. С. Слись
Управление Роспотребнадзора по Ростовской области
Россия

Слись Сергей Сергеевич – главный специалист-эксперт отдела эпидемиологического надзора

ул. 18-я линия, д. 17, г. Ростов-на-Дону, 344019



Н. Ю. Пшеничная
ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия

Пшеничная Наталья Юрьевна – д-р мед. наук, профессор, заместитель директора по клинико-аналитической работе

ул. Новогиреевская, д. 3а, г. Москва, 111123



А. Р. Литовко
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ростовской области» Роспотребнадзора
Россия

Литовко Анна Радиковна – заведующая вирусологической лабораторией

ул. 7-я линия, д.67, г. Ростов-на-Дону, 344019



Н. Ю. Асмолова
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Ростовской области» Роспотребнадзора
Россия

Асмолова Наталья Юрьевна – врач-вирусолог вирусологической лаборатории

ул. 7-я линия, д.67, г. Ростов-на-Дону, 344019



Список литературы

1. Baiou A, Elbuzidi AA., Bakdach D, et al. Clinical characteristics and risk factors for the isolation of multi-drug-resistant Gram-negative bacteria from critically ill patients with COVID-19. J Hosp Infect. 2020;110:165–171. doi: 10.1016/j.jhin.2021.01.027

2. Atzrodt С, Maknojia I, McCarthy RDP, et al. A Guide to COVID-19: a global pandemic caused by the novel coronavirus SARS-CoV-2. FEBS J. 2020;287(17):3633–3650. doi: 10.1111/febs.15375

3. Wang T, Zhao M, Ye P, Wang Q, Zhao Y. Integrated bioinformatics analysis for the screening of associated pathways and therapeutic drugs in coronavirus disease 2019. Arch Med Res. 2021;52(3):304–310. doi: 10.1016/j.arcmed.2020.11.009

4. Arentz M, Yim E, Klaff L, et al. Characteristics and outcomes of 21 critically ill patients with COVID-19 in Washington State. JAMA. 2020;323(16):1612–1614. doi: 10.1001/jama.2020.4326

5. Lai CC, Wang CY, Hsueh PR. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J Microbiol Immunol Infect. 2020; 53(4):505–512. doi: 10.1016/j.jmii.2020.05.013

6. Wu C, Chen X, Cai Y, et al. Risk factors associated with acute respiratory distress syndrome and death in patients with coronavirus disease 2019 pneumonia in Wuhan, China. JAMA Intern Med. 2020;180(7):934–943. doi: 10.1001/jamainternmed.2020.0994

7. Zhou F, Yu T, Du R, et al. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. Lancet. 2020;395(10229):1054-1062. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30566-3

8. Loosli CG, Stinson SF, Ryan DP, Hertweck MS, Hardy JD, Serebrin R. The destruction of type 2 pneumocytes by airborne influenza PR8-A virus; its effect on surfactant and lecithin content of the pneumonic lesions of mice. Chest. 1975; 67(2 Suppl):7S–14S. doi: 10.1378/chest.67.2_supplement.7s

9. Rudd JM, Ashar HK, Chow VT, Teluguakula N. Lethal synergism between influenza and Streptococcus pneumoniae. J Infect Pulm Dis. 2016;2(2):10.16966/2470–3176.114. doi: 10.16966/2470-3176.114

10. Harford CG, Leidler V, Hara M. Effect of the lesion due to influenza virus on the resistance of mice to inhaled pneumococci. J Exp Med. 1949;89(1):53–68. doi: 10.1084/jem.89.1.53

11. McCullers JA. The co-pathogenesis of influenza viruses with bacteria in the lung. Nat Rev Microbiol. 2014;12(4):252–62. doi: 10.1038/nrmicro3231

12. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В. и др. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19 // Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 4. С. 99–105. doi: 10.21055/0370-1069-2020-4-99-105.

13. Memish ZA, Perlman S, Van Kerkhove MD, Zumla A. Middle East respiratory syndrome. Lancet. 2020;395(10229):1063–1077. doi: 10.1016/S0140-6736(19)33221-0

14. Lima WG, Brito JCM, da Cruz Nizer WS. Ventilatorassociated pneumonia (VAP) caused by carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in patients with COVID-19: Two problems, one solution? Med Hypotheses. 2020;144:110139. doi: 10.1016/j.mehy.2020.110139

15. Cultrera R, Barozzi A, Libanore M, et al. Co-infections in critically ill patients with or without COVID-19: A comparison of clinical microbial culture findings. Int J Environ Res Public Health. 2021;18(8):4358. doi: 10.3390/ijerph18084358

16. Li J, Wang J, Yang Y, et al. Etiology and antimicrobial resistance of secondary bacterial infections in patients hospitalized with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective analysis. Antimicrob Resist Infect Control. 2020;9(1):153. doi: 10.1186/s13756-020-00819-1

17. Durán-Manuel EM, Cruz-Cruz C, Ibáñez-Cervantes G, et al. Clonal dispersion of Acinetobacter baumannii in an intensive care unit designed to patients COVID-19. J Infect Dev Ctries. 2021;15(1):58–68. doi: 10.3855/jidc.13545

18. Маржохова А.Р., Плоскирева А.А., Балагова Л.Э. Клинико-лабораторная характеристика острых респираторных вирусных инфекций по данным инфекционного стационара г. Нальчика // Современные проблемы науки и образования. 2020. № 4. С. 133–133. doi 10.17513/spno.30052

19. Селькова Е.П., Гренкова Т.А., Гудова Н.В., Оганесян АС. Итоги эпидсезона 2017/18 гг. по гриппу и острой респираторной вирусной инфекции. Особенности этиотропной терапии. // РМЖ. Медицинское обозрение. 2018. Т. 2. № 11. С. 49–53.

20. Uphoff H, Cohen J-M, Fleming D, Noone A. Harmonisation of national influenza surveillance morbidity data from EISS: a simple index. Euro Surveill. 2003;8(7):156–64. doi: 10.2807/esm.08.07.00420-en


Для цитирования:


Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Карпущенко Г.В., Чемисова О.С., Пичурина Н.Л., Павлович Н.В., Водопьянов С.О., Гудуева Е.Н., Слись С.С., Пшеничная Н.Ю., Литовко А.Р., Асмолова Н.Ю. Этиология внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения Covid-19 и оценка риска возникновения пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;(7):67-75. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75

For citation:


Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Noskov A.K., Kovalev E.V., Karpushchenko G.V., Chemisova O.S., Pichurina N.L., Pavlovich N.V., Vodopyanov S.O., Gudueva E.N., Slis S.S., Pshenichnaya N.Yu., Litovko A.R., Asmolova N.Yu. Etiology of Community-Acquired Pneumonia during the Epidemic Spread of COVID-19 and Healthcare-Associated Pneumonia Risk Assessment. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2021;(7):67-75. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75

Просмотров: 160


ISSN 2219-5238 (Print)
ISSN 2619-0788 (Online)