sredobЗдоровье населения и среда обитания – ЗНиСОPublic Health and Life Environment – PH&LE2219-52382619-0788ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора10.35627/10.35627/2219-5238/2022-30-7-48-56sredob-977Research ArticleЭПИДЕМИОЛОГИЯEPIDEMIOLOGYСравнительный анализ бактериальной микрофлоры, выделенной от больных пневмонией и из внешней среды в лечебных учреждениях Амурской областиComparative Analysis of Bacterial Microflora Isolated from Adult Pneumonia Inpatients and Hospital Objects in the Amur Regionhttps://orcid.org/0000-0002-9197-8519БондаренкоА. П.BondarenkoA. P.

Альбина Павловна Бондаренко, к. м. н., ведущий научный сотрудник, зав. лабораторией

ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии»

лаборатория бактериальных инфекций

680610

ул. Шевченко, д. 2

Хабаровск

Albina P. Bondarenko, Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher, Head of Laboratory

Bacteriology Laboratory

680610

2 Shevchenko Street

Khabarovsk

baclab_hniiem@bk.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3010-3054КургановаО. П.KurganovaO. P.

Ольга Петровна Курганова, к. м. н., руководитель

Управление Роспотребнадзора по Амурской области

675002

ул. Первомайская, д. 30

Благовещенск

Olga P. Kurganova, Cand. Sci. (Med.), Head

Amur Regional Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing

675002

30 Pervomayskaya Street

Blagoveshchensk

info@rospotrebnadzor-amur.ruТроценкоО. Е.TrotsenkoO. E.

ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии»

680610

ул. Шевченко, д. 2

Хабаровск

Olga E. Trotsenko, Dr. Sci. (Med.), Director

680610

2 Shevchenko Street

Khabarovsk

https://orcid.org/0000-0001-9931-9203БурдинскаяЕ. Н.BurdinskayaE. N.

Екатерина Николаевна Бурдинская, заместитель главного врача

675002

ул. Первомайская, д. 30

Благовещенск

Ekaterina N. Burdinskaya, Deputy Head Doctor

675002

30 Pervomayskaya Street

Blagoveshchensk

office@cge-amur.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8482-2404НатыканЮ. А.NatykanYu. A.

Юлия Александровна Натыкан, заведующая отделом

отдел обеспечения эпидемиологического надзора

675002

ул. Первомайская, д. 30

Благовещенск

Yulia A. Natykan, Head of Department

Epidemiological Surveillance Department

675002

30 Pervomayskaya Street

Blagoveshchensk

office@cge-amur.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2570-711XПшеничнаяН. Ю.PshenichnayaN. Yu.

Наталья Юрьевна Пшеничная,  д. м. н., профессор, заместитель директора по клинико-аналитической работе

ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии»

111123

ул. Новогиреевская, д. 3а

Москва

Natalia Yu. Pshenichnaya, Dr. Sci. (Med.), Prof., Deputy Director for Clinical and Analytical Work

111123

3a Novogireevskaya Street

Moscow

natalia-pshenichnaya@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3872-0006ОгиенкоО. Н.OgienkoO. N.

Ольга Николаевна Огиенко, младший научный сотрудник

ФБУН «Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии»

лаборатория бактериальных инфекций 

680610

ул. Шевченко, д. 2

Хабаровск

Olga N. Ogienko, Junior Researcher

Bacteriology Laboratory

680610

2 Shevchenko Street

Khabarovsk

baclab_hniiem@bk.ruРоспотребнадзорРоссияKhabarovsk Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationРоспотребнадзорРоссияFederal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human WelfareRussian FederationФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Амурской области»РоссияCenter for Hygiene and Epidemiology in the Amur RegionRussian FederationРоспотребнадзорРоссияCentral Research Institute of EpidemiologyRussian Federation202215072022074856Copyright © Бондаренко А.П., Курганова О.П., Троценко О.Е., Бурдинская Е.Н., Натыкан Ю.А., Пшеничная Н.Ю., Огиенко О.Н., 20222022Бондаренко А.П., Курганова О.П., Троценко О.Е., Бурдинская Е.Н., Натыкан Ю.А., Пшеничная Н.Ю., Огиенко О.Н.Bondarenko A.P., Kurganova O.P., Trotsenko O.E., Burdinskaya E.N., Natykan Y.A., Pshenichnaya N.Y., Ogienko O.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/977

   Введение. Пандемия COVID-19 обострила проблему инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в частности, ситуацию с распространением резистентных штаммов внутри стационаров с возможным развитием нозокомиальных инфекций.   Цели: сравнительный анализ бактериальной микрофлоры, выделенной от больных пневмонией и из внешней среды; оценка потенциальной опасности больничной среды в лечебных учреждениях Амурской области в плане риска внутрибольничного инфицирования.   Материалы и методы. В качестве госпитальных баз определены 2 лечебно-профилактических учреждения (ЛПУ): ЛПУ 1 (соматическая больница) и ЛПУ 2 («ковидный госпиталь»). В каждом учреждении проведено параллельное бактериологическое исследование клинических проб от больных и проб из внешней среды ЛПУ. Всего исследовано 519 проб мокроты от 284 больных и 486 проб из внешней среды ЛПУ при еженедельном заборе смывов в течение 12 недель наблюдения. Бактериологическое исследование выполнено классическим методом. Идентификация патогенов и определение их чувствительности к антимикробным препаратам (АМП) проводили с помощью баканализаторов AutoSCAN-4 и Vitek® 2 Compact 30.   Результаты. Наряду с выявлением в 33,8 % случаев патогенной бактериальной флоры, у больных пневмонией определен высокий уровень обнаружения патогенов из внешней среды ЛПУ 1 и ЛПУ 2 (23,3 –12,4 %). В структуре патогенов, выделенных из внешней среды, клинически значимые грамотрицательные бактерии составляют 44,9–15,4 %, соответственно ЛПУ с долей возбудителей с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) 32,7–3,8 %. Выявленные различия могут быть связаны с более жестким режимом дезинфекции в ЛПУ 2. В структуре грамотрицательных изолятов с МЛУ отмечена высокая доля карбапенемустойчивых штаммов, выделенных как от больных (20,0 %), так и из внешней среды (38,9 %).   Выводы. Проведенный мониторинг позволил охарактеризовать состав и соотношение бактериальных возбудителей, выделяемых от больных пневмонией и из внешней среды. Широкий спектр возбудителей, в том числе с лекарственно-устойчивыми маркерами, выявляемых с высокой частотой в смывах с объектов больничной среды, и их накопление с течением времени свидетельствуют о потенциальной опасности больничной среды и риске внутрибольничного инфицирования.

   Background: The COVID-19 pandemic has exacerbated the problem of healthcare-associated infections and worsened the situation with the hospital spread of antibiotic resistant strains potentially inducing nosocomial infections.   Objective: To compare bacterial microflora isolated from adult pneumonia inpatients and hospital objects and to assess the risk of hospital-acquired infections in the Amur Region.   Materials and methods: The study was conducted in a multidisciplinary and a “COVID” hospital hereinafter referred to as Hospitals 1 and 2, respectively. Parallel bacteria culture testing of 519 sputum samples from 284 inpatients and 486 wipe samples collected weekly during 12 weeks in both hospitals was carried out using a classical method. AutoSCAN-4 and Vitek® 2 Compact 30 analyzers were applied to identify pathogens and determine their antimicrobial susceptibility.   Results: Along with the detection of pathogenic bacteria in 33.8 % of hospitalized patients with pneumonia, we found pathogens in 23.3 % and 12.4 % of wipe samples from Hospitals 1 and 2, respectively, and established that the proportion of Gram-negative bacteria in them was 44.9 % and 15.4 % while the share of multidrug-resistant strains was 32.7 % and 3.8 %. The significant differences observed can be attributed to a more stringent disinfection regime in Hospital 2. The structure of multidrug-resistant Gram-negative bacteria was noted for a high proportion of carbapenem-resistant organisms isolated from both sputum (20.0 %) and wipe (38.9 %) samples.   Conclusion: Our monitoring results helped define the composition and ratio of bacterial pathogens isolated from pneumonia cases and hospital objects. A wide range of pathogens, including those resistant to antibiotics, often detected in wipe samples and their accumulation over time indicate the potential hazard of the hospital environment posing an increased risk of hospital-acquired infections.

пневмонияэтиологиябольничная средадинамическое наблюдениелекарственная устойчивость патогеновpneumoniaetiologyhospital environmentfollow-updrug resistanceИсследование проведено без спонсорской поддержкиThe authors received no financial support for the research, authorship, and/or publication of this articleReferencesАкимкин В. Г. Пандемия COVID-19: новый виток нарастания антибиотикорезистентности / В. Г. Акимкин [и др.] // Инфекционные болезни. – 2021. – Т. 19. – № 3. – С. 133–138. doi: 10.20953/1729-9225-2021-3-133-138Akimkin V. G., Tutelyan A. V., Shulakova N. I., Voronin E. M. COVID-19 pandemic: A new round of antibiotic resistance. Infektsionnye Bolezni. 2021; 19 (3): 133-138. (In Russ.) doi: 10.20953/1729-9225-2021-3-133-138Ортенберг Э. А. Почти два года с COVID-19: некоторые аспекты использования антибиотиков / Э. А. Ортенберг // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. – Т. 23. – № 3. – С. 248–253. doi: 10.36488/cmac.2021.3.248-253Ortenberg E. A. Almost two years with COVID-19: Some aspects of antibiotic use. Klinicheskaya Mikrobiologiya i Antimikrobnaya Khimioterapiya. 2021; 23 (3): 248-253. (In Russ.) doi: 10.36488/cmac.2021.3.248-253Li J., Wang J., Yang Y., et al. Etiology and antimicrobial resistance of secondary bacterial infections in patients hospitalized with COVID-19 in Wuhan, China: A retrospective analysis. Antimicrob Resist Infect Control. 2020; 9 (1): 153. doi: 10.1186/s13756-020-00819-1Li J,, Wang J., Yang Y., et al. Etiology and antimicrobial resistance of secondary bacterial infections in patients hospitalized with COVID-19 in Wuhan, China: A retrospective analysis. Antimicrob Resist Infect Control. 2020; 9 (1): 153. doi: 10.1186/s13756-020-00819-1Ромашов О. М. Оценка резистентности микроорганизмов многопрофильного стационара и модернизация схем антимикробной терапии в условиях пандемии COVID-19 / О. М. Ромашов [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. – Т. 23. – № 3. – С. 293–303. doi: 10.36488/cmac.2021.3.293-303Romashov O. M., Ni O. G., Bykov A. O., Kruglov A. N., Protsenko D. N., Tyurin I. N. Antimicrobial resistance and antimicrobial therapy modification during COVID-19 pandemic in large tertiary hospital. Klinicheskaya Mikrobiologiya i Antimikrobnaya Khimioterapiya. 2021; 23 (3): 293-303. (In Russ.) doi: 10.36488/cmac.2021.3.293-303Головерова Ю. А. Уровень заболеваемости инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, в отделениях высокого эпидемиологического риска инфицирования / Ю. А. Головерова [и др.] // Инфекционные болезни. – 2019. – Т. 17. – № 3. – С. 69–73. doi: 10.20953/1729-9225-2019-3-69-73Goloverova Yu. A., Marin G. G., Shabalina S. V., Tutelyan A. V., Orlova O. A., Akimkin V. G. Incidence of health care-associated infections in high-risk hospital units. Infektsionnye Bolezni. 2019; 17 (3): 69–73. (In Russ.) doi: 10.20953/1729-9225-2019-3-69-73Брико Н. И. Госпитальный штамм – непознанная реальность / Н. И. Брико [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2013. – № 1 (68). – С. 30–35.Briko N. I., Brusina E. B., Zueva L. P., et al. Hospital strain – Mysterious reality. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2013; (1 (68)): 30-35. (In Russ.)Чезганова Е. А. Дополнительный резервуар госпитальных микроорганизмов в медицинских организациях / Е. А, Чезганова [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2021. – Т. 98. – № 3. – С. 266–275. doi: 10.36233/0372-9311-120Chezganova E. A., Efimova O. S., Sakharova V. M., et al. A novel source of hospital microorganisms in healthcare settings. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2021; 98 (3): 266-275. (In Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-120Орлова О. А. Организация эпидемиологической диагностики вентилятор-ассоциированных инфекций дыхательных путей / О. А. Орлова, В. Г. Акимкин // Медицинский алфавит. – 2017. – Т. 3. – № 30 (327). – С. 5–19.Orlova O. A., Akimkin V. G. Organization of epidemiological diagnosis of ventilator-associated respiratory infections. Meditsinskiy Alfavit. 2017; 3 (30 (327)): 15–19. (In Russ.)Руднов В. А. Современный портрет вентилятор-ассоциированной инфекции нижних дыхательных путей: этиология и проблемы диагностики / В. А. Руднов [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. – Т. 23. – № 1. – С. 17-25.Rudnov V. A., Bagin V. A., Belsky D. V., et al. Ventilator-associated lower respiratory tract infections: etiology and diagnosis. Klinicheskaya Mikrobiologiya i Antimikrobnaya Khimioterapiya. 2021; 23 (1): 17-25. (In Russ.) doi: 10.36488/cmac.2021.1.17-25Гончаров А. Е. Распространение мультиантибиотикорезистентных возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в стационарах для лечения пациентов с COVID-19 / А. Е. Гончаров [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2021. – Т. 20. – № 2. – С. 68–73. doi: 10.31631/2073-3046-2021-20-2-68-73Goncharov A. E., Zueva L. P., Mokhov A. S., et al. Spread of multi-antibiotic-resistant health-care pathogens in hospitals to treat COVID-19 patients. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2021; 20 (2): 68-73. (In Russ.) doi: 10.31631/2073-3046-2021-20-2-68-73Hughes M. M., Groenewold M. R., Lessem S. E., et al. Update: Characteristics of health care personnel with COVID-19 – United States, February 12–July 16, 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2020; 69 (38): 1364-1368. doi: 10.15585/mmwr.mm6938a3Hughes M. M, Groenewold M. R., Lessem S. E., et al. Update: Characteristics of health care personnel with COVID-19 – United States, February 12–July 16, 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2020; 69 (38): 1364-1368. doi: 10.15585/mmwr.mm6938a3Treibel T. A., Manisty C., Burton M., et al. COVID-19: PCR screening of asymptomatic health-care workers at London hospital. Lancet. 2020; 395 (10237): 1608-1610. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31100-4Treibel T. A., Manisty C., Burton M., et al. COVID-19: PCR screening of asymptomatic health-care workers at London hospital. Lancet. 2020; 395 (10237): 1608-1610. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31100-4Платонова Т. А. Заболеваемость COVID-19 медицинских работников. Вопросы биобезопасности и факторы профессионального риска // Т. А. Платонова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2021. – Т. 20. – № 2. – С. 4–11. doi: 10.31631/2073-3046-2021-20-2-4-11Platonova T. A., Golubkova A. A., Tutelyan A. V., Smirnova S. S. The incidence of COVID-19 medical workers. The issues of biosafety and occupational risk factors. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2021; 20 (2): 4-11. (In Russ.) doi: 10.31631/2073-3046-2021-20-2-4-11Shields A., Faustini S. E., Perez-Toledo M., et al. SARS-CoV-2 seroprevalence and asymptomatic viral carriage in healthcare workers: A cross-sectional study. Thorax. 2020; 75 (12): 1089-1094. doi: 10.1136/thoraxjnl-2020-215414Shields A., Faustini S. E., Perez-Toledo M., et al. SARS-CoV-2 seroprevalence and asymptomatic viral carriage in healthcare workers: A cross-sectional study. Thorax. 2020; 75 (12): 1089-1094. doi: 10.1136/thoraxjnl-2020-215414Mehrad B., Clark N. M., Zhanel G. G., Lynch J. P. 3rd. Antimicrobial resistance in hospital-acquired gram-negative bacterial infections. Chest. 2015; 147 (5): 1413-1421. doi: 10.1378/chest.14-2171Mehrad B., Clark N. M., Zhanel G. G., Lynch J. P. 3rd. Antimicrobial resistance in hospital-acquired gram-negative bacterial infections. Chest. 2015; 147 (5): 1413-1421. doi: 10.1378/chest.14-2171Cerceo E., Deitelzweig S. B., Sherman B. M., Amin A. N. Multidrug-resistant gram-negative bacterial infections in the hospital setting: Overview, implications for clinical practice, and emerging treatment options. Microb Drug Resist. 2016; 22 (5): 412-431. doi: 10.1089/mdr.2015.0220Cerceo E., Deitelzweig S. B., Sherman B. M., Amin A. N. Multidrug-resistant gram-negative bacterial infections in the hospital setting: Overview, implications for clinical practice, and emerging treatment options. Microb Drug Resist. 2016; 22 (5): 412-431. doi: 10.1089/mdr.2015.0220Маркелова Н. Н. Мониторинг возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, acinetobacter baumannii, stenotrophomonas maltophilia), в стационаре / Н. Н. Маркелова, Е. Ф. Семенова, А. В. Тутельян //Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2019. – Т. 9. – № 2. – С. 68–74. doi: 10.18565/epidem.2019.9.2.68-74Markelova N. N., Semenov E. F., Tutelyan A. V.. Monitoring the pathogens (Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia) of healthcare-associated infections in a hospital. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. Aktual’nye Voprosy. 2019; 9 (2): 68-74. (In Russ.) doi: 10.18565/epidem.2019.9.2.68-74Munoz-Price L. S., Namias N., Cleary T., et al. Acinetobacter baumannii: Association between environmental contamination of patient rooms and occupant status. Infect Control Hosp Epidemiol. 2013; 34 (5): 517-520. doi: 10.1086/670209Munoz-Price L. S., Namias N., Cleary T., et al. Acinetobacter baumannii: Association between environmental contamination of patient rooms and occupant status. Infect Control Hosp Epidemiol. 2013; 34 (5): 517-520. doi: 10.1086/670209Morgan D. J., Liang S. Y., Smith C. L., et al. Frequent multidrug-resistant Acinetobacter baumannii contamination of gloves, gowns, and hands of healthcare workers. Infect Control Hosp Epidemiol. 2010; 31 (7): 716-721. doi: 10.1086/653201Morgan D. J., Liang S. Y., Smith C. L., et al. Frequent multidrug-resistant Acinetobacter baumannii contamination of gloves, gowns, and hands of healthcare workers. Infect Control Hosp Epidemiol. 2010; 31 (7): 716-721. doi: 10.1086/653201Хрульнова С. А. Молекулярно-генетическое типирование Acinetobacter baumannii, выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови, методом ПЦР случайных полиморфных фрагментов ДНК / С. А. Хрульнова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2020. – Т. 19. – № 4. – С. 38–47. doi: 10.31631/2073-3046-2020-19-4-38-47Khrulnova S. A., Fedorova A. V., Frolova I. N., Klyasova G. A. Genotyping by random amplified polymorphic DNA assay of Acinetobacter baumannii isolated from blood culture of patients with hematological malignancies. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2020; 19 (4): 38-47. (In Russ.) doi: 10.31631/2073-3046-2020-19-4-38-47Попова А. Ю. Этиология внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения COVID-19 и оценка риска возникновения пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи / А. Ю. Попова [и др.] // Здоровье населения и среда обитания. – 2021. – Т. 29. – № 7. – C. 67–75. doi: 10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75Popova A. Yu., Ezhlova E. B., Demina Yu. V., et al. Etiology of community-acquired pneumonia during the epidemic spread of COVID-19 and healthcare-associated pneumonia risk assessment. Zdorov’e Naseleniya i Sreda Obitaniya. 2021; 29 (7): 67-75. (In Russ.) doi: 10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75

The authors declare that there are no conflicts of interest present.