sredobЗдоровье населения и среда обитания – ЗНиСОPublic Health and Life Environment – PH&LE2219-52382619-0788ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора10.35627/2219-5238/2021-337-4-10-17sredob-496Research ArticleСтатьиВидовой состав микробиоты автобусов внутригородских маршрутовSpecies Composition of Microbiota in City Buseshttps://orcid.org/0000-0003-3402-1160БеловаИ. В.BelovaI. V.

Белова Ирина Викторовна – к.м.н., вед. науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции

ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950

Irina V. Belova, Candidate of Medical Sciences, Leading Researcher, Laboratory of Human Microbiome and Means of Its Correction

71 Malaya Yamskaya Street, Nizhny Novgorod, 603950

lab-lb@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7753-5730ТочилинаА. Г.TochilinaA. G.

Точилина Анна Георгиевна – к.б.н., ст. науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции

ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950

Anna G. Tochilina, Candidate of Biological Sciences, Senior Researcher, Laboratory of Human Microbiome and Means of Its Correction

71 Malaya Yamskaya Street, Nizhny Novgorod, 603950

https://orcid.org/0000-0002-3136-9500СоловьеваИ. В.SolovyevaI. V.

Соловьева Ирина Владленовна – д.б.н., доцент, вед. науч. сотр. заведующий лабораторией микробиологии ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора

ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950

Irina V. Solovyeva, D.Biol.Sc., Associate Professor, Leading Researcher, Head of the Microbiology Laboratory

71 Malaya Yamskaya Street, Nizhny Novgorod, 603950

https://orcid.org/0000-0001-9734-2047ГелашвилиД. Б.GelashviliD. B.

Гелашвили Давид Бежанович – д.б.н., профессор кафедры экологии

просп. Гагарина, д. 23, г. Нижний Новгород, 603950

David B. Gelashvili, D.Biol.Sc., Professor, Department of Ecology

Nizhny Novgorod, 603950

https://orcid.org/0000-0002-4750-5925ЗазнобинаН. И.ZaznobinaN. I.

Зазнобина Наталья Ивановна – к.б.н., доцент кафедры экологии

просп. Гагарина, д. 23, г. Нижний Новгород, 603950

Nataly I. Zaznobina, Candidate of Biological Sciences, Associate Professor, Department of Ecology

Nizhny Novgorod, 603950

https://orcid.org/0000-0002-1162-2417ЖирновВ. А.ZhirnovV. A.

Жирнов Владимир Анатольевич – к.б.н., науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции 

ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950

Vladimir A. Zhirnov, Candidate of Biological Sciences, Researcher, Laboratory of Human Microbiome and Means of Its Correction

71 Malaya Yamskaya Street, Nizhny Novgorod, 603950

https://orcid.org/0000-0002-4750-5925МолодцоваС. Б.MolodtsovaS. B.

Молодцова Светлана Борисовна – науч. сотр. лаборатории микробиома человека и средств его коррекции

ул. Малая Ямская, д. 71, г. Нижний Новгород, 603950

Svetlana B. Molodtsova, Researcher, Laboratory of Human Microbiome and Means of Its Correction

71 Malaya Yamskaya Street, Nizhny Novgorod, 603950

ФБУН «Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной» РоспотребнадзораРоссияAcademician I.N. Blokhina Nizhny Novgorod Scientific Research Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian FederationФГАОУ ВО «Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского» Минобрнауки РоссииРоссияNational Research Lobachevsky State University of Nizhny Novgorod, 23 Gagarin AvenueRussian Federation202119052021041017Copyright © Белова И.В., Точилина А.Г., Соловьева И.В., Гелашвили Д.Б., Зазнобина Н.И., Жирнов В.А., Молодцова С.Б., 20212021Белова И.В., Точилина А.Г., Соловьева И.В., Гелашвили Д.Б., Зазнобина Н.И., Жирнов В.А., Молодцова С.Б.Belova I.V., Tochilina A.G., Solovyeva I.V., Gelashvili D.B., Zaznobina N.I., Zhirnov V.A., Molodtsova S.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/496

Введение. В нормативных документах санитарного законодательства Российской Федерации отсутствует норми­рование микробиологических показателей для салонов городского автотранспорта, осуществляющего пассажирские пе­ревозки. Однако на примере крупномасштабных исследований микробиома общественного транспорта, проведенных в разных странах, доказано, что и внешняя среда (остановки и платформы), и внутренняя среда салонов содержат большое количество разнообразных микроорганизмов, на численность которых не оказывают влияния ни температура воздуха, ни длительность маршрута, ни количество пассажиров. Цель работы: изучение видового состава микробиоты рейсовых автобусов, курсирующих по внутригородским маршрутам, и оценка ее структуры с помощью методов синэкологического и эпидемиологического анализа. Материал и методы. Материалом для исследования служили смывы с общедоступных по­верхностей салонов автобусов. Всего обследован 41 автобус 16 маршрутов из трех условных групп («нагорная», «заречная» и «межрайонная»). В работе использовали методы классической бактериологии, MALDI TOF масс­спектрометрии, синэ­кологического анализа. Результаты и обсуждение. В результате исследования выделено 85 видов микроорганизмов, из них 15 обнаруживались во всех группах маршрутов. Показано, что микробиота автобусов подчиняется тем же экологическим закономерностям, что и природные (естественные) микробиоценозы. Наибольшим количеством видов представлены род Staphylococcus (16), Acinetobacter (11), Bacillus (11), Pseudomonas (8), Pantoea (5). В наибольшем количестве выделялись микроор­ ганизмы родов Acinetobacter, Enterobacter, Pantoea. Среди 15 общих для трех групп автобусов видов микроорганизмов 60 % являются представителями микробиоты человека. Показано, что в наибольшем количестве микроорганизмы выделяют­ся с тканевых спинок сидений (до 18600 КОЕ/см3), ручек спинок сидений (до 76500 КОЕ/см3), кожаных петель­держате­лей (до 6400 КОЕ/см3), а также с участков поверхностей с явными загрязнениями (11200 КОЕ/см3). Выводы. Полученные данные свидетельствуют о необходимости нормирования микробиологических показателей и разработки методических указаний по контролю эффективности проводимых дезинфекционных мероприятий в салонах общественного пассажир­ского автотранспорта.

Introduction: Regulatory documents of the Russian sanitary legislation provide no standardization of microbiological indicators for urban public transportation. At the same time, extensive studies of public transport microbiome conducted in dif­ ferent countries demonstrated that the external environment (stations and platforms) and the interior of vehicles contain a large number of various microorganisms, the number of which is independent of air temperature, route duration, or the number of passengers. The objective of our work was to study the species composition of microbiota in urban buses and to assess its structure using methods of synecological and epidemiological analysis. Methods: We analyzed wipe samples from generally accessible bus interior surfaces. In total, 41 buses of 16 routes from three conditional groups (“Nagornaya” (Upland), “Zarechnaya” (Transverse) and “Interdistrict”) were examined. We applied methods of classical bacteriology, MALDI­TOF mass spectrometry for microor­ ganism identification, and synecological analysis. Results and discussion: We identified 85 types of microorganisms, 15 of which were found in all groups of routes. The bus microbiota followed the same ecological laws as natural microbiocenoses. The greatest number of species was represented by genera Staphylococcus (16), Acinetobacter (11), Bacillus (11), Pseudomonas (8), and Pantoea (5). The majority of identified microorganisms belonged to genera Acinetobacter, Enterobacter, and Pantoea. Among 15 species of micro­ organisms “common” to three groups of buses, 60 % were representatives of human microbiota. Microorganisms were found in large quantities on fabric seat backs (up to 18,600 CFU/cm3), seat back handles (up to 76,500 CFU/cm3), leather loop­holders (up to 6,400 CFU/cm3), and visually dirty surfaces (11,200 CFU/cm3). Conclusions: Our findings indicate the need to standardize micro­ biological indicators and develop guidelines for monitoring the efficiency of disinfection of interiors of public passenger vehicles.

микроорганизмымикробиотаобщественный автотранспортmicroorganismsmicrobiotapublic road transportReferencesБелов А.Б., Куликалова Е.С. Сапронозы: экология возбудителей, эпидемиология, терминология и систематика // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016.Belov AB, Kulikalova ES. Sapronoses: ecology of infection agents, epidemiology, terminology and classification. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2016;15(1):5–16. (In Russian). doi: 10.31631/20733046-2016-15-1-5-16Hubálek Z. Emerging human infectious diseases: anthroponoses, zoonoses, and sapronoses. Emerg Infect Dis. 2003;9(3):403–404. doi: 10.3201/eid0903.020208Hubálek Z. Emerging human infectious diseases: anthroponoses, zoonoses, and sapronoses. Emerg Infect Dis. 2003;9(3):403–404. doi: 10.3201/eid0903.020208Hubálek Z, Rudolf I. Microbial Zoonoses and Sapronoses. Dordrecht: Springer Publ, 2011. doi: 10.1007/978-90-481-9657-9Hubálek Z, Rudolf I. Microbial Zoonoses and Sapronoses. Dordrecht: Springer Publ, 2011. doi: 10.1007/978-90-481-9657-9Kuris AM, Lafferty KD, Sokolow SH. Sapronosis: a distinctive type of infectious agent. Trends Parasitol. 2014;30(8):386–393. doi: 10.1016/j.pt.2014.06.006Kuris AM, Lafferty KD, Sokolow SH. Sapronosis: a distinctive type of infectious agent. Trends Parasitol. 2014;30(8):386–393. doi: 10.1016/j.pt.2014.06.006Xu B, Hao J. Air quality inside subway metro indoor environment worldwide: A review. Environ Int. 2017; 107:33–46. doi: 10.1016/j.envint.2017.06.016Xu B, Hao J. Air quality inside subway metro indoor environment worldwide: A review. Environ Int. 2017; 107:33–46. doi: 10.1016/j.envint.2017.06.016Fujiyoshi S, Tanaka D, Maruyama F. Transmission of airborne bacteria across built environments and its measurement standards: A review. Front Microbiol. 2017;8:2336. doi: 10.3389/fmicb.2017.02336Fujiyoshi S, Tanaka D, Maruyama F. Transmission of airborne bacteria across built environments and its measurement standards: A review. Front Microbiol. 2017;8:2336. doi: 10.3389/fmicb.2017.02336Dybwad M, Granum PE, Bruheim P, Blatny JM. Characterization of airborne bacteria at an underground subway station. Appl Environ Microbiol. 2012;78(6):1917– 1929. doi: 10.1128/AEM.07212-11Dybwad M, Granum PE, Bruheim P, Blatny JM. Characterization of airborne bacteria at an underground subway station. Appl Environ Microbiol. 2012;78(6):1917– 1929. doi: 10.1128/AEM.07212-11HsuT, JoiceR, VallarinoJ, Abu-AliG, HartmannEM, Shafquat A, et al. Urban transit system microbial communities differ by surface type and interaction with humans and the environment. mSystems. 12016;1(3):e00018–16. doi: 10.1128/mSystems.00018-16HsuT, JoiceR, VallarinoJ, Abu-AliG, HartmannEM, Shafquat A, et al. Urban transit system microbial communities differ by surface type and interaction with humans and the environment. mSystems. 12016;1(3):e00018–16. doi: 10.1128/mSystems.00018-16Hospodsky D, Qian J, Nazaroff WW, Yamamoto N, Bibby K, Rismani-Yazdi H, et al. Human occupancy as a source of indoor airborne bacteria. PLoS One. 2012;7(4):e34867. doi: 10.1371/journal.pone.0034867Hospodsky D, Qian J, Nazaroff WW, Yamamoto N, Bibby K, Rismani-Yazdi H, et al. Human occupancy as a source of indoor airborne bacteria. PLoS One. 2012;7(4):e34867. doi: 10.1371/journal.pone.0034867Брусина Е.Б., Рычагов И.П. Эпидемиология внутрибольничных гнойно-септических инфекций в хирургии. Новосибирск: Наука, 2006. 169 с.Brusina EB, Ryichagov IP. [Epidemiology of In-hospital Septic Infection in Surgery]. Novosibirsk: Nauka Publ., 2006. (In Russian).Куликалова Е.С., Урбанович Л.Я., Саппо С.Г., Миронова Л.В., Марков Е.Ю., Мальник В.В. и др. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резервации возбудителя в водной окружающей среде // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. №1. С.3–11.Kulikalova ES, UrbanovichLYa, SappoSG, MironovaLV, MarkovEYu, Mal’nikVV. Cholera vibrio biofilm: production, characterization and role in reservation of causative agent in water environment. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2015;(1):3–11. (In Russian).Андрюков Б.Г., Сомова Л.М., Тимченко Н.Ф. Эволюция понятия сапронозы и трансформация экологической концепции паразитизма в инфектологии // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. №5. С.119–126. https:// doi.org/10.36233/0372-9311-2017-5-119-126Andryukov BG, Somova LM, Timchenko NF. Evolution of the sapronosis notion and transformation of the environmental concept of parasitism in infectology. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2017;(5):119–126. doi: 10.36233/0372-9311-2017-5119-126Белов А.Б. Экологические аспекты эпидемиологического надзора за внутрибольничными инфекциями // Сепсис. Вопросы клинической патофизиологии, эпидемиологии, диагностики и интенсивной терапии: материалы межрегиональной научно-практической конференции. Кемерово: Изд-во Кузбассвузиздат, 2006. С.18–27.Belov AB. [Environmental aspects of epidemiological surveillance of hospital infections]. In: Sepsis. Issues of Сlinical Pathophysiology, Epidemiology, diagnosis and intensive Care: Proceeding of the Interregional Scientific and Practical Conference. Kemerovo: Kuzbassvuzizdat Publ., 2006:18–27. (In Russian).Брусина Е.Б. Эпидемиология инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, вызванных возбудителями группы сапронозов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015. Т.14. №2. С.50–56. doi: https://doi.org/10.31631/2073-3046-2015-14-2.Brusina EB. Epidemiology of healthcare-associated infection, coused by sapronoses group pathogens. Epidemiologiya i Vaktsinoprofilaktika. 2015;14(2):50–56. (In Russian). doi: 10.31631/2073-3046-2015-14-2Conceição T, Diamantino F, Coelho C, Aires-deSousa M. Contamination of public buses with MRSA in Lisbon, Portugal: a possible transmission route of major MRSA clones within the community. PLoS One. 2013;8(11):e77812. doi: 10.1371/journal.pone.0077812Conceição T, Diamantino F, Coelho C, Aires-deSousa M. Contamination of public buses with MRSA in Lisbon, Portugal: a possible transmission route of major MRSA clones within the community. PLoS One. 2013;8(11):e77812. doi: 10.1371/journal.pone.0077812Тихонов В.В., Николаева О.В., Пильгун П.А. Оценка численности микроорганизмов в воздухе общественного транспорта Москвы в зимний период // Городские исследования и практики. 2018. Т.3. №3. С.36–47. doi: https://doi.org/10.17323/usp33201836-47Tikhonov VV, Nikolaeva OV, Pilgun PA. Quantity of airborne microorganisms in public transport of Moscow in winter period. Gorodskie Issledovaniya i Praktiki. 2018;3(3):36–47. (In Russian). doi: 10.17323/usp33201836-47AfshinnekooE, MeydanC, ChowdhuryS, JaroudiD, BoyerC, BernsteinN, et al. Geospatial resolution of human and bacterial diversity with city-scale metagenomics. Cell Syst. 2015;1(1):72–87. doi: 10.1016/j.cels.2015.01.001AfshinnekooE, MeydanC, ChowdhuryS, JaroudiD, BoyerC, BernsteinN, et al. Geospatial resolution of human and bacterial diversity with city-scale metagenomics. Cell Syst. 2015;1(1):72–87. doi: 10.1016/j.cels.2015.01.001The MetaSUB International Consortium, Mason C, Afshinnekoo E, Ahsannudin S, Ghedin E, Read T, Fraser C, et al. The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report. Microbiome. 2016;4(24):1–14. doi: https://doi.org/10.1186/s40168016-0168-zThe MetaSUB International Consortium, Mason C, Afshinnekoo E, Ahsannudin S, Ghedin E, Read T, Fraser C, et al. The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report. Microbiome. 2016;4(24):1–14. doi: https://doi.org/10.1186/s40168016-0168-zKlimenko NS, Tyakht AV, Toshchakov SV, Shevchenko MA, Korzhenkov AA, Afshinnekoo E et al. Cooccurrence patterns of bacteria within microbiome of Moscow subway. Comput Struct Biotechnol J. 2020; 18:314–322. doi: 10.1016/j.csbj.2020.01.007Klimenko NS, Tyakht AV, Toshchakov SV, Shevchenko MA, Korzhenkov AA, Afshinnekoo E et al. Cooccurrence patterns of bacteria within microbiome of Moscow subway. Comput Struct Biotechnol J. 2020; 18:314–322. doi: 10.1016/j.csbj.2020.01.007Garza DR, Dutilh BE. From cultured to uncultured genome sequences: metagenomics and modeling microbial ecosystems. Cell Mol Life Sci. 2015;72(22):4287–308. doi: 10.1007/s00018-015-2004-1Garza DR, Dutilh BE. From cultured to uncultured genome sequences: metagenomics and modeling microbial ecosystems. Cell Mol Life Sci. 2015;72(22):4287–308. doi: 10.1007/s00018-015-2004-1Neelakanta G, Sultana H. The use of metagenomic approaches to analyze changes in microbial communities. Microbiol Insights. 2013;6:37–48. doi: 10.4137/MBI. S10819Neelakanta G, Sultana H. The use of metagenomic approaches to analyze changes in microbial communities. Microbiol Insights. 2013;6:37–48. doi: 10.4137/MBI. S10819RobertsonCE, BaumgartnerLK, HarrisJK, PetersonKL, StevensMJ, FrankDN, et al. Culture-independent analysis of aerosol microbiology in a metropolitan subway system. Appl Environ Microbiol. 2013;79(11):3485–93. doi: 10.1128/AEM.00331-13RobertsonCE, BaumgartnerLK, HarrisJK, PetersonKL, StevensMJ, FrankDN, et al. Culture-independent analysis of aerosol microbiology in a metropolitan subway system. Appl Environ Microbiol. 2013;79(11):3485–93. doi: 10.1128/AEM.00331-13Dingle TC, Butler-Wu SM. MALDI-TOF mass spectrometry for microorganism identification. Clin Lab Med. 2013;33(3):589–609. doi: 10.1016/j.cll.2013.03.001Dingle TC, Butler-Wu SM. MALDI-TOF mass spectrometry for microorganism identification. Clin Lab Med. 2013;33(3):589–609. doi: 10.1016/j.cll.2013.03.001Singhal N, Kumar M, Kanaujia PK, Virdi JS. MALDITOF mass spectrometry: an emerging technology for microbial identification and diagnosis. Front Microbiol. 2015;6:791. doi: 10.3389/fmicb.2015.00791Singhal N, Kumar M, Kanaujia PK, Virdi JS. MALDITOF mass spectrometry: an emerging technology for microbial identification and diagnosis. Front Microbiol. 2015;6:791. doi: 10.3389/fmicb.2015.00791LiY, ShanM, ZhuZ, MaoX, YanM, Chen Y, et al. Application of MALDI-TOF MS to rapid identification of anaerobic bacteria. BMC Infect Dis. 2019;19(1):941. doi: 10.1186/s12879-019-4584-0LiY, ShanM, ZhuZ, MaoX, YanM, Chen Y, et al. Application of MALDI-TOF MS to rapid identification of anaerobic bacteria. BMC Infect Dis. 2019;19(1):941. doi: 10.1186/s12879-019-4584-0Strejcek M, Smrhova T, Junkova P, Uhlik O. Whole-cell MALDI-TOF MS versus 16S rRNA gene analysis for identification and dereplication of recurrent bacterial isolates. Front Microbiol. 2018;9:1294. doi: 10.3389/ fmicb.2018.01294Strejcek M, Smrhova T, Junkova P, Uhlik O. Whole-cell MALDI-TOF MS versus 16S rRNA gene analysis for identification and dereplication of recurrent bacterial isolates. Front Microbiol. 2018;9:1294. doi: 10.3389/ fmicb.2018.01294

The authors declare that there are no conflicts of interest present.