<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">sredob</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Public Health and Life Environment – PH&amp;LE</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2219-5238</issn><issn pub-type="epub">2619-0788</issn><publisher><publisher-name>ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">sredob-346</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ОБМЕН ОПЫТОМ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>EXPERIENCE EXCHANGE</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Разработка способа идентификации V. рагаhaemolyticus с помощью ПЦР в режиме реального времени</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Development of a method for identifying of V. parahaemolyticus by real-time PCR</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Рыковская</surname><given-names>Оксана Алексеевна</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Rykovskaya</surname><given-names>O. A.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">rykowskaya_oa@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Полева</surname><given-names>М. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Poleeva</surname><given-names>M. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Чемисова</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chemisova</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Трухачев</surname><given-names>А. Л.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Trukhachev</surname><given-names>A. L.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Rostov-on-Don Research Institute for Plaque Control of Rospotrebnadzor</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2018</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>19</day><month>04</month><year>2021</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>48</fpage><lpage>50</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Рыковская О.А., Полева М.В., Чемисова О.С., Трухачев А.Л., 2021</copyright-statement><copyright-year>2021</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Рыковская О.А., Полева М.В., Чемисова О.С., Трухачев А.Л.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Rykovskaya O.A., Poleeva M.V., Chemisova O.S., Trukhachev A.L.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/346">https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/346</self-uri><abstract><p>Бактерии V. parahaemolyticus - галофильные микроорганизмы, которые могут быть причиной возникновения острого кишечного заболевания у людей, протекающего по типу пищевой токси-коинфекции. Успех лечебно-профилактических и санитарно-эпидемиологических мероприятий, направленных на предотвращение распространения «галофилезов» во многом зависит от своевременной точной идентификации штаммов вибрионов, выделяемых от больных, из морепродуктов и при мониторинге объектов окружающей среды. В данной работе представлен способ идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом ПЦР в режиме реального времени (Real-Time PCR), который включает выделение хромосомной ДНК из исследуемого материала, постановку ПНР со сконструированными нами праймерами, специфичными к участку гена коллагеназы vppC, и зондом, позволяющим детектировать амплифицированный фрагмент и проводить учет полученных результатов в режиме реального времени.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Bacteria of the species V. parahaemolyticus are halophilic microorganisms that may be causing acute enteric disease in humans, occurring according to the type of foodborne illness. The success of the treatment-and-nrophylactic and sanitary-epidemiological measures aimed at the prevention of the proliferation of «halophiles» largely depends on timely and accurate identification of strains of Vibrio secreted from patients, seafood, as well as in monitoring of environmental objects. This paper presents a method of identifying strains of the species V. parahaemolyticus by PCR in «real time» (Real-Time PCR), which enables the selection of chromosomal DNA from the test material, the PCR with the designed by us primers specific to the portion of a gene collagenase vppC and the probe, allowing to detect amplificatory the fragment and to incorporate the results in real-time.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>парагемолитические вибрионы</kwd><kwd>металлопротеаза (коллагеназа)</kwd><kwd>ПЦР в режиме реального времени</kwd><kwd>Vibrio parahaemolyticus</kwd><kwd>metalloprotease (collagenase)</kwd><kwd>Real-time PCR</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемоли-тическими и другими патогенными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. 26 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемоли-тическими и другими патогенными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. 26 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09 М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. 51 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09 М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. 51 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. и др. ПЦР в реальном времени. М: Бином. Лаборатория знаний, 2009. 223 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. и др. ПЦР в реальном времени. М: Бином. Лаборатория знаний, 2009. 223 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Рыковская О.А., Чемисова О.С., Смоликова Л.М. и др. Дифференциация представителей Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus // Клиническая лабораторная диагностика. 2014. Т. 59. № 12. С. 50-55.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Рыковская О.А., Чемисова О.С., Смоликова Л.М. и др. Дифференциация представителей Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus // Клиническая лабораторная диагностика. 2014. Т. 59. № 12. С. 50-55.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Чемисова О.С., Телесманич Н.Р., Рыковская О.А. и др. Масс-спектрометрический анализ как метод идентификации и внутривидовой дифференциации Vibrio parahaemolyticus // Холера и патогенные для человека вибрионы: Материалы проблемной комиссии. Ростов-на-Дону. 2013. Вып. 26. С. 153-157.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Чемисова О.С., Телесманич Н.Р., Рыковская О.А. и др. Масс-спектрометрический анализ как метод идентификации и внутривидовой дифференциации Vibrio parahaemolyticus // Холера и патогенные для человека вибрионы: Материалы проблемной комиссии. Ростов-на-Дону. 2013. Вып. 26. С. 153-157.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Chakraborty R. et al. Species-specific identification of Vibrio fluvialis by PCR taigeted to the conserved transcriptional activation and variable membrane tether regions of the toxRgene / R. Chakraborty, S. Sinha, A.K. Muk-hopadhyay [et al.] // J. Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. pp. 805-808.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Chakraborty R. et al. Species-specific identification of Vibrio fluvialis by PCR taigeted to the conserved transcriptional activation and variable membrane tether regions of the toxRgene / R. Chakraborty, S. Sinha, A.K. Muk-hopadhyay [et al.] // J. Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. pp. 805-808.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Di Pinto A. et al. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus/ A Di Pinto, G. Ciccarese, G. Tantillo // J. of Food Protection. 2005. Vol. 68. № 1. pp. 150-153.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Di Pinto A. et al. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus/ A Di Pinto, G. Ciccarese, G. Tantillo // J. of Food Protection. 2005. Vol. 68. № 1. pp. 150-153.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Khamesipour F. et al. Detection of Vibrio spp. in shrimp from aquaculture sites in Iran using polymerase chain reaction (PCR) / F. Khamesipour, E. Noshadi, M. Moradi [et al.] // J. AACL Bioflux. 2014. Vol. 7. № 1. pp. 1-7.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Khamesipour F. et al. Detection of Vibrio spp. in shrimp from aquaculture sites in Iran using polymerase chain reaction (PCR) / F. Khamesipour, E. Noshadi, M. Moradi [et al.] // J. AACL Bioflux. 2014. Vol. 7. № 1. pp. 1-7.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Panicker G. et al. Red-time PCR detection of Vibrio vulnificus in oysters: comparison of oligonucleotide primers and probes taigeting whA / G. Panicked A.K. Bej HI Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71. № 10. pp. 5702-5709.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Panicker G. et al. Red-time PCR detection of Vibrio vulnificus in oysters: comparison of oligonucleotide primers and probes taigeting whA / G. Panicked A.K. Bej HI Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71. № 10. pp. 5702-5709.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Reham A.A. et al. Specific Detection of Pathogenic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction / A.A. Reham., M.S. Amani // J. Global Veterinaria. 2012. Vol. 8. № 5. pp. 525-531.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Reham A.A. et al. Specific Detection of Pathogenic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction / A.A. Reham., M.S. Amani // J. Global Veterinaria. 2012. Vol. 8. № 5. pp. 525-531.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
