Асланов Батырбек Исмелович - д.м.н., заведующий кафедрой эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии; заведующий НИЛмолекулярной эпидемиологии и исследований бактериофагов
г. Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, 191015
Batyrbek I. Aslanov, Dr. Sci. (Med.), Head of the Department of Epidemiology, Parasitology and Disinfection; Head of the Laboratory of Molecular Epidemiology and Bacteriophage Research
41 Kirochnaya Street, Saint Petersburg, 191015
Гончаров Артемий Евгеньевич - д.м.н., заведующий лабораторией функциональной геномики и протеомики микроорганизмов
г. Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, 191015; ул. Академика Павлова, д. 12, Санкт-Петербург, 197022
Artemiy E. Goncharov, Dr. Sci. (Med.), Head of the Laboratory of Functional Genomics and Proteomics of Microorganisms; Department of Epidemiology, Parasitology and Disinfection
41 Kirochnaya Street, Saint Petersburg, 191015; 12 Academician Pavlov Street, Saint Petersburg, 197022
Азаров Даниил Валерьевич - к.м.н., с.н.с. НИЛ молекулярной эпидемиологии и исследований бактериофагов; , н.с. лабораториифункциональной геномики и протеомики микроорганизмов
г. Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, 191015; ул. Академика Павлова, д. 12, Санкт-Петербург, 197022
Daniil V. Azarov, Cand. Sci. (Med.), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Epidemiology and Bacteriophage Research; Researcher, Laboratory of Functional Genomics and Proteomics of Microorganisms
41 Kirochnaya Street, Saint Petersburg, 191015; 12 Academician Pavlov Street, Saint Petersburg, 197022
Трофимова Анна Николаевна - заместитель начальника экспедиционного отряда по научной работе экспедиции «Арктический плавучий университет»
набережная Северной Двины, д. 17, г. Архангельск, 163002
Anna N. Trofimova, Deputy Head of the Research Expedition Team at the “Arctic Floating University” expedition
17 Severnaya Dvina Embankment, Arkhangelsk, 163002
Аксенов Андрей Сергеевич - к.т.н., профессор кафедры биологии, экологии и биотехнологии, зав. сектором лаборатории арктического биомониторинга
набережная Северной Двины, д. 17, г. Архангельск, 163002
Andrey S. Aksenov, Cand. Sci. (Tech.), Professor, Department of Biology, Ecology and Biotechnology, Head of the Sector of the Laboratory of Arctic Biomonitoring
17 Severnaya Dvina Embankment, Arkhangelsk, 163002
Мизин Иван Андреевич - к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории биоресурсов и этнографии
просп. Никольский, д. 20, г. Архангельск, 163020
Ivan A. Mizin, Cand. Sci. (Biol.), Senior Researcher, Laboratory of Bioresources and Ethnography
20 Nikolsky Avenue, Arkhangelsk, 163020
Колоджиева Виктория Васильевна - к.м.н., доцент кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии
г. Санкт-Петербург, ул. Кирочная, д. 41, 191015
Viktoria V. Kolodzhieva, Cand. Sci. (Med.), Associate Professor, Department of Epidemiology, Parasitology and Disinfection
41 Kirochnaya Street, Saint Petersburg, 191015
Кушниренко Дарья Александровна - лаборант лаборатории инновационных методов микробиологического мониторинга научно-образовательного центра научного центра мирового уровня Центр персонализированной медицины
ул. Академика Павлова, д. 12, Санкт-Петербург, 197022,
Daria A. Kushnirenko, Laboratory Assistant, Laboratory of Innovative Methods of Microbiological Monitoring, World-Class Research Center “Center for Personalized Medicine”
12 Academician Pavlov Street, Saint Petersburg, 197022
Краева Людмила Александровна - д.м.н., заведующая лабораторией медицинской бактериологии
Санкт-Петербург, ул. Мира, д. 14, 197101
Lyudmila A. Kraeva, Dr. Sci. (Med.), Head of the Laboratory of Medical Bacteriology
12 Academician Pavlov Street, Saint Petersburg, 197022
Панин Александр Леонидович - к.м.н., главный специалист по медицинской логистике Логистического центра Российскойантарктической экспедиции
ул. Беринга, д. 38, 199397, г. Санкт-Петербург
Alexander L. Panin, Cand. Sci. (Med.), Chief Specialist for Medical Support for Expeditions
38 Bering Street, Saint Petersburg, 199397
Крыленков Вячеслав Александрович - д.б.н., руководитель центра мониторинга полярных регионов
Университетская наб., д. 5, г. Санкт-Петербург, 199034
Viacheslav A. Krylenkov, Dr. Sci. (Biol.), Head of the Polar Regions Monitoring сenter
5 Universitetskaya Embankment, Saint Petersburg, 199034
Введение. Арктические экосистемы являются важнейшим объектом микробиологического мониторинга, позволяющего отслеживать динамично меняющуюся природную среду на фоне климатических изменений и промышленного освоения северных территорий.
Цель исследования заключалась в оценке эпидемического потенциала условно-патогенных бактерий, ассоциированных с животными арктических островов Баренцева и Карского морей.
Материалы и методы. В работе охарактеризованы четыре штамма грамотрицательных условно-патогенных бактерий (Serratia fonticola, Aeromonas salmonicida, Yersinia kristensenii, Yersinia rochesterensis), выделенные в 2021–2022 гг. при микробиологических исследованиях 46 образцов зоогенного биологического материала из природных экосистем острова Вайгач, архипелагов Новая Земля и Земля Франца-Иосифа. Геномы выделенных штаммов микроорганизмов были секвенированы с использованием технологии Illumina MiSeq и после сборки de novo при помощи геномного ассемблера SPAdes 13.0 аннотированы с использованием приложения RAST.
Результаты. Продемонстрировано, что изученные штаммы располагают рядом факторов вирулентности и генами устойчивости к антибиотикам, что позволяет рассматривать их в качестве потенциальных патогенов. В составе геномов всех изученных бактерий обнаруживаются бета-лактамазы классов A, B, C, из числа факторов патогенности – типичны опероны сидерофоров и систем секреции IV типа. Кроме того, в геномах иерсиний идентифицируется также ген энтеротоксина ytxA коклюшного типа.
Выводы. Результаты исследования свидетельствуют о возможности формирования природных очагов возбудителей актуальных инфекций на островах высокоширотной Арктики, имеющих перспективы развития туризма, хозяйственного освоения.
Introduction: Arctic ecosystems are the most important object of microbiological surveillance that helps monitor a rapidly changing natural environment affected by climate change and industrial development of the northern territories.
Objective: To assess the epidemic potential of opportunistic bacteria associated with animals from the Arctic islands of the Barents and Kara Seas.
Materials and methods: We have studied four strains of gram-negative opportunistic bacteria (Serratia fonticola, Aeromonas salmonicida, Yersinia kristensenii, and Yersinia rochesterensis) isolated in 2021–2022 during microbiological testing of 46 samples of zoogenic biologic materials from the natural ecosystems of Vaigach Island, Novaya Zemlya and Franz Josef Land archipelagos. Genomes of the isolated microbial strains were sequenced using the Illumina MiSeq sequencing system and, after de novo assembly using the SPAdes 13.0 genomic assembler, annotated with RAST (Rapid Annotation using Subsystem Technology).
Results: The strains were shown to possess a number of virulence factors and antibiotic resistance genes, which allows them to be considered as potential pathogens. Classes A, B, and C beta-lactamases were found in the genomes of all the bacteria under study, and operons for siderophores and type IV secretion systems were typical of virulence factors. In addition, the pertussis-like YtxA enterotoxin was identified in Yersinia genomes.
Conclusion: Our findings indicate the possibility of emergence of natural foci of notifiable infections on the islands in the high-latitude Arctic promising in terms of tourism development and economic growth.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.