<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">sredob</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Public Health and Life Environment – PH&amp;LE</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2219-5238</issn><issn pub-type="epub">2619-0788</issn><publisher><publisher-name>ФБУЗ ФЦГиЭ Роспотребнадзора</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.35627/2219-5238/2023-31-11-82-93</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">sredob-1821</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>ЭПИДЕМИОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>EPIDEMIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Retrospective Analysis of the Cholera Situation in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson Regions</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-2567-9032</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Попова</surname><given-names>А. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Popova</surname><given-names>A. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Попова Анна Юрьевна – д.м.н., проф., заслуженный врач РФ, руководитель; заведующий кафедрой организации санитарно-эпидемиологической службы</p><p>Вадковский пер., д. 18, г. Москва, 127994</p><p>ул. Баррикадная, д. 2/1, г. Москва, 125993</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Anna Yu. Popova, Dr. Sci. (Med.), Prof., Honored Doctor of the Russian Federation, Head; Head of the Department of Organization of Sanitary and Epidemiological Service</p></bio><email xlink:type="simple">depart@gsen.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0550-2221</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Носков</surname><given-names>А. К.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Noskov</surname><given-names>A. K.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Носков Алексей Кимович – к.м.н., директор</p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Aleksey K. Noskov, Cand. Sci. (Med.), Director</p></bio><email xlink:type="simple">noskov-epid@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8701-280X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ежлова</surname><given-names>Е. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Ezhlova</surname><given-names>E. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Ежлова Елена Борисовна – к.м.н., заместитель руководителя</p><p>Вадковский пер., д. 18, г. Москва, 127994</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena B. Ezhlova, Cand. Sci. (Med.), Deputy Head</p></bio><email xlink:type="simple">depart@gsen.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-3"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6540-2778</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кругликов</surname><given-names>В. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kruglikov</surname><given-names>V. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Кругликов Владимир Дмитриевич – д.м.н., главный научный сотрудник отдела микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций</p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Vladimir D. Kruglikov, Dr. Sci. (Med.), Chief Researcher, Department of Microbiology of Cholera and Other Acute Intestinal Infections</p></bio><email xlink:type="simple">kruglikov_vd@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-8481-6442</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Миронова</surname><given-names>Л. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Mironova</surname><given-names>L. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Миронова Лилия Валерьевна – д.м.н., заместитель директора по научной и лабораторно-диагностической работе</p><p>ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Liliya V. Mironova, Dr. Sci. (Med.), Deputy Director on Scientific and Laboratory Diagnostic Work</p></bio><email xlink:type="simple">mironova-lv@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9216-7777</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Монахова</surname><given-names>Е. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Monakhova</surname><given-names>E. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Монахова Елена Владимировна – д.б.н., главный научный сотрудник лаборатории микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций </p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Elena V. Monakhova, Dr. Sci. (Biol.), Chief Researcher, Department of Microbiology of Cholera and Other Acute Intestinal Infections</p></bio><email xlink:type="simple">monakhova_ev@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4059-2878</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Чемисова</surname><given-names>О. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Chemisova</surname><given-names>O. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Чемисова Ольга Сергеевна – к. биол. н., ведущий научный сотрудник, врио заместителя директора по научной и экспериментальной работе</p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Olga S. Chemisova, Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher, Acting Deputy Director for Scientific and Experimental Work</p></bio><email xlink:type="simple">chemisova_os@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9996-4189</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Подойницына</surname><given-names>О. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Podoynitsina</surname><given-names>O. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Подойницына Оксана Андреевна – к.б.н., старший научный сотрудник отдела микробиологии холеры и других острых кишечных инфекций </p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Oksana A. Podoynitsina, Cand. Sci. (Biol.), Senior Researcher, Department of Microbiology of Cholera and Other Acute Intestinal Infections</p></bio><email xlink:type="simple">oksankashalu@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5388-4300</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Хунхеева</surname><given-names>Ж. Ю.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Khunkheeva</surname><given-names>Zh. Yu.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Хунхеева Жанна Юрьевна – врач-бактериолог лаборатории холеры</p><p>ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Zhanna Yu. Khunkheeva, bacteriologist, Cholera Laboratory</p></bio><email xlink:type="simple">khunkheeva2015@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-9056-3231</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Водопьянов</surname><given-names>А. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Vodopyanov</surname><given-names>A. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Водопьянов Алексей Сергеевич – к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии природно-очаговых и зоонозных инфекций</p><p>ул. М. Горького, д. 117/40, г. Ростов-на-Дону, 344002</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Alexey S. Vodopyanov, Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher, Laboratory of Molecular Biology of Naturally Occurring and Zoonotic Infections</p></bio><email xlink:type="simple">vodopyanov_as@antiplague.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-2"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4764-6330</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Галачьянц</surname><given-names>Ю. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Galachyants</surname><given-names>Yu. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Галачьянц Юрий Павлович – к.б.н., научный сотрудник отдела научного и учебно-методического обеспечения</p><p>ул. Трилиссера, д. 78, г. Иркутск, 664047</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Yuri P. Galachyants, Cand. Sci. (Biol.), Researcher, Department of Scientific and Educational Support</p></bio><email xlink:type="simple">yuragal@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff-4"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-2"><institution>ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-3"><institution>Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека</institution><country>Russian Federation</country></aff><aff xml:lang="ru" id="aff-4"><institution>ФКУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>12</day><month>12</month><year>2023</year></pub-date><volume>31</volume><issue>11</issue><fpage>82</fpage><lpage>93</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Миронова Л.В., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Подойницына О.А., Хунхеева Ж.Ю., Водопьянов А.С., Галачьянц Ю.П., 2023</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Миронова Л.В., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Подойницына О.А., Хунхеева Ж.Ю., Водопьянов А.С., Галачьянц Ю.П.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Popova A.Y., Noskov A.K., Ezhlova E.B., Kruglikov V.D., Mironova L.V., Monakhova E.V., Chemisova O.S., Podoynitsina O.A., Khunkheeva Z.Y., Vodopyanov A.S., Galachyants Y.P.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/1821">https://zniso.fcgie.ru/jour/article/view/1821</self-uri><abstract><sec><title>Введение</title><p>Введение. В обзоре приведены данные ретроспективного анализа заболеваемости холерой и распространенности холерного вибриона в объектах окружающей среды на территориях Донбасского региона, Запорожской и Херсонской областей.</p></sec><sec><title>Цель исследования</title><p>Цель исследования: ретроспективный анализ эпидемиологической ситуации по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях и на пограничных территориях в период седьмой пандемии и оценка рисков завоза и распространения инфекции.</p></sec><sec><title>Материалы и методы</title><p>Материалы и методы. Источники информации – публикации в рецензируемых журналах и данные Референсцентра по мониторингу за холерой за период с 1970 по 2023 г. В SNP-анализе использованы полногеномные сиквенсы ДНК штаммов Vibrio cholerae О1, международных баз данных нуклеотидных последовательностей ДНК – NCBI и ENA, алгоритмы UPGMA и ML, авторское программное обеспечение, MEGA 5.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. Установлено, что на территориях Донбасского региона (Донецкой и Луганской Народных Республиках, бывших Донецкой и Луганской областей), Запорожской и Херсонской областей имели место осложнения эпидемической ситуации по холере, связанные с завозом инфекции из эндемичных стран и распространением водным и пищевым путями. Пики заболеваемости холерой отмечались в 1970-х и в 1990-х гг. (последняя вспышка – 2011 г.). С 1989 по 2022 г. из водных объектов Донецкой Народной Республики (бывшая Донецкая область) изолировано 490 штаммов V. cholerae О1 (51 токсигенный), в Луганской Народной Республике (бывшая Луганская область) – 8 (2); в Запорожской области – 183 (6), в Херсонской области – 66 (51). Токсигенные штаммы представляли гетерогенную группу вследствие многократных завозов возбудителя. Выявлено сходство генотипов штаммов V. cholerae из воды на отдельных территориях в течение нескольких лет, что свидетельствует о наличии климатических и социальных условий для сохранения и формирования локальных популяций холерного вибриона.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Современная эпидемиологическая ситуация по холере в Донбасском регионе, Запорожской и Херсонской областях стабильная. В связи с чрезвычайной ситуацией и с состоянием инфраструктуры сохраняются высокие риски завоза холеры с эндемичных и с сопредельных территорий и распространения инфекции водным путем. Это свидетельствует о необходимости проведения на данных территориях системного мониторинга за холерой в максимальном объеме мероприятий, предусмотренном для территорий I типа по эпидемическим проявлениям холеры.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><sec><title>Introduction</title><p>Introduction: The review presents the results of a retrospective analysis of the incidence of cholera and the prevalence of Vibrio cholerae in environmental media on the territory of the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson Regions.</p></sec><sec><title>Objective</title><p>Objective: To do a retrospective analysis of the cholera epidemiological situation in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson regions, and border areas during the seventh pandemic and to assess risks of importation and spread of the disease.</p></sec><sec><title>Materials and methods</title><p>Materials and methods: We examined topical articles published in peer-reviewed journals and data of the Reference Center for Cholera Monitoring for 1970–2023. The SNP analysis used whole genome sequences of V. cholerae O1 strains, NCBI and ENA databases, UPGMA and ML algorithms, author’s software, and MEGA 5.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results: We established historic cholera outbreaks in the Donbass Region (Donetsk and Lugansk People’s Republics, former Donetsk and Lugansk regions), Zaporozhye and Kherson regions caused by the infection imported from endemic countries and its spread by water and food. The highest cholera incidence rates were registered in the 1970s and 1990s; the most recent outbreak was documented in the year 2011. In 1989–2022, 490 V. cholerae O1 strains, including 51 toxigenic ones, were isolated from water bodies in the Donetsk People’s Republic (the former Donetsk Region), 8 strains (2) in the Lugansk People’s Republic (the former Lugansk Region), 183 (6) in Zaporozhye, and 66 (51) in the Kherson Region. Toxigenic strains represented a heterogeneous group due to multiple imports of the pathogen. We revealed similarity of genotypes of V. cholerae strains isolated from environmental media in certain areas over several years, which indicates the presence of climatic and social conditions for preservation and development of local populations of cholera vibrios.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion: The current cholera situation in the Donbass Region, Zaporozhye and Kherson regions is stable. Due to the present-day emergency and infrastructure conditions, high risks of cholera importation from endemic and adjacent territories and spread of this infectious disease through water persist, thus necessitating regular and systematic monitoring of cholera in these regions and strict implementation of all measures envisaged for type I territories in terms of epidemic manifestations of cholera.</p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>холера</kwd><kwd>эпидемиологическая ситуация</kwd><kwd>эпидемиологические риски</kwd><kwd>проактивный надзор</kwd><kwd>заболеваемость</kwd><kwd>мониторинг</kwd><kwd>поверхностные водоемы</kwd><kwd>Vibrio cholerae</kwd><kwd>биоинформационный анализ</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>cholera</kwd><kwd>epidemiological situation</kwd><kwd>health risks</kwd><kwd>proactive supervision</kwd><kwd>incidence</kwd><kwd>monitoring</kwd><kwd>surface water bodies</kwd><kwd>Vibrio cholerae</kwd><kwd>bioinformatics analysis</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Носков А.К., Кругликов В.Д., Москвитина Э.А. и др. Холера: анализ и оценка эпидемиологической обстановки в мире и России. Прогноз на 2023 год // Проблемы особо опасных инфекций. 2023. № 1. С. 56–66 (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2023-1-56-66</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Noskov AK, Kruglikov VD, Moskvitina EA, et al. Cholera: Analysis and assessment of epidemiological situation in the world and in Russia (2013–2022). Forecast for 2023. Problemy Osobo Opasnykh Infektsiy. 2023;(1):56-66. (In Russ.) doi: 10.21055/0370-1069-2023-1-56-66</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Онищенко Г.Г., Ломов Ю.М., Москвитина Э.А. и др. Холера, обусловленная Vibrio cholerae O1 ctxAB–tcpA+ // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2007. № 1. С. 23–29.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Onishchenko GG, Lomov YuM, Moskvitina EA, et al. Cholera caused by Vibrio cholerae O1 ctxABtcpA+. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2007;(1):23-29. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Lizárraga-Partida ML, Quilici ML. Molecular analyses of Vibrio cholerae O1 clinical strains, including new nontoxigenic variants isolated in Mexico during the Cholera epidemic years between 1991 and 2000. J Clin Microbiol. 2009;47(5):1364-1371. doi: 10.1128/JCM.00720-08</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Lizárraga-Partida ML, Quilici ML. Molecular analyses of Vibrio cholerae O1 clinical strains, including new nontoxigenic variants isolated in Mexico during the Cholera epidemic years between 1991 and 2000. J Clin Microbiol. 2009;47(5):1364-1371. doi: 10.1128/JCM.00720-08</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Islam A, Labbate M, Djordjevic SP, et al. Indigenous Vibrio cholerae strains from a non-endemic region are pathogenic. Open Biol. 2013;3(2):120181. doi: 10.1098/rsob.120181</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Islam A, Labbate M, Djordjevic SP, et al. Indigenous Vibrio cholerae strains from a non-endemic region are pathogenic. Open Biol. 2013;3(2):120181. doi: 10.1098/rsob.120181</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Титова С.В., Монахова Е.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-корегулируемых пилей адгезии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016. № 5. С. 65–72.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Titova SV, Monakhova EV. Potential danger of nontoxigenic Vibrio cholerae strains containing genes for toxin-coregulated pili adhesion. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. Aktual’nye Voprosy. 2016;(5):65-72. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Wang H, Yang C, Sun Z, et al. Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages. PLoS Negl Trop Dis. 2020;14(2):e0008046. doi: 10.1371/journal.pntd.0008046</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Wang H, Yang C, Sun Z, et al. Genomic epidemiology of Vibrio cholerae reveals the regional and global spread of two epidemic non-toxigenic lineages. PLoS Negl Trop Dis. 2020;14(2):e0008046. doi: 10.1371/journal.pntd.0008046</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Bankevich A, Nurk S, Antipov D, et al. SPAdes: A new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol. 2012;19(5):455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Bankevich A, Nurk S, Antipov D, et al. SPAdes: A new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol. 2012;19(5):455-477. doi: 10.1089/cmb.2012.0021</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О. и др. Молекулярная эпидемиология Vibrio cholerae – разработка алгоритма анализа данных полногеномного секвенирования // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2016. Т. 21. № 3. С. 146–152.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Vodop’yanov AS, Pisanov RV, Vodop’yanov SO, et al. Molecular epidemiology of Vibrio cholerae – development of the algorithm for data analysis of whole genome sequencing. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. 2016;21(3):146-152. (In Russ.) doi: 10.17816/EID40917</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011;28(10):2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol. 2011;28(10):2731-2739. doi: 10.1093/molbev/msr121</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Yan H, Pang B, Lu X, et al. Cholera caused by a new clone of serogroup O1 Vibrio cholerae – Beijing Municipality, China, June 2021. China CDC Wkly. 2022;4(2):31-32. doi: 10.46234/ccdcw2021.279</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Yan H, Pang B, Lu X, et al. Cholera caused by a new clone of serogroup O1 Vibrio cholerae – Beijing Municipality, China, June 2021. China CDC Wkly. 2022;4(2):31-32. doi: 10.46234/ccdcw2021.279</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Онищенко Г.Г., Попова А.Ю., Москвитина Э.А. и др. Определение типов эпидемических проявлений холеры в субъектах Крымского федерального округа (Республики Крым) // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 6. С. 37–43.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Onischenko GG, Popova AYu, Moskvitina EA, et al. Determination of types of epidemic manifestations of cholera in regions of the Crimea Federal District (Republic of Crimea). Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2015;(6):37-43. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Clark CG, Kravetz AN, Alekseenko VV, Krendelev YuD, Johnson WM. Microbiological and epidemiological investigation of cholera epidemic in Ukraine during 1994 and 1995. Epidemiol Infect. 1998;121(1):1–13. doi: 10.1017/s0950268898008711</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Clark CG, Kravetz AN, Alekseenko VV, Krendelev YuD, Johnson WM. Microbiological and epidemiological investigation of cholera epidemic in Ukraine during 1994 and 1995. Epidemiol. Infect. 1998;121(1):1–13. doi: 10.1017/s0950268898008711</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Clark CG, Kravetz AN, Dendy C, Wang G, Tyler KD, Johnson WM. Investigation of the 1994-5 Ukrainian Vibrio cholerae epidemic using molecular methods. Epidemiol Infect. 1998;121(1):15-29. doi: 10.1017/s0950268898008814</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Clark CG, Kravetz AN, Dendy C, Wang G, Tyler KD, Johnson WM. Investigation of the 1994-5 Ukrainian Vibrio cholerae epidemic using molecular methods. Epidemiol Infect. 1998;121(1):15-29. doi: 10.1017/s0950268898008814</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Монахова Е.В., Смоликова Л.М., Божко Н.В. ПЦР-детекция генов системы секреции третьего типа (TTSS) и других факторов патогенности/персистенции у холерных вибрионов различных серогрупп // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. № 6. С. 20–25. doi: 10.17816/EID40460</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Monakhova EV, Smolikova LM, Bozhko NV. PCR detection of the type III secretion system (TTSS) genes and other pathogenicity/persistence factors in Vibrio cholerae of different serogroups. Epidemiologiya i Infektsionnye Bolezni. 2010;15(6):20-25. (In Russ.) doi: 10.17816/EID40460</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Алексеенко В.В. Проблема холери в Украiнi // Інфекційні хвороби. 2008. № 4. С. 5–12.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Alekseyenko VV. [Problem of cholera in Ukraine.] Infektsiyni Khvorobi. 2008;(4):5-12. (In Ukrainian.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Савельева И.В., Тихонов С.Н., Савельев В.Н. и др. Ретроспективный анализ биологических и молекулярногенетических свойств штаммов возбудителя холеры, выделенных в Украине в 1994–2011 гг. // Журнал. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017. Т. 94. № 1. С. 49–55. doi: 10.36233/0372-9311-2017-1-49-55</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Savelieva IV, Tikhonov SN, Saveliev VN, et al. Retrospective analysis of biological and molecular-genetic properties of strains – causative agents of cholera – isolated in Ukraine in 1994–2011. Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. 2017;(1):49-55. (In Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-2017-1-49-55</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Домашенко О.Н., Беломеря Т.А., Мартынова Н.В. и др. Холера в Приазовье // Журнал инфектологии. 2015. Т. 7. № 2. С. 92–97.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Domashenko ON, Belomerya TA, Martynova NV, et al. Cholera in Azov area. Zhurnal Infektologii. 2015;7(2):9297. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Беломеря Т.А., Дараган Г.Н., Денисенко В.И. и др. Организация противоэпидемических мероприятий по локализации очага холеры в Донецкой области // Медицинский вестник Юга России. 2014. №2. С. 118–122.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belomerya TA, Daragan GN, Denisenko VI, et al. Organization of epidemic control activities by localization of cholera in the Donetsk region. Meditsinskiy Vestnik Yuga Rossii. 2014;(2):118-122. (In Russ.)</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kuleshov KV, Kostikova A, Pisarenko SV, et al. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infect Genet Evol. 2016;44:471–478. doi: 10.1016/j.meegid.2016.07.039</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kuleshov KV, Kostikova A, Pisarenko SV, et al. Comparative genomic analysis of two isolates of Vibrio cholerae O1 Ogawa El Tor isolated during outbreak in Mariupol in 2011. Infect Genet Evol. 2016;44:471-478. doi: 10.1016/j.meegid.2016.07.039</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Smirnova NI, Krasnov YM, Agafonova EY, Shchelkanova EY, Alkhova ZV, Kutyrev VV. Whole-genome sequencing of Vibrio cholerae O1 El Tor strains isolated in Ukraine (2011) and Russia (2014). Genome Announc. 2017;5(8):e0164016. doi: 10.1128/genomeA.01640-16</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Smirnova NI, Krasnov YM, Agafonova EY, Shchelkanova EY, Alkhova ZV, Kutyrev VV. Whole-genome sequencing of Vibrio cholerae O1 El Tor strains isolated in Ukraine (2011) and Russia (2014). Genome Announc. 2017;5(8):e0164016. doi: 10.1128/genomeA.01640-16</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit21"><label>21</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Monakhova EV, Ghosh A, Mutreja A, Weill F-X, Ramamurthy T. Endemic cholera in India and imported cholera in Russia: What is Common? Problemy Osobo Opasnykh Infektsiy. 2020;(3):17–26 (In Engl.). doi: 10.21055/03701069-2020-3-17-26</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Monakhova EV, Ghosh A, Mutreja A, Weill FX, Ramamurthy T. Endemic cholera in India and imported cholera in Russia: What is common? Problemy Osobo Opasnykh Infektsiy. 2020;(3):17-26. doi: 10.21055/0370-1069-20203-17-26</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit22"><label>22</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Смирнова Н.И., Рыбальченко Д.А., Плеханов Н.А., Лозовский Ю.В., Федоров А.В., Кутырев В.В. Новые генетические варианты возбудителя холеры и их распространение в эндемичных странах и России. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т. 41. № 1. С. 10–17. doi:10.17116/molgen20234101110.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Smirnova NI, Rybal’chenko DA, Plekhanov NA, Lozovsky YuV, Fedorov AV, Kutyrev VV. New genetic variants of cholera agent and their distribution in epidemic countries and Russia. Molekulyarnaya Genetika, Mikrobiologiya i Virusologiya. 2023;41(1):10-17. (In Russ.) doi: 10.17116/molgen20234101110</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit23"><label>23</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mutreja A, Kim DW, Thomson NR, et al. Evidence for several waves of global transmission in the seventh cholera pandemic. Nature. 2011;477(7365):462-465. doi: 10.1038/nature10392</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mutreja A, Kim DW, Thomson NR, et al. Evidence for several waves of global transmission in the seventh cholera pandemic. Nature. 2011;477(7365):462-465. doi: 10.1038/nature10392</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit24"><label>24</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hu D, Liu B, Feng L, et al. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc Natl Acad Sci USA. 2016;113(48):E7730-E7739. doi: 10.1073/pnas.1608732113</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hu D, Liu B, Feng L, et al. Origins of the current seventh cholera pandemic. Proc Natl Acad Sci USA. 2016;113(48):E7730-E7739. doi: 10.1073/pnas.1608732113</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit25"><label>25</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Luo Y, Octavia S, Jin D, et al. US gulf-like toxigenic O1 Vibrio cholerae causing sporadic cholera outbreaks in China. J Infect. 2016;72(5):564-572. doi: 10.1016/j.jinf.2016.02.005</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Luo Y, Octavia S, Jin D, et al. US gulf-like toxigenic O1 Vibrio cholerae causing sporadic cholera outbreaks in China. J Infect. 2016;72(5):564-572. doi: 10.1016/j.jinf.2016.02.005</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
