Смирнова Светлана Сергеевна – кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник, руководитель Урало-Сибирского научно-методического центра по профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, ФБУН ФНИИВИ «Виром» Роспотребнадзораж, доцент кафедры эпидемиологии, социальной гигиены и организации госсанэпидслужбы ФГБОУ ВО «Уральский государственный медицинский университет»
ул. Летняя, д. 23, г. Екатеринбург, 620030; ул. Репина, д. 3, г. Екатеринбург, 620028
Svetlana S. Smirnova, Cand. Sci. (Med.), Leading Researcher, Head of the Ural-Siberian Research and Methodology Center for Prevention of Healthcare-Associated Infections, Federal Research Institute of Viral Infections “Virome”; Assoc. Prof., Department of Epidemiology, Social Hygiene and Organization of Sanitary and Epidemiological Service, Ural State Medical University
23 Letnyaya Street, Yekaterinburg, 620030; 3 Repin Street, Yekaterinburg, 620028
Жуйков Николай Николаевич – научный сотрудник Урало-Сибирского научно-методического центра по профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи
ул. Летняя, д. 23, г. Екатеринбург, 620030
Nikolai N. Zhuikov, Researcher, Ural-Siberian Research and Methodology Center for Prevention of Healthcare-Associated Infections
23 Letnyaya Street, Yekaterinburg, 620030
Егоров Иван Андреевич – младший научный сотрудник Урало-Сибирского научно-методического центра по профилактике инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи
ул. Летняя, д. 23, г. Екатеринбург, 620030
Ivan A. Egorov, Junior Researcher, Ural-Siberian Research and Methodology Center for Prevention of Healthcare-Associated Infections
23 Letnyaya Street, Yekaterinburg, 620030
Пушкарева Наталия Александровна – заведующая лабораторией контроля биологических факторов филиала
, ул. Мичурина, д. 91, г. Екатеринбург, 620075
Nataliya A. Pushkareva, Head of the Biology Laboratory
91 Michurin Street, Yekaterinburg, 620075
Семенов Александр Владимирович – доктор биологических наук, директор ФБУН ФНИИВИ «Виром» Роспотребнадзора; профессор кафедры экспериментальной биологии и биотехнологии Института естественных наук и математики Уральского федерального университета имени Первого президента России Б.Н. Ельцина
ул. Летняя, д. 23, г. Екатеринбург, 620030; , ул. Мира, д. 19, г. Екатеринбург, 620002
Aleksandr V. Semenov, Dr. Sci. (Biol.), Director, Federal Research Institute of Viral Infections “Virome”; Professor, Department of Experimental Biology and Biotechnology, Institute of Natural Sciences and Mathematics, Ural Federal University named after the First President of Russia B.N. Yeltsin
23 Letnyaya Street, Yekaterinburg, 620030; 19 Mira Street, Yekaterinburg, 620002
Введение. Одним их ключевых элементов системы эпидемиологического надзора за инфекционными заболеваниями является микробиологический мониторинг контаминации объектов окружающей среды и рук персонала. В условиях пандемии COVID-19 сложилась особая необходимость проведения вирусологических исследований смывов с объектов окружающей среды и средств индивидуальной защиты персонала в инфекционных госпиталях для больных COVID-19. Однако, согласно действующим нормативным документам, приоритет микробиологического мониторинга смещен в сторону определения и идентификации, прежде всего, патогенов бактериальной природы. Создается необходимость в разработке и внедрении современного метода, позволяющего проводить одномоментную оценку вирусно-бактериальной контаминации.
Цель исследования: провести сравнительный анализ методов отбора проб смывов с объектов внешней среды для оценки вирусно-бактериальной контаминации.
Материалы и методы. Отбор проб смывов проводили в соответствии с запатентованной авторами «Схемой отбора проб смывов с объектов внешней среды для одновременной оценки вирусно-бактериальной контаминации» (патент на промышленный образец № 132971 от 05.09.2022). В исследовании применяли бактериологический, молекулярно-генетический и статистический методы.
Результаты. Исследованы 343 пробы смывов, из которых 68 были нестандартными (по 38 или 11,1 % содержали РНК SARS-CoV-2 и условно-патогенные микроорганизмы). Среди условно-патогенных микроорганизмов было идентифицировано 42 штамма бактерий, в том числе Enterococcus faecalis 16 штаммов (38,1 %), Klebsiella pneumoniaе 9 штаммов (21,4 %), Escherichia coli 7 штаммов (16,7 %), Enterococcus faecium 3 штамма (7,1 %), Staphylococcus aureus 3 штамма (7,1 %), Pseudomonas aeruginosa 2 штамма (4,9 %) и Pantoea agglomerans 2 штамма (4,9 %). Было выявлено 11 вариантов вирусно-бактериальных ассоциаций. Сопоставление результатов исследования смывов, отобранных исследуемым методом, с результатами отбора регламентированным методом указывало на существенное различие в доле нестандартных находок SARS-CoV-2 – в 11,1, условно-патогенной микрофлоры – 12,3 раза.
Выводы. Таким образом, исследуемый метод отбора смывов с объектов окружающей среды отвечает современным требованиям и обеспечивает возможность проведения объективной оценки уровня вирусно-бактериальной контаминации исследуемых объектов. Данный подход может быть применен при проведении лабораторных исследований в рамках государственного и производственного контроля в учреждениях различных профилей (медицинских, пищевых, детских и пр.).
Introduction: One of the key elements of the infectious disease surveillance system is microbiological monitoring of contamination of environmental objects and healthcare personnel hands. In the context of the COVID-19 pandemic, virology testing of swabs from hospital objects and personal protective equipment of workers of infectious disease hospitals for patients with COVID-19 has acquired special importance. According to the current regulatory documents, however, greater priority in microbiological monitoring is given to determination and identification of bacterial pathogens, thus necessitating the development and implementation of an advanced technique of a simultaneous assessment of viral and bacterial contamination.
Objective: To compare different environmental surface sampling techniques used to assess viral and bacterial contamination. Materials and methods: Samples for environmental swab testing were collected in accordance with the “Scheme for sampling environmental swabs for simultaneous assessment of viral and bacterial contamination” patented by the authors (Industrial Design Patent No. 132971 of September 5, 2022). We applied bacteriological, molecular genetic, and statistical methods in the study.
Results: Overall, 343 wipe samples were tested, of which 68 were atypical (two 38-swab portions, 11.1 % each, contained SARS-CoV-2 RNA and opportunistic microorganisms). Among the opportunistic microorganisms, 42 bacterial strains were identified, including 16 strains of Enterococcus faecalis (38.1 %), 9 strains of Klebsiella pneumoniae (21.4 %), 7 strains of Escherichia coli (16.7 %), 3 strains of Enterococcus faecium (7.1 %), 3 strains of Staphylococcus aureus (7.1 %), 2 strains of Pseudomonas aeruginosa (4.9 %), and 2 strains of Pantoea agglomerans (4.9 %). Eleven variants of viral and bacterial associations were identified. The comparison of environmental swabbing performed by the technique under study with that performed by the standard method, based on test results, indicated a significant 11.1 and 12.3-fold difference in the proportion of non-standard findings for SARS-CoV-2 and opportunistic microorganisms, respectively.
Conclusions: The study results prove that our technique of environmental swabbing meets all modern requirements and facilitates an objective assessment of the level of viral and bacterial contamination of the study objects. This approach can be used for laboratory testing within state and industrial control at institutions of various specialties (healthcare, food industry, childcare facilities, etc.).
The authors declare that there are no conflicts of interest present.